RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233025.11

SPCS1-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 1,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-201ENST00000233025 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP16.54■□□□□ 0.24
SPCS1-201ENST00000233025 E5RJQ4 531 aa16.53■□□□□ 0.24
SPCS1-201ENST00000233025 CETN3O15182 167 aa16.53■□□□□ 0.24
SPCS1-201ENST00000233025 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
SPCS1-201ENST00000233025 ITIH2P19823 946 aa16.53■□□□□ 0.24
SPCS1-201ENST00000233025 MPSTP25325 297 aa16.53■□□□□ 0.24
SPCS1-201ENST00000233025 CDK17Q00537 523 aa16.53■□□□□ 0.24
SPCS1-201ENST00000233025 SLC20A2Q08357 652 aa16.53■□□□□ 0.24
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SPCS1-201ENST00000233025 SQSTM1Q13501 440 aa16.53■□□□□ 0.24
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SPCS1-201ENST00000233025 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
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SPCS1-201ENST00000233025 SLC2A13Q96QE2 648 aa16.53■□□□□ 0.24
SPCS1-201ENST00000233025 CTRCQ99895 268 aa16.53■□□□□ 0.24
SPCS1-201ENST00000233025 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
SPCS1-201ENST00000233025 THAP9Q9H5L6 903 aa16.53■□□□□ 0.24
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF212Q9UDV6 495 aa16.53■□□□□ 0.24
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SPCS1-201ENST00000233025 STX10O60499 249 aa16.52■□□□□ 0.24
SPCS1-201ENST00000233025 DNAJB5O75953 348 aa16.52■□□□□ 0.24
SPCS1-201ENST00000233025 STK17BO94768 372 aa16.52■□□□□ 0.24
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SPCS1-201ENST00000233025 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.24
SPCS1-201ENST00000233025 ARTNQ5T4W7 220 aa16.52■□□□□ 0.24
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.24
SPCS1-201ENST00000233025 NKAIN2Q5VXU1 208 aa16.52■□□□□ 0.24
SPCS1-201ENST00000233025 KDELC2Q7Z4H8 507 aa16.52■□□□□ 0.24
SPCS1-201ENST00000233025 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa16.52■□□□□ 0.24
SPCS1-201ENST00000233025 TMEM135Q86UB9 458 aa16.52■□□□□ 0.24
SPCS1-201ENST00000233025 DEFB106AQ8N104 65 aa16.52■□□□□ 0.24
SPCS1-201ENST00000233025 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.24
SPCS1-201ENST00000233025 POM121Q96HA1 1249 aa16.52■□□□□ 0.24
SPCS1-201ENST00000233025 SLC29A3Q9BZD2 475 aa16.52■□□□□ 0.24
SPCS1-201ENST00000233025 SIK2Q9H0K1 926 aa16.52■□□□□ 0.24
SPCS1-201ENST00000233025 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.24
SPCS1-201ENST00000233025 ANLNQ9NQW6 1124 aa16.52■□□□□ 0.24
SPCS1-201ENST00000233025 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa16.52■□□□□ 0.24
SPCS1-201ENST00000233025 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa16.51■□□□□ 0.23
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SPCS1-201ENST00000233025 TMEM202A6NGA9 273 aa16.51■□□□□ 0.23
SPCS1-201ENST00000233025 GPR3P46089 330 aa16.51■□□□□ 0.23
SPCS1-201ENST00000233025 KIAA1024LP59773 190 aa16.51■□□□□ 0.23
SPCS1-201ENST00000233025 MC2RQ01718 297 aa16.51■□□□□ 0.23
SPCS1-201ENST00000233025 LRMPQ12912 555 aa16.51■□□□□ 0.23
SPCS1-201ENST00000233025 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP16.51■□□□□ 0.23
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SPCS1-201ENST00000233025 ANKRD40Q6AI12 368 aa16.51■□□□□ 0.23
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SPCS1-201ENST00000233025 TMEM110Q86TL2 294 aa16.51■□□□□ 0.23
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SPCS1-201ENST00000233025 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP16.51■□□□□ 0.23
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SPCS1-201ENST00000233025 C5orf34Q96MH7 638 aa16.51■□□□□ 0.23
SPCS1-201ENST00000233025 GSDMAQ96QA5 445 aa16.51■□□□□ 0.23
SPCS1-201ENST00000233025 MED15Q96RN5 788 aa16.51■□□□□ 0.23
SPCS1-201ENST00000233025 ZPBPQ9BS86 351 aa16.51■□□□□ 0.23
SPCS1-201ENST00000233025 SPON2Q9BUD6 331 aa16.51■□□□□ 0.23
SPCS1-201ENST00000233025 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa16.51■□□□□ 0.23
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SPCS1-201ENST00000233025 ATP13A1Q9HD20 1204 aa16.51■□□□□ 0.23
SPCS1-201ENST00000233025 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
SPCS1-201ENST00000233025 RMND1Q9NWS8 449 aa16.51■□□□□ 0.23
SPCS1-201ENST00000233025 MPP6Q9NZW5 540 aa16.51■□□□□ 0.23
SPCS1-201ENST00000233025 SLC5A6Q9Y289 635 aa16.51■□□□□ 0.23
SPCS1-201ENST00000233025 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa16.51■□□□□ 0.23
SPCS1-201ENST00000233025 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa16.51■□□□□ 0.23
SPCS1-201ENST00000233025 ILVBLA1L0T0 632 aa16.5■□□□□ 0.23
SPCS1-201ENST00000233025 DRGXA6NNA5 263 aa16.5■□□□□ 0.23
SPCS1-201ENST00000233025 KRIT1O00522 736 aa16.5■□□□□ 0.23
SPCS1-201ENST00000233025 ZW10O43264 779 aa16.5■□□□□ 0.23
SPCS1-201ENST00000233025 GSRP00390 522 aa16.5■□□□□ 0.23
SPCS1-201ENST00000233025 OR1E1P30953 314 aa16.5■□□□□ 0.23
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SPCS1-201ENST00000233025 ERV3-1Q14264 604 aa16.5■□□□□ 0.23
SPCS1-201ENST00000233025 AGERQ15109 404 aa16.5■□□□□ 0.23
SPCS1-201ENST00000233025 TMEM52BQ4KMG9 183 aa16.5■□□□□ 0.23
SPCS1-201ENST00000233025 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF783Q6ZMS7 281 aa16.5■□□□□ 0.23
SPCS1-201ENST00000233025 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
SPCS1-201ENST00000233025 Q8NA96 180 aa16.5■□□□□ 0.23
SPCS1-201ENST00000233025 TTC13Q8NBP0 860 aa16.5■□□□□ 0.23
SPCS1-201ENST00000233025 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP16.5■□□□□ 0.23
SPCS1-201ENST00000233025 OR2AP1Q8NGE2 309 aa16.5■□□□□ 0.23
SPCS1-201ENST00000233025 CCDC34Q96HJ3 373 aa16.5■□□□□ 0.23
SPCS1-201ENST00000233025 DPYSL5Q9BPU6 564 aa16.5■□□□□ 0.23
SPCS1-201ENST00000233025 TRIM55Q9BYV6 548 aa16.5■□□□□ 0.23
SPCS1-201ENST00000233025 APMAPQ9HDC9 416 aa16.5■□□□□ 0.23
SPCS1-201ENST00000233025 PDP2Q9P2J9 529 aa16.5■□□□□ 0.23
SPCS1-201ENST00000233025 ENTPD4Q9Y227 616 aa16.5■□□□□ 0.23
SPCS1-201ENST00000233025 SNX10Q9Y5X0 201 aa16.5■□□□□ 0.23
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