RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262067.4

TSPAN13-201, Transcript of tetraspanin 13, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TSPAN13, Length 2,093 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN13-201ENST00000262067 FCHO1O14526 889 aa24.11■■□□□ 1.45
TSPAN13-201ENST00000262067 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
TSPAN13-201ENST00000262067 TMEM240Q5SV17 173 aa24.11■■□□□ 1.45
TSPAN13-201ENST00000262067 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
TSPAN13-201ENST00000262067 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
TSPAN13-201ENST00000262067 EBF4Q9BQW3 602 aa24.11■■□□□ 1.45
TSPAN13-201ENST00000262067 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa24.11■■□□□ 1.45
TSPAN13-201ENST00000262067 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa24.11■■□□□ 1.45
TSPAN13-201ENST00000262067 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
TSPAN13-201ENST00000262067 GLP2RO95838 553 aa24.11■■□□□ 1.45
TSPAN13-201ENST00000262067 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP24.11■■□□□ 1.45
TSPAN13-201ENST00000262067 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
TSPAN13-201ENST00000262067 HECTD2Q5U5R9 776 aa24.11■■□□□ 1.45
TSPAN13-201ENST00000262067 PLPP4Q5VZY2 271 aa24.11■■□□□ 1.45
TSPAN13-201ENST00000262067 CYB5D1Q6P9G0 228 aa24.11■■□□□ 1.45
TSPAN13-201ENST00000262067 MFN1Q8IWA4 741 aa24.11■■□□□ 1.45
TSPAN13-201ENST00000262067 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa24.11■■□□□ 1.45
TSPAN13-201ENST00000262067 LPCAT1Q8NF37 534 aa24.11■■□□□ 1.45
TSPAN13-201ENST00000262067 MDGA1Q8NFP4 955 aa24.11■■□□□ 1.45
TSPAN13-201ENST00000262067 RAD9AQ99638 391 aa24.11■■□□□ 1.45
TSPAN13-201ENST00000262067 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
TSPAN13-201ENST00000262067 SLC46A2Q9BY10 475 aa24.11■■□□□ 1.45
TSPAN13-201ENST00000262067 NMUR2Q9GZQ4 415 aa24.11■■□□□ 1.45
TSPAN13-201ENST00000262067 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
TSPAN13-201ENST00000262067 XPR1Q9UBH6 696 aa24.11■■□□□ 1.45
TSPAN13-201ENST00000262067 CRTAMO95727 393 aa24.1■■□□□ 1.45
TSPAN13-201ENST00000262067 GLUD1P00367 558 aa24.1■■□□□ 1.45
TSPAN13-201ENST00000262067 MT-CO1P00395 513 aa24.1■■□□□ 1.45
TSPAN13-201ENST00000262067 CDC25CP30307 473 aa24.1■■□□□ 1.45
TSPAN13-201ENST00000262067 APCDD1Q8J025 514 aa24.1■■□□□ 1.45
TSPAN13-201ENST00000262067 HEXDCQ8WVB3 486 aa24.1■■□□□ 1.45
TSPAN13-201ENST00000262067 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
TSPAN13-201ENST00000262067 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
TSPAN13-201ENST00000262067 KLC4Q9NSK0 619 aa24.1■■□□□ 1.45
TSPAN13-201ENST00000262067 ARL8BQ9NVJ2 186 aa24.1■■□□□ 1.45
TSPAN13-201ENST00000262067 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa24.1■■□□□ 1.45
TSPAN13-201ENST00000262067 PLK2Q9NYY3 685 aa24.1■■□□□ 1.45
TSPAN13-201ENST00000262067 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
TSPAN13-201ENST00000262067 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa24.1■■□□□ 1.45
TSPAN13-201ENST00000262067 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
TSPAN13-201ENST00000262067 VWA7Q9Y334 891 aa24.1■■□□□ 1.45
TSPAN13-201ENST00000262067 IRAK3Q9Y616 596 aa24.1■■□□□ 1.45
TSPAN13-201ENST00000262067 BMPR1AP36894 532 aa24.09■■□□□ 1.45
TSPAN13-201ENST00000262067 TRAF2Q12933 501 aa24.09■■□□□ 1.45
TSPAN13-201ENST00000262067 SEMA3AQ14563 771 aa24.09■■□□□ 1.45
TSPAN13-201ENST00000262067 NCEH1Q6PIU2 408 aa24.09■■□□□ 1.45
TSPAN13-201ENST00000262067 GPR150Q8NGU9 434 aa24.09■■□□□ 1.45
