RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437078.6

RABGEF1-210, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene RABGEF1, Length 4,319 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-210ENST00000437078 PEX1O43933 1283 aa13.65□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 SNAP91O60641 907 aa13.65□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 ACRP10323 421 aa13.65□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 SLC11A2P49281 568 aa13.65□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 RALGDSQ12967 914 aa13.65□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP13.65□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 MBLAC2Q68D91 279 aa13.65□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa13.65□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 OR4K2Q8NGD2 314 aa13.65□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 INPP5DQ92835 1189 aa13.65□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 SUSD3Q96L08 255 aa13.65□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 TRIM62Q9BVG3 475 aa13.65□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 MID1IP1Q9NPA3 183 aa13.65□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 MID2Q9UJV3 735 aa13.65□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 EMCNQ9ULC0 261 aa13.65□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 TIMM22Q9Y584 194 aa13.65□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 NR5A2O00482 541 aa13.65□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 MATN3O15232 486 aa13.65□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP13.65□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 RPL14P50914 215 aaKnown RBP13.65□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 ARSDP51689 593 aa13.65□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 ADAM17P78536 824 aa13.65□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 GALNT2Q10471 571 aa13.65□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 MTA1Q13330 715 aa13.65□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 FLOT2Q14254 428 aa13.65□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP13.65□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa13.65□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP13.65□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP13.65□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 RHOJQ9H4E5 214 aa13.65□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 SAR1AQ9NR31 198 aa13.65□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 RRN3Q9NYV6 651 aa13.65□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa13.65□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa13.65□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa13.65□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa13.65□□□□□ -0.22
RABGEF1-210ENST00000437078 TBX10O75333 385 aa13.64□□□□□ -0.23
RABGEF1-210ENST00000437078 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP13.64□□□□□ -0.23
RABGEF1-210ENST00000437078 SLC2A3P11169 496 aa13.64□□□□□ -0.23
RABGEF1-210ENST00000437078 MLNP12872 115 aa13.64□□□□□ -0.23
RABGEF1-210ENST00000437078 MS4A13Q5J8X5 152 aa13.64□□□□□ -0.23
RABGEF1-210ENST00000437078 ARMC12Q5T9G4 340 aa13.64□□□□□ -0.23
RABGEF1-210ENST00000437078 ZNF697Q5TEC3 545 aa13.64□□□□□ -0.23
RABGEF1-210ENST00000437078 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP13.64□□□□□ -0.23
RABGEF1-210ENST00000437078 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP13.64□□□□□ -0.23
RABGEF1-210ENST00000437078 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa13.64□□□□□ -0.23
RABGEF1-210ENST00000437078 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa13.64□□□□□ -0.23
RABGEF1-210ENST00000437078 MYL4P12829 197 aa13.64□□□□□ -0.23
