RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000229390.7

SRSF9-201, Transcript of serine and arginine rich splicing factor 9, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SRSF9, Length 1,201 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF9-201ENST00000229390 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
SRSF9-201ENST00000229390 CLCA2Q9UQC9 943 aa26.56■■□□□ 1.84
SRSF9-201ENST00000229390 NBEAQ8NFP9 2946 aa26.56■■□□□ 1.84
SRSF9-201ENST00000229390 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa26.55■■□□□ 1.84
SRSF9-201ENST00000229390 MFSD11O43934 449 aa26.55■■□□□ 1.84
SRSF9-201ENST00000229390 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
SRSF9-201ENST00000229390 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
SRSF9-201ENST00000229390 ARSEP51690 589 aa26.55■■□□□ 1.84
SRSF9-201ENST00000229390 ITKQ08881 620 aa26.55■■□□□ 1.84
SRSF9-201ENST00000229390 ACOX1Q15067 660 aa26.55■■□□□ 1.84
SRSF9-201ENST00000229390 CDKN3Q16667 212 aa26.55■■□□□ 1.84
SRSF9-201ENST00000229390 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa26.55■■□□□ 1.84
SRSF9-201ENST00000229390 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
SRSF9-201ENST00000229390 LIPIQ6XZB0 460 aa26.55■■□□□ 1.84
SRSF9-201ENST00000229390 DPPA4Q7L190 304 aa26.55■■□□□ 1.84
SRSF9-201ENST00000229390 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP26.55■■□□□ 1.84
SRSF9-201ENST00000229390 FAM181AQ8N9Y4 354 aa26.55■■□□□ 1.84
SRSF9-201ENST00000229390 PLA2G15Q8NCC3 412 aa26.55■■□□□ 1.84
SRSF9-201ENST00000229390 FAM71BQ8TC56 605 aa26.55■■□□□ 1.84
SRSF9-201ENST00000229390 LRRC61Q9BV99 259 aa26.55■■□□□ 1.84
SRSF9-201ENST00000229390 EVA1BQ9NVM1 165 aa26.55■■□□□ 1.84
SRSF9-201ENST00000229390 AK5Q9Y6K8 562 aa26.55■■□□□ 1.84
SRSF9-201ENST00000229390 U3KQA8 63 aa26.55■■□□□ 1.84
SRSF9-201ENST00000229390 ACACAQ13085 2346 aa26.55■■□□□ 1.84
SRSF9-201ENST00000229390 APC2O95996 2303 aa26.54■■□□□ 1.84
SRSF9-201ENST00000229390 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa26.54■■□□□ 1.84
SRSF9-201ENST00000229390 CPED1A4D0V7 1026 aa26.54■■□□□ 1.84
SRSF9-201ENST00000229390 HTR1BP28222 390 aa26.54■■□□□ 1.84
SRSF9-201ENST00000229390 PEX5P50542 639 aa26.54■■□□□ 1.84
SRSF9-201ENST00000229390 MESDQ14696 234 aa26.54■■□□□ 1.84
SRSF9-201ENST00000229390 DENND2CQ68D51 928 aa26.54■■□□□ 1.84
SRSF9-201ENST00000229390 C19orf48Q6RUI8 117 aa26.54■■□□□ 1.84
SRSF9-201ENST00000229390 NYAP1Q6ZVC0 841 aa26.54■■□□□ 1.84
SRSF9-201ENST00000229390 PCDH19Q8TAB3 1148 aa26.54■■□□□ 1.84
SRSF9-201ENST00000229390 IFI44Q8TCB0 444 aa26.54■■□□□ 1.84
SRSF9-201ENST00000229390 MGME1Q9BQP7 344 aa26.54■■□□□ 1.84
SRSF9-201ENST00000229390 ABCG4Q9H172 646 aa26.54■■□□□ 1.84
SRSF9-201ENST00000229390 SPTLC3Q9NUV7 552 aa26.54■■□□□ 1.84
SRSF9-201ENST00000229390 B4GALT6Q9UBX8 382 aa26.54■■□□□ 1.84
SRSF9-201ENST00000229390 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa26.54■■□□□ 1.84
SRSF9-201ENST00000229390 OPA1O60313 960 aa26.53■■□□□ 1.84
SRSF9-201ENST00000229390 MT-CO3P00414 261 aa26.53■■□□□ 1.84
SRSF9-201ENST00000229390 CPP00450 1065 aa26.53■■□□□ 1.84
SRSF9-201ENST00000229390 ANXA6P08133 673 aa26.53■■□□□ 1.84
SRSF9-201ENST00000229390 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
SRSF9-201ENST00000229390 TMEM253P0C7T8 217 aa26.53■■□□□ 1.84
SRSF9-201ENST00000229390 CTSEP14091 401 aa26.53■■□□□ 1.84
SRSF9-201ENST00000229390 TSHRP16473 764 aa26.53■■□□□ 1.84
