RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492741.5

PSPC1-204, Transcript of paraspeckle component 1, humanhuman

TSL 2

Gene PSPC1, Length 1,709 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSPC1-204ENST00000492741 GJD3Q8N144 294 aa22.18■■□□□ 1.14
PSPC1-204ENST00000492741 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
PSPC1-204ENST00000492741 NAT9Q9BTE0 207 aa22.18■■□□□ 1.14
PSPC1-204ENST00000492741 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
PSPC1-204ENST00000492741 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
PSPC1-204ENST00000492741 F5P12259 2224 aa22.18■■□□□ 1.14
PSPC1-204ENST00000492741 ANKRD36A6QL64 1941 aa22.18■■□□□ 1.14
PSPC1-204ENST00000492741 MAGEB16A2A368 324 aa22.17■■□□□ 1.14
PSPC1-204ENST00000492741 TTC4O95801 387 aa22.17■■□□□ 1.14
PSPC1-204ENST00000492741 IL1BP01584 269 aa22.17■■□□□ 1.14
PSPC1-204ENST00000492741 PRKCGP05129 697 aa22.17■■□□□ 1.14
PSPC1-204ENST00000492741 CTPS1P17812 591 aa22.17■■□□□ 1.14
PSPC1-204ENST00000492741 HSD17B3P37058 310 aa22.17■■□□□ 1.14
PSPC1-204ENST00000492741 GRIA4P48058 902 aa22.17■■□□□ 1.14
PSPC1-204ENST00000492741 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
PSPC1-204ENST00000492741 CBLBQ13191 982 aa22.17■■□□□ 1.14
PSPC1-204ENST00000492741 QPCTQ16769 361 aa22.17■■□□□ 1.14
PSPC1-204ENST00000492741 CCNJLQ8IV13 435 aa22.17■■□□□ 1.14
PSPC1-204ENST00000492741 MREGQ8N565 214 aa22.17■■□□□ 1.14
PSPC1-204ENST00000492741 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa22.17■■□□□ 1.14
PSPC1-204ENST00000492741 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
PSPC1-204ENST00000492741 PHTF1Q9UMS5 762 aa22.17■■□□□ 1.14
PSPC1-204ENST00000492741 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
PSPC1-204ENST00000492741 ADRA1DP25100 572 aa22.17■■□□□ 1.14
PSPC1-204ENST00000492741 CCINQ13939 588 aa22.17■■□□□ 1.14
PSPC1-204ENST00000492741 ZNF805Q5CZA5 627 aa22.17■■□□□ 1.14
PSPC1-204ENST00000492741 BRAT1Q6PJG6 821 aa22.17■■□□□ 1.14
PSPC1-204ENST00000492741 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa22.17■■□□□ 1.14
PSPC1-204ENST00000492741 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
PSPC1-204ENST00000492741 SIX5Q8N196 739 aa22.17■■□□□ 1.14
PSPC1-204ENST00000492741 TMIEQ8NEW7 156 aa22.17■■□□□ 1.14
PSPC1-204ENST00000492741 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa22.17■■□□□ 1.14
PSPC1-204ENST00000492741 PIH1D2Q8WWB5 315 aa22.17■■□□□ 1.14
PSPC1-204ENST00000492741 FAM129BQ96TA1 746 aa22.17■■□□□ 1.14
PSPC1-204ENST00000492741 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa22.17■■□□□ 1.14
PSPC1-204ENST00000492741 CHRAC1Q9NRG0 131 aa22.17■■□□□ 1.14
PSPC1-204ENST00000492741 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
PSPC1-204ENST00000492741 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
PSPC1-204ENST00000492741 CCDC78A2IDD5 438 aa22.16■■□□□ 1.14
PSPC1-204ENST00000492741 KRBA1A5PL33 1030 aa22.16■■□□□ 1.14
PSPC1-204ENST00000492741 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa22.16■■□□□ 1.14
PSPC1-204ENST00000492741 STK25O00506 426 aa22.16■■□□□ 1.14
PSPC1-204ENST00000492741 RIPK2O43353 540 aa22.16■■□□□ 1.14
PSPC1-204ENST00000492741 POLBP06746 335 aa22.16■■□□□ 1.14
PSPC1-204ENST00000492741 HOXB2P14652 356 aa22.16■■□□□ 1.14
PSPC1-204ENST00000492741 PGAM1P18669 254 aa22.16■■□□□ 1.14
PSPC1-204ENST00000492741 XPAP23025 273 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
PSPC1-204ENST00000492741 ABL2P42684 1182 aa22.16■■□□□ 1.14
