RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489895.5

NISCH-213, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 5,350 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-213ENST00000489895 SVOPQ8N4V2 548 aa17.12■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 DUSP12Q9UNI6 340 aa17.12■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP17.12■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP17.12■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP17.12■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP17.12■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 CDKN2BP42772 138 aa17.12■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 HADHBP55084 474 aaKnown RBP17.12■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 PRKCZQ05513 592 aa17.12■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 BST1Q10588 318 aa17.12■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP17.12■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 ATAT1Q5SQI0 421 aa17.12■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP17.12■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 PLD4Q96BZ4 506 aa17.12■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 PCED1BQ96HM7 432 aa17.12■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 LRCH1Q9Y2L9 728 aa17.12■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 PEAK1Q9H792 1746 aa17.12■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 A0A1B0GVM2 712 aa17.12■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 TCAF2A6NFQ2 919 aa17.12■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP17.12■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 NDUFB5O43674 189 aa17.12■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 AVILO75366 819 aa17.12■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 FAM163BP0C2L3 166 aa17.12■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP17.12■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 CLYBLQ8N0X4 340 aa17.12■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP17.12■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 SLC12A4Q9UP95 1085 aa17.12■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 MEI4A8MW99 385 aa17.12■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP17.12■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 FSBPO95073 299 aa17.12■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 PIRTP0C851 137 aa17.12■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP17.12■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 EPS8Q12929 822 aa17.12■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP17.12■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa17.12■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 XPR1Q9UBH6 696 aa17.12■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 ZNF232Q9UNY5 417 aa17.12■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 TRABD2AQ86V40 505 aa17.11■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 ADHFE1Q8IWW8 467 aa17.11■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 CFAP52Q8N1V2 620 aa17.11■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 TCAIMQ8N3R3 496 aa17.11■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 HECAQ9UBI9 543 aaPredicted RBP17.11■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP17.11■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 NOS3P29474 1203 aa17.11■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 CCR3P51677 355 aa17.11■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 NDST2P52849 883 aa17.11■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 UBE3AQ05086 875 aa17.11■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP17.11■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 EXOC3L1Q86VI1 746 aa17.11■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa17.11■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 BRI3BPQ8WY22 251 aa17.11■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP17.11■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 HIC2Q96JB3 615 aa17.11■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa17.11■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 SPEF2Q9C093 1822 aa17.11■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP17.11■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 SERPINB1P30740 379 aa17.11■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 NPY5RQ15761 445 aa17.11■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 LINGO1Q96FE5 620 aa17.11■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 GBA3Q9H227 469 aa17.11■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 ANAPC2Q9UJX6 822 aa17.11■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 PEX11AO75192 247 aa17.11■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 SLC20A2Q08357 652 aa17.11■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 MAPKAPK3Q16644 382 aa17.11■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 XKR6Q5GH73 641 aa17.11■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP17.11■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 ASZ1Q8WWH4 475 aa17.11■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 RGSL1A5PLK6 1076 aa17.11■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 MFSD11O43934 449 aa17.11■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 HS6ST1O60243 411 aa17.11■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 SPATA31D3P0C874 917 aa17.11■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 PTPN2P17706 415 aa17.11■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 RGS1Q08116 209 aa17.11■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 POM121L1PQ3SYA9 428 aa17.11■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa17.11■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 STYXQ8WUJ0 223 aa17.11■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 CXorf56Q9H5V9 222 aa17.11■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 RPS6KA6Q9UK32 745 aa17.11■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 AZIN1O14977 448 aa17.1■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 CLOCKO15516 846 aa17.1■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 BANF1O75531 89 aa17.1■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 UNC5CO95185 931 aa17.1■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 PRNPP04156 253 aa17.1■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 MYBL2P10244 700 aa17.1■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 JAK1P23458 1154 aa17.1■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 GSTA3Q16772 222 aa17.1■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 FAM151BQ6UXP7 276 aa17.1■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 STK32CQ86UX6 486 aa17.1■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 CHKBQ9Y259 395 aa17.1■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 TPRKBQ9Y3C4 175 aa17.1■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 DYTNA2CJ06 578 aa17.1■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 ZCCHC18P0CG32 403 aa17.1■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 OSBPL6Q9BZF3 934 aa17.1■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 SLC25A51Q9H1U9 297 aa17.1■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP17.1■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 SOHLH2Q9NX45 425 aa17.1■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa17.1■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 PEX10O60683 326 aa17.1■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 CAPN15O75808 1086 aa17.1■□□□□ 0.33
NISCH-213ENST00000489895 CCNDBP1O95273 360 aa17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.5 ms