SRSF9-201ENST00000229390 CR2P20023 1033 aa26.53■■□□□ 1.84
SRSF9-201ENST00000229390 NFATC4Q14934 902 aa26.53■■□□□ 1.84
SRSF9-201ENST00000229390 AGERQ15109 404 aa26.53■■□□□ 1.84
SRSF9-201ENST00000229390 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa26.53■■□□□ 1.84
SRSF9-201ENST00000229390 SLC35G2Q8TBE7 412 aa26.53■■□□□ 1.84
SRSF9-201ENST00000229390 LRRN4Q8WUT4 740 aa26.53■■□□□ 1.84
SRSF9-201ENST00000229390 NXPE2Q96DL1 559 aa26.53■■□□□ 1.84
SRSF9-201ENST00000229390 CCDC42Q96M95 316 aa26.53■■□□□ 1.84
SRSF9-201ENST00000229390 CLPBQ9H078 707 aa26.53■■□□□ 1.84
SRSF9-201ENST00000229390 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
SRSF9-201ENST00000229390 DOLKQ9UPQ8 538 aa26.53■■□□□ 1.84
SRSF9-201ENST00000229390 ITPR1Q14643 2758 aa26.53■■□□□ 1.84
SRSF9-201ENST00000229390 CFAP69A5D8W1 941 aa26.52■■□□□ 1.84
SRSF9-201ENST00000229390 MFAP3LO75121 409 aa26.52■■□□□ 1.84
SRSF9-201ENST00000229390 SOCS5O75159 536 aa26.52■■□□□ 1.84
SRSF9-201ENST00000229390 KRT7P08729 469 aa26.52■■□□□ 1.84
SRSF9-201ENST00000229390 BLKP51451 505 aa26.52■■□□□ 1.84
SRSF9-201ENST00000229390 TRAF2Q12933 501 aa26.52■■□□□ 1.84
SRSF9-201ENST00000229390 PDK2Q15119 407 aa26.52■■□□□ 1.84
SRSF9-201ENST00000229390 ALG11Q2TAA5 492 aa26.52■■□□□ 1.84
SRSF9-201ENST00000229390 MAP7D3Q8IWC1 876 aa26.52■■□□□ 1.84
SRSF9-201ENST00000229390 RFFLQ8WZ73 363 aa26.52■■□□□ 1.84
SRSF9-201ENST00000229390 USP29Q9HBJ7 922 aa26.52■■□□□ 1.84
SRSF9-201ENST00000229390 DKK4Q9UBT3 224 aa26.52■■□□□ 1.84
SRSF9-201ENST00000229390 KLQ9UEF7 1012 aa26.52■■□□□ 1.84
SRSF9-201ENST00000229390 SALL4Q9UJQ4 1053 aa26.52■■□□□ 1.84
SRSF9-201ENST00000229390 LMO7DNF2Z398 122 aa26.51■■□□□ 1.83
SRSF9-201ENST00000229390 TPP1O14773 563 aa26.51■■□□□ 1.83
SRSF9-201ENST00000229390 YY2O15391 372 aa26.51■■□□□ 1.83
SRSF9-201ENST00000229390 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
SRSF9-201ENST00000229390 GARSP41250 739 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
SRSF9-201ENST00000229390 HK3P52790 923 aa26.51■■□□□ 1.83
SRSF9-201ENST00000229390 SRP54P61011 504 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
SRSF9-201ENST00000229390 MTM1Q13496 603 aa26.51■■□□□ 1.83
SRSF9-201ENST00000229390 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
SRSF9-201ENST00000229390 NR0B2Q15466 257 aa26.51■■□□□ 1.83
SRSF9-201ENST00000229390 GUSBP11Q6P575 273 aa26.51■■□□□ 1.83
SRSF9-201ENST00000229390 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
SRSF9-201ENST00000229390 LRRC49Q8IUZ0 686 aa26.51■■□□□ 1.83
SRSF9-201ENST00000229390 MAPK15Q8TD08 544 aa26.51■■□□□ 1.83
SRSF9-201ENST00000229390 ZNF670Q9BS34 389 aa26.51■■□□□ 1.83
SRSF9-201ENST00000229390 TTLL3Q9Y4R7 772 aa26.51■■□□□ 1.83
SRSF9-201ENST00000229390 ASXL3Q9C0F0 2248 aa26.51■■□□□ 1.83
SRSF9-201ENST00000229390 LRP4O75096 1905 aa26.51■■□□□ 1.83
SRSF9-201ENST00000229390 RASGRP1O95267 797 aa26.5■■□□□ 1.83
SRSF9-201ENST00000229390 GM2AP17900 193 aa26.5■■□□□ 1.83
SRSF9-201ENST00000229390 GALNT2Q10471 571 aa26.5■■□□□ 1.83
SRSF9-201ENST00000229390 PTPRRQ15256 657 aa26.5■■□□□ 1.83
SRSF9-201ENST00000229390 CRTC1Q6UUV9 634 aa26.5■■□□□ 1.83
SRSF9-201ENST00000229390 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa26.5■■□□□ 1.83
SRSF9-201ENST00000229390 GLMNQ92990 594 aa26.5■■□□□ 1.83
SRSF9-201ENST00000229390 WDR92Q96MX6 357 aa26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.8 ms