PSPC1-204ENST00000492741 UBXN2BQ14CS0 331 aa22.16■■□□□ 1.14
PSPC1-204ENST00000492741 HDXQ7Z353 690 aa22.16■■□□□ 1.14
PSPC1-204ENST00000492741 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
PSPC1-204ENST00000492741 VOPP1Q96AW1 172 aa22.16■■□□□ 1.14
PSPC1-204ENST00000492741 ECHDC3Q96DC8 303 aa22.16■■□□□ 1.14
PSPC1-204ENST00000492741 DYRK4Q9NR20 520 aa22.16■■□□□ 1.14
PSPC1-204ENST00000492741 SARDHQ9UL12 918 aa22.16■■□□□ 1.14
PSPC1-204ENST00000492741 PPM1HQ9ULR3 514 aa22.16■■□□□ 1.14
PSPC1-204ENST00000492741 HEATR9A2RTY3 570 aa22.15■■□□□ 1.14
PSPC1-204ENST00000492741 SSTR1P30872 391 aa22.15■■□□□ 1.14
PSPC1-204ENST00000492741 PHBP35232 272 aa22.15■■□□□ 1.14
PSPC1-204ENST00000492741 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
PSPC1-204ENST00000492741 LAMB3Q13751 1172 aa22.15■■□□□ 1.14
PSPC1-204ENST00000492741 SLC29A2Q14542 456 aa22.15■■□□□ 1.14
PSPC1-204ENST00000492741 CASP8Q14790 479 aa22.15■■□□□ 1.14
PSPC1-204ENST00000492741 CES3Q6UWW8 571 aa22.15■■□□□ 1.14
PSPC1-204ENST00000492741 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa22.15■■□□□ 1.14
PSPC1-204ENST00000492741 ZSWIM9Q86XI8 627 aa22.15■■□□□ 1.14
PSPC1-204ENST00000492741 BRSK1Q8TDC3 778 aa22.15■■□□□ 1.14
PSPC1-204ENST00000492741 PPP1R16AQ96I34 528 aa22.15■■□□□ 1.14
PSPC1-204ENST00000492741 GABRG3Q99928 467 aa22.15■■□□□ 1.14
PSPC1-204ENST00000492741 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
PSPC1-204ENST00000492741 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP22.15■■□□□ 1.14
PSPC1-204ENST00000492741 MUTYHQ9UIF7 546 aa22.15■■□□□ 1.14
PSPC1-204ENST00000492741 SOX13Q9UN79 622 aa22.15■■□□□ 1.14
PSPC1-204ENST00000492741 TCAF1Q9Y4C2 921 aa22.15■■□□□ 1.14
PSPC1-204ENST00000492741 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa22.15■■□□□ 1.14
PSPC1-204ENST00000492741 ATG2BQ96BY7 2078 aa22.15■■□□□ 1.14
PSPC1-204ENST00000492741 SLC4A1P02730 911 aa22.14■■□□□ 1.14
PSPC1-204ENST00000492741 ALPIP09923 528 aa22.14■■□□□ 1.14
PSPC1-204ENST00000492741 PSMD8P48556 350 aa22.14■■□□□ 1.14
PSPC1-204ENST00000492741 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
PSPC1-204ENST00000492741 SPDYCQ5MJ68 293 aa22.14■■□□□ 1.14
PSPC1-204ENST00000492741 EOGTQ5NDL2 527 aa22.14■■□□□ 1.14
PSPC1-204ENST00000492741 FAM46CQ5VWP2 391 aa22.14■■□□□ 1.14
PSPC1-204ENST00000492741 PKN3Q6P5Z2 889 aa22.14■■□□□ 1.14
PSPC1-204ENST00000492741 USP45Q70EL2 814 aa22.14■■□□□ 1.14
PSPC1-204ENST00000492741 TTC7BQ86TV6 843 aa22.14■■□□□ 1.14
PSPC1-204ENST00000492741 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
PSPC1-204ENST00000492741 SMIM14Q96QK8 99 aa22.14■■□□□ 1.14
PSPC1-204ENST00000492741 A0A0J9YYE9 177 aa22.14■■□□□ 1.13
PSPC1-204ENST00000492741 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa22.14■■□□□ 1.13
PSPC1-204ENST00000492741 ADAM23O75077 832 aa22.14■■□□□ 1.13
PSPC1-204ENST00000492741 CRTAMO95727 393 aa22.14■■□□□ 1.13
PSPC1-204ENST00000492741 TRBC1P01850 177 aa22.14■■□□□ 1.13
PSPC1-204ENST00000492741 NFKBIAP25963 317 aa22.14■■□□□ 1.13
PSPC1-204ENST00000492741 STARD6P59095 220 aa22.14■■□□□ 1.13
PSPC1-204ENST00000492741 LRRC32Q14392 662 aa22.14■■□□□ 1.13
PSPC1-204ENST00000492741 PTPRRQ15256 657 aa22.14■■□□□ 1.13
PSPC1-204ENST00000492741 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
PSPC1-204ENST00000492741 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
PSPC1-204ENST00000492741 UNC5AQ6ZN44 842 aa22.14■■□□□ 1.13
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