TSPAN13-201ENST00000262067 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
TSPAN13-201ENST00000262067 MOCOSQ96EN8 888 aa24.09■■□□□ 1.45
TSPAN13-201ENST00000262067 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa24.09■■□□□ 1.45
TSPAN13-201ENST00000262067 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
TSPAN13-201ENST00000262067 LRMDAQ9H2I8 198 aa24.09■■□□□ 1.45
TSPAN13-201ENST00000262067 ASAH2Q9NR71 780 aa24.09■■□□□ 1.45
TSPAN13-201ENST00000262067 IGSF5Q9NSI5 407 aa24.09■■□□□ 1.45
TSPAN13-201ENST00000262067 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
TSPAN13-201ENST00000262067 CLEC4EQ9ULY5 219 aa24.09■■□□□ 1.45
TSPAN13-201ENST00000262067 CRYL1Q9Y2S2 319 aa24.09■■□□□ 1.45
TSPAN13-201ENST00000262067 KRT16P08779 473 aa24.09■■□□□ 1.45
TSPAN13-201ENST00000262067 SLC8A1P32418 973 aa24.09■■□□□ 1.45
TSPAN13-201ENST00000262067 CTNNB1P35222 781 aa24.09■■□□□ 1.45
TSPAN13-201ENST00000262067 CCR2P41597 374 aa24.09■■□□□ 1.45
TSPAN13-201ENST00000262067 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
TSPAN13-201ENST00000262067 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa24.09■■□□□ 1.45
TSPAN13-201ENST00000262067 TPGS1Q6ZTW0 290 aa24.09■■□□□ 1.45
TSPAN13-201ENST00000262067 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa24.09■■□□□ 1.45
TSPAN13-201ENST00000262067 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
TSPAN13-201ENST00000262067 OR4L1Q8NH43 312 aa24.09■■□□□ 1.45
TSPAN13-201ENST00000262067 GCNAQ96QF7 691 aa24.09■■□□□ 1.45
TSPAN13-201ENST00000262067 SIKE1Q9BRV8 207 aa24.09■■□□□ 1.45
TSPAN13-201ENST00000262067 ACSS2Q9NR19 701 aa24.09■■□□□ 1.45
TSPAN13-201ENST00000262067 ZNF510Q9Y2H8 683 aa24.09■■□□□ 1.45
TSPAN13-201ENST00000262067 TMEM114B3SHH9 223 aa24.08■■□□□ 1.45
TSPAN13-201ENST00000262067 LEFTY2O00292 366 aa24.08■■□□□ 1.45
TSPAN13-201ENST00000262067 HSPA4LO95757 839 aa24.08■■□□□ 1.45
TSPAN13-201ENST00000262067 CDKN2DP55273 166 aa24.08■■□□□ 1.45
TSPAN13-201ENST00000262067 RHOAP61586 193 aa24.08■■□□□ 1.45
TSPAN13-201ENST00000262067 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
TSPAN13-201ENST00000262067 LIPMQ5VYY2 423 aa24.08■■□□□ 1.45
TSPAN13-201ENST00000262067 MAVSQ7Z434 540 aa24.08■■□□□ 1.45
TSPAN13-201ENST00000262067 CPXM2Q8N436 756 aa24.08■■□□□ 1.45
TSPAN13-201ENST00000262067 DCAF4L2Q8NA75 395 aa24.08■■□□□ 1.45
TSPAN13-201ENST00000262067 OR4K2Q8NGD2 314 aa24.08■■□□□ 1.45
TSPAN13-201ENST00000262067 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
TSPAN13-201ENST00000262067 TSPAN17Q96FV3 270 aa24.08■■□□□ 1.45
TSPAN13-201ENST00000262067 RILPQ96NA2 401 aa24.08■■□□□ 1.45
TSPAN13-201ENST00000262067 ARMCX1Q9P291 453 aa24.08■■□□□ 1.45
TSPAN13-201ENST00000262067 K7ERQ8 282 aa24.07■■□□□ 1.44
TSPAN13-201ENST00000262067 TLL1O43897 1013 aa24.07■■□□□ 1.44
TSPAN13-201ENST00000262067 DLX3O60479 287 aa24.07■■□□□ 1.44
TSPAN13-201ENST00000262067 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
TSPAN13-201ENST00000262067 CSHL1Q14406 222 aa24.07■■□□□ 1.44
TSPAN13-201ENST00000262067 PPM1LQ5SGD2 360 aa24.07■■□□□ 1.44
TSPAN13-201ENST00000262067 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
TSPAN13-201ENST00000262067 MRNIPQ6NTE8 343 aa24.07■■□□□ 1.44
TSPAN13-201ENST00000262067 TTC8Q8TAM2 541 aa24.07■■□□□ 1.44
TSPAN13-201ENST00000262067 ADGRE3Q9BY15 652 aa24.07■■□□□ 1.44
TSPAN13-201ENST00000262067 CATSPERZQ9NTU4 200 aa24.07■■□□□ 1.44
TSPAN13-201ENST00000262067 ANKRD66B4E2M5 251 aa24.07■■□□□ 1.44
TSPAN13-201ENST00000262067 PRSS56P0CW18 603 aa24.07■■□□□ 1.44
TSPAN13-201ENST00000262067 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37 ms