RABGEF1-210ENST00000437078 RHOAP61586 193 aa13.64□□□□□ -0.23
RABGEF1-210ENST00000437078 VEPH1Q14D04 833 aa13.64□□□□□ -0.23
RABGEF1-210ENST00000437078 CCDC153Q494R4 210 aa13.64□□□□□ -0.23
RABGEF1-210ENST00000437078 DNAL1Q4LDG9 190 aa13.64□□□□□ -0.23
RABGEF1-210ENST00000437078 AGAP9Q5VTM2 703 aa13.64□□□□□ -0.23
RABGEF1-210ENST00000437078 OTOP2Q7RTS6 562 aa13.64□□□□□ -0.23
RABGEF1-210ENST00000437078 ASIC4Q96FT7 647 aa13.64□□□□□ -0.23
RABGEF1-210ENST00000437078 SLC39A3Q9BRY0 314 aa13.64□□□□□ -0.23
RABGEF1-210ENST00000437078 DHRS4Q9BTZ2 278 aa13.64□□□□□ -0.23
RABGEF1-210ENST00000437078 NMRK1Q9NWW6 199 aa13.64□□□□□ -0.23
RABGEF1-210ENST00000437078 HEATR9A2RTY3 570 aa13.64□□□□□ -0.23
RABGEF1-210ENST00000437078 AXIN1O15169 862 aa13.64□□□□□ -0.23
RABGEF1-210ENST00000437078 SLC10A3P09131 477 aa13.64□□□□□ -0.23
RABGEF1-210ENST00000437078 COX4I1P13073 169 aa13.64□□□□□ -0.23
RABGEF1-210ENST00000437078 RAG1P15918 1043 aa13.64□□□□□ -0.23
RABGEF1-210ENST00000437078 TSHRP16473 764 aa13.64□□□□□ -0.23
RABGEF1-210ENST00000437078 VHLP40337 213 aa13.64□□□□□ -0.23
RABGEF1-210ENST00000437078 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP13.64□□□□□ -0.23
RABGEF1-210ENST00000437078 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP13.64□□□□□ -0.23
RABGEF1-210ENST00000437078 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP13.64□□□□□ -0.23
RABGEF1-210ENST00000437078 KIAA2013Q8IYS2 634 aa13.64□□□□□ -0.23
RABGEF1-210ENST00000437078 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP13.64□□□□□ -0.23
RABGEF1-210ENST00000437078 GALNT8Q9NY28 637 aa13.64□□□□□ -0.23
RABGEF1-210ENST00000437078 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP13.64□□□□□ -0.23
RABGEF1-210ENST00000437078 RNF112Q9ULX5 631 aa13.64□□□□□ -0.23
RABGEF1-210ENST00000437078 TCAF1Q9Y4C2 921 aa13.64□□□□□ -0.23
RABGEF1-210ENST00000437078 USP3Q9Y6I4 520 aa13.64□□□□□ -0.23
RABGEF1-210ENST00000437078 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa13.63□□□□□ -0.23
RABGEF1-210ENST00000437078 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP13.63□□□□□ -0.23
RABGEF1-210ENST00000437078 A0A1W2PQY0 241 aa13.63□□□□□ -0.23
RABGEF1-210ENST00000437078 IQCF5A8MTL0 148 aa13.63□□□□□ -0.23
RABGEF1-210ENST00000437078 MPOP05164 745 aa13.63□□□□□ -0.23
RABGEF1-210ENST00000437078 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP13.63□□□□□ -0.23
RABGEF1-210ENST00000437078 GSCP56915 257 aaPredicted RBP13.63□□□□□ -0.23
RABGEF1-210ENST00000437078 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP13.63□□□□□ -0.23
RABGEF1-210ENST00000437078 CYTH1Q15438 398 aa13.63□□□□□ -0.23
RABGEF1-210ENST00000437078 FRMD7Q6ZUT3 714 aa13.63□□□□□ -0.23
RABGEF1-210ENST00000437078 UCMAQ8WVF2 138 aa13.63□□□□□ -0.23
RABGEF1-210ENST00000437078 NTAN1Q96AB6 310 aa13.63□□□□□ -0.23
RABGEF1-210ENST00000437078 VAT1Q99536 393 aa13.63□□□□□ -0.23
RABGEF1-210ENST00000437078 SLC7A8Q9UHI5 535 aa13.63□□□□□ -0.23
RABGEF1-210ENST00000437078 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP13.63□□□□□ -0.23
RABGEF1-210ENST00000437078 MAGEB16A2A368 324 aa13.63□□□□□ -0.23
RABGEF1-210ENST00000437078 BTN3A1O00481 513 aa13.63□□□□□ -0.23
RABGEF1-210ENST00000437078 BAIAP3O94812 1187 aa13.63□□□□□ -0.23
RABGEF1-210ENST00000437078 KRT75O95678 551 aa13.63□□□□□ -0.23
RABGEF1-210ENST00000437078 JUNP05412 331 aaKnown RBP13.63□□□□□ -0.23
RABGEF1-210ENST00000437078 ATP6V1B1P15313 513 aa13.63□□□□□ -0.23
RABGEF1-210ENST00000437078 CD1EP15812 388 aa13.63□□□□□ -0.23
RABGEF1-210ENST00000437078 CES1P23141 567 aa13.63□□□□□ -0.23
RABGEF1-210ENST00000437078 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP13.63□□□□□ -0.23
RABGEF1-210ENST00000437078 ECT2LQ008S8 904 aa13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.2 ms