RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556288.5

ATXN3-238, Transcript of ataxin 3, human

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 901 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-238	ENST00000556288	FMNL3	Q8IVF7	1028 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	SLC30A5	Q8TAD4	765 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	DDI1	Q8WTU0	396 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	SLC35F5	Q8WV83	523 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	OSCP1	Q8WVF1	389 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	OVCA2	Q8WZ82	227 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	ATOH1	Q92858	354 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	ATP2A3	Q93084	1043 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	WBP2	Q969T9	261 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	EXOC4	Q96A65	974 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	PPP1R13B	Q96KQ4	1090 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	NAP1L5	Q96NT1	182 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	NELL2	Q99435	816 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	BPIFA3	Q9BQP9	254 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	ZSWIM1	Q9BR11	485 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	HNRNPUL1	Q9BUJ2	856 aa	Known RBP eCLIP	4.83	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	TTLL2	Q9BWV7	592 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	FAM124B	Q9H5Z6	455 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	C8orf33	Q9H7E9	229 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	ECT2	Q9H8V3	914 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	KIF9	Q9HAQ2	790 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	TRPV4	Q9HBA0	871 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	ABCC13	Q9NSE7	274 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	RBM12	Q9NTZ6	932 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	MTPAP	Q9NVV4	582 aa	Known RBP eCLIP	4.83	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	OSER1	Q9NX31	292 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	PLK2	Q9NYY3	685 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	IFNK	Q9P0W0	207 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	USP36	Q9P275	1121 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	TBC1D14	Q9P2M4	693 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	NAALADL1	Q9UQQ1	740 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	CHD5	Q8TDI0	1954 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288		A0A0C4DFX4	3053 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	XIRP2	A4UGR9	3374 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	TP53BP1	Q12888	1972 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	NYNRIN	Q9P2P1	1898 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	GOLGA6L7	A0A1B0GV03	622 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	E2F8	A0AVK6	867 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	TBC1D3B	A6NDS4	549 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	LGALS16	A8MUM7	142 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288		E5RJQ4	531 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	NEDD8-MDP1	E9PL57	170 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	MSI1	O43347	362 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	LAMTOR5	O43504	91 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	NFATC1	O95644	943 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	MOCS2	O96007	188 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	OAS1	P00973	400 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	APOD	P05090	189 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	TPM3	P06753	285 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	CCDC172	P0C7W6	258 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	SKIL	P12757	684 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	CYP11B1	P15538	503 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	CORO1A	P31146	461 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	GPD2	P43304	727 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	HARS2	P49590	506 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	TBX4	P57082	545 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	SESN3	P58005	492 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	STARD6	P59095	220 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	DAOA	P59103	153 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	PPP2CB	P62714	309 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	YWHAZ	P63104	245 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	PPP2CA	P67775	309 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	SLC7A9	P82251	487 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	TMPRSS15	P98073	1019 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	ZXDB	P98169	803 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	GAD2	Q05329	585 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	KDSR	Q06136	332 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	FCHO2	Q0JRZ9	810 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	NME3	Q13232	169 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF268	Q14587	947 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF77	Q15935	545 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	ASIC2	Q16515	512 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	C2CD6	Q53TS8	623 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	DCAF6	Q58WW2	860 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	EFHC1	Q5JVL4	640 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	LY6G5C	Q5SRR4	150 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	ZFYVE27	Q5T4F4	411 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	SFMBT2	Q5VUG0	894 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	NAA35	Q5VZE5	725 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	TMEM200B	Q69YZ2	307 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	PM20D1	Q6GTS8	502 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	C1orf228	Q6PIY5	440 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	UNQ6494/PRO21346	Q6UXR6	183 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	ARHGEF18	Q6ZSZ5	1173 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	LARP4	Q71RC2	724 aa	Known RBP eCLIP	4.82	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	KANSL1	Q7Z3B3	1105 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	CCDC186	Q7Z3E2	898 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	BMP8A	Q7Z5Y6	402 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	RALGPS2	Q86X27	583 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	TMEM25	Q86YD3	366 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	CCDC117	Q8IWD4	279 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	BBS7	Q8IWZ6	715 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	DRC7	Q8IY82	874 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	FAM71A	Q8IYT1	594 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	WDTC1	Q8N5D0	677 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	CCDC33	Q8N5R6	958 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	TMEM105	Q8N8V8	129 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	TMEM35B	Q8NCS4	154 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	MSANTD4	Q8NCY6	345 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATXN3-238	ENST00000556288	C1orf131	Q8NDD1	294 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64

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