RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556355.5

SRP54-AS1-203, Transcript of SRP54 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SRP54-AS1, Length 603 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP54-AS1-203ENST00000556355 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
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SRP54-AS1-203ENST00000556355 KIF9Q9HAQ2 790 aa4.58□□□□□ -1.68
SRP54-AS1-203ENST00000556355 SLC6A13Q9NSD5 602 aa4.58□□□□□ -1.68
SRP54-AS1-203ENST00000556355 GIMAP2Q9UG22 337 aa4.58□□□□□ -1.68
SRP54-AS1-203ENST00000556355 ZNF711Q9Y462 761 aa4.58□□□□□ -1.68
SRP54-AS1-203ENST00000556355 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
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SRP54-AS1-203ENST00000556355 SEC14L5O43304 696 aa4.57□□□□□ -1.68
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SRP54-AS1-203ENST00000556355 HDAC4P56524 1084 aa4.57□□□□□ -1.68
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SRP54-AS1-203ENST00000556355 ZNF398Q8TD17 642 aa4.56□□□□□ -1.68
SRP54-AS1-203ENST00000556355 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
SRP54-AS1-203ENST00000556355 OTULINQ96BN8 352 aa4.56□□□□□ -1.68
SRP54-AS1-203ENST00000556355 MOAP1Q96BY2 351 aa4.56□□□□□ -1.68
SRP54-AS1-203ENST00000556355 ARHGEF26Q96DR7 871 aa4.56□□□□□ -1.68
SRP54-AS1-203ENST00000556355 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
SRP54-AS1-203ENST00000556355 SIL1Q9H173 461 aa4.56□□□□□ -1.68
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SRP54-AS1-203ENST00000556355 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa4.56□□□□□ -1.68
SRP54-AS1-203ENST00000556355 BPIFA1Q9NP55 256 aa4.56□□□□□ -1.68
SRP54-AS1-203ENST00000556355 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
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