RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438219.1

HCFC1-AS1-201, HCFC1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HCFC1-AS1, Length 350 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa14.31□□□□□ -0.12
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 U3KQA8 63 aa14.31□□□□□ -0.12
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP14.31□□□□□ -0.12
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP14.3□□□□□ -0.12
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 CASC3O15234 703 aaKnown RBP14.3□□□□□ -0.12
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 MFSD11O43934 449 aa14.3□□□□□ -0.12
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 AKR1B10O60218 316 aa14.3□□□□□ -0.12
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 PROSCO94903 275 aa14.3□□□□□ -0.12
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 MMP12P39900 470 aa14.3□□□□□ -0.12
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 ARSEP51690 589 aa14.3□□□□□ -0.12
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP14.3□□□□□ -0.12
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP14.3□□□□□ -0.12
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP14.3□□□□□ -0.12
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP14.3□□□□□ -0.12
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 DPYSL3Q14195 570 aa14.3□□□□□ -0.12
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP14.3□□□□□ -0.12
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 SLC18A3Q16572 532 aa14.3□□□□□ -0.12
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 CDKN3Q16667 212 aa14.3□□□□□ -0.12
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 HADHQ16836 314 aaKnown RBP14.3□□□□□ -0.12
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 HS1BP3Q53T59 392 aa14.3□□□□□ -0.12
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 FAXCQ5TGI0 409 aa14.3□□□□□ -0.12
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 DENND2CQ68D51 928 aa14.3□□□□□ -0.12
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 BRAT1Q6PJG6 821 aa14.3□□□□□ -0.12
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 CRTC1Q6UUV9 634 aa14.3□□□□□ -0.12
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 TMPRSS12Q86WS5 348 aa14.3□□□□□ -0.12
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 PROSER1Q86XN7 944 aa14.3□□□□□ -0.12
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 PHACTR4Q8IZ21 702 aa14.3□□□□□ -0.12
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 PELI3Q8N2H9 469 aa14.3□□□□□ -0.12
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 ATPAF2Q8N5M1 289 aa14.3□□□□□ -0.12
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 LZTR1Q8N653 840 aa14.3□□□□□ -0.12
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 KCTD6Q8NC69 237 aa14.3□□□□□ -0.12
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 DENND6BQ8NEG7 585 aa14.3□□□□□ -0.12
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 PCDH19Q8TAB3 1148 aa14.3□□□□□ -0.12
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 HCAR2Q8TDS4 363 aa14.3□□□□□ -0.12
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP14.3□□□□□ -0.12
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP14.3□□□□□ -0.12
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP14.3□□□□□ -0.12
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 PSKH2Q96QS6 385 aa14.3□□□□□ -0.12
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 SCUBE2Q9NQ36 999 aa14.3□□□□□ -0.12
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 CPED1A4D0V7 1026 aa14.29□□□□□ -0.12
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 H3BM21 787 aa14.29□□□□□ -0.12
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 AQP9O43315 295 aa14.29□□□□□ -0.12
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP14.29□□□□□ -0.12
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 C1SP09871 688 aa14.29□□□□□ -0.12
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 H2AFZP0C0S5 128 aa14.29□□□□□ -0.12
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 GM2AP17900 193 aa14.29□□□□□ -0.12
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 ACP1P24666 158 aa14.29□□□□□ -0.12
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 RENBPP51606 427 aa14.29□□□□□ -0.12
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 TRAF2Q12933 501 aa14.29□□□□□ -0.12
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 MESDQ14696 234 aa14.29□□□□□ -0.12
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 GRM3Q14832 879 aa14.29□□□□□ -0.12
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 PRRT3Q5FWE3 981 aa14.29□□□□□ -0.12
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa14.29□□□□□ -0.12
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa14.29□□□□□ -0.12
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 ENPP7Q6UWV6 458 aa14.29□□□□□ -0.12
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 H2AFVQ71UI9 128 aa14.29□□□□□ -0.12
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 ZSCAN30Q86W11 494 aa14.29□□□□□ -0.12
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 HID1Q8IV36 788 aa14.29□□□□□ -0.12
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 FAM174AQ8TBP5 190 aa14.29□□□□□ -0.12
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 RAPGEF5Q92565 580 aa14.29□□□□□ -0.12
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 ECHDC3Q96DC8 303 aa14.29□□□□□ -0.12
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 IFT43Q96FT9 208 aa14.29□□□□□ -0.12
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 ZNF599Q96NL3 588 aa14.29□□□□□ -0.12
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 LRRC61Q9BV99 259 aa14.29□□□□□ -0.12
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa14.29□□□□□ -0.12
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 CLPBQ9H078 707 aa14.29□□□□□ -0.12
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP14.29□□□□□ -0.12
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 NT5MQ9NPB1 228 aa14.29□□□□□ -0.12
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 ABHD10Q9NUJ1 306 aa14.29□□□□□ -0.12
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP14.29□□□□□ -0.12
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 NLGN3Q9NZ94 848 aa14.29□□□□□ -0.12
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 B4GALT6Q9UBX8 382 aa14.29□□□□□ -0.12
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP14.29□□□□□ -0.12
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 NEMP2A6NFY4 417 aa14.28□□□□□ -0.12
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 MFAP3LO75121 409 aa14.28□□□□□ -0.12
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 ALPPL2P10696 532 aa14.28□□□□□ -0.12
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 CKMT1AP12532 417 aa14.28□□□□□ -0.12
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 TNNT1P13805 278 aa14.28□□□□□ -0.12
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 CTPS1P17812 591 aa14.28□□□□□ -0.12
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 CR2P20023 1033 aa14.28□□□□□ -0.12
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 MMP13P45452 471 aa14.28□□□□□ -0.12
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 SUOXP51687 545 aa14.28□□□□□ -0.12
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 AP1S1P61966 158 aa14.28□□□□□ -0.12
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 PPARDQ03181 441 aa14.28□□□□□ -0.12
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 GBE1Q04446 702 aa14.28□□□□□ -0.12
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 ITKQ08881 620 aa14.28□□□□□ -0.12
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 PTK2BQ14289 1009 aa14.28□□□□□ -0.12
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 ACOX1Q15067 660 aa14.28□□□□□ -0.12
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 ALG11Q2TAA5 492 aa14.28□□□□□ -0.12
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa14.28□□□□□ -0.12
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 MARC1Q5VT66 337 aa14.28□□□□□ -0.12
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 LIPIQ6XZB0 460 aa14.28□□□□□ -0.12
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 DPPA4Q7L190 304 aa14.28□□□□□ -0.12
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 PQLC3Q8N755 202 aa14.28□□□□□ -0.12
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 SLC35G2Q8TBE7 412 aa14.28□□□□□ -0.12
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 NUDCD1Q96RS6 583 aa14.28□□□□□ -0.12
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 APOOQ9BUR5 198 aa14.28□□□□□ -0.12
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 DOCK9Q9BZ29 2069 aa14.28□□□□□ -0.12
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 SPASTQ9UBP0 616 aa14.28□□□□□ -0.12
HCFC1-AS1-201ENST00000438219 HYOU1Q9Y4L1 999 aa14.28□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.9 ms