RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000458294.5

PBRM1-218, Transcript of polybromo 1, humanhuman

TSL 3

Gene PBRM1, Length 476 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1-218ENST00000458294 APOOQ9BUR5 198 aa26.6■■□□□ 1.85
PBRM1-218ENST00000458294 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa26.6■■□□□ 1.85
PBRM1-218ENST00000458294 TAB2Q9NYJ8 693 aa26.6■■□□□ 1.85
PBRM1-218ENST00000458294 ADAM22Q9P0K1 906 aa26.6■■□□□ 1.85
PBRM1-218ENST00000458294 ACSL6Q9UKU0 697 aa26.6■■□□□ 1.85
PBRM1-218ENST00000458294 GPR34Q9UPC5 381 aa26.6■■□□□ 1.85
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PBRM1-218ENST00000458294 INHBCP55103 352 aa26.59■■□□□ 1.85
PBRM1-218ENST00000458294 SRP54P61011 504 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
PBRM1-218ENST00000458294 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
PBRM1-218ENST00000458294 INPP5AQ14642 412 aa26.59■■□□□ 1.85
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PBRM1-218ENST00000458294 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa26.59■■□□□ 1.85
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PBRM1-218ENST00000458294 TMEM74Q96NL1 305 aa26.59■■□□□ 1.85
PBRM1-218ENST00000458294 SUV39H2Q9H5I1 410 aa26.59■■□□□ 1.85
PBRM1-218ENST00000458294 PCDH12Q9NPG4 1184 aa26.59■■□□□ 1.85
PBRM1-218ENST00000458294 KLQ9UEF7 1012 aa26.59■■□□□ 1.85
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PBRM1-218ENST00000458294 SLC5A2P31639 672 aa26.58■■□□□ 1.85
PBRM1-218ENST00000458294 CCKBRP32239 447 aa26.58■■□□□ 1.85
PBRM1-218ENST00000458294 UGT1A5P35504 534 aa26.58■■□□□ 1.85
PBRM1-218ENST00000458294 AIF1P55008 147 aa26.58■■□□□ 1.85
PBRM1-218ENST00000458294 CCL7P80098 99 aa26.58■■□□□ 1.85
PBRM1-218ENST00000458294 CYTH1Q15438 398 aa26.58■■□□□ 1.85
PBRM1-218ENST00000458294 BRAT1Q6PJG6 821 aa26.58■■□□□ 1.85
PBRM1-218ENST00000458294 RD3Q7Z3Z2 195 aa26.58■■□□□ 1.85
PBRM1-218ENST00000458294 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
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PBRM1-218ENST00000458294 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
PBRM1-218ENST00000458294 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
PBRM1-218ENST00000458294 CREB3O43889 395 aa26.57■■□□□ 1.84
PBRM1-218ENST00000458294 KLK7P49862 253 aa26.57■■□□□ 1.84
PBRM1-218ENST00000458294 MTM1Q13496 603 aa26.57■■□□□ 1.84
PBRM1-218ENST00000458294 CFAP58Q5T655 872 aa26.57■■□□□ 1.84
PBRM1-218ENST00000458294 SCYL2Q6P3W7 929 aa26.57■■□□□ 1.84
PBRM1-218ENST00000458294 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP26.57■■□□□ 1.84
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PBRM1-218ENST00000458294 LRRN3Q9H3W5 708 aa26.57■■□□□ 1.84
PBRM1-218ENST00000458294 NLRC4Q9NPP4 1024 aa26.57■■□□□ 1.84
PBRM1-218ENST00000458294 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
PBRM1-218ENST00000458294 OR1A2Q9Y585 309 aa26.57■■□□□ 1.84
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PBRM1-218ENST00000458294 SIGLEC16A6NMB1 481 aa26.56■■□□□ 1.84
PBRM1-218ENST00000458294 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
PBRM1-218ENST00000458294 CCP110O43303 1012 aa26.56■■□□□ 1.84
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PBRM1-218ENST00000458294 MMP12P39900 470 aa26.56■■□□□ 1.84
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PBRM1-218ENST00000458294 KIAA1024LP59773 190 aa26.53■■□□□ 1.84
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PBRM1-218ENST00000458294 DNAJC24Q6P3W2 148 aa26.53■■□□□ 1.84
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PBRM1-218ENST00000458294 MON1BQ7L1V2 547 aa26.53■■□□□ 1.84
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