RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429595.1

PTPRK-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRK, Length 558 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-211ENST00000429595 NFATC1O95644 943 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 BPIP17213 487 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 TNFRSF8P28908 595 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 TUFMP49411 452 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 FOXF2Q12947 444 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 GLRA4Q5JXX5 417 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 PPP4R3AQ6IN85 833 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 ARMCX5Q6P1M9 558 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 ANO5Q75V66 913 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 USP37Q86T82 979 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 EXD3Q8N9H8 876 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 TSPEARQ8WU66 669 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 GTF3C6Q969F1 213 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 NACC2Q96BF6 587 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 MOCOSQ96EN8 888 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 PNKPQ96T60 521 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 BCO1Q9HAY6 547 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 STARD5Q9NSY2 213 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 RCOR1Q9UKL0 485 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 CCL26Q9Y258 94 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 SIK3Q9Y2K2 1263 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 WNT6Q9Y6F9 365 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 LAMA1P25391 3075 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 A0A087X0B3 334 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 E2F8A0AVK6 867 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 LAD1O00515 517 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 PODXLO00592 558 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 B4GALT5O43286 388 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 RRP9O43818 475 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 PRSS23O95084 383 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 GABRG2P18507 467 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 ENPP1P22413 925 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 RARRES1P49788 294 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 CCT8P50990 548 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 CCT2P78371 535 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 CDK17Q00537 523 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 MBTD1Q05BQ5 628 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 POU5F1BQ06416 359 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 ST3GAL1Q11201 340 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 EMC2Q15006 297 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 NAB2Q15742 525 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP6.55□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 SPDYE7PQ495Y7 208 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 AFMIDQ63HM1 303 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 KDM7AQ6ZMT4 941 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 EFCAB13Q8IY85 973 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 TMTC2Q8N394 836 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 CLRN3Q8NCR9 226 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 NCOA7Q8NI08 942 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 SPATA20Q8TB22 786 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 RNF31Q96EP0 1072 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 HIC2Q96JB3 615 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 DRC1Q96MC2 740 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 MMS19Q96T76 1030 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 MRI1Q9BV20 369 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 KIAA1586Q9HCI6 787 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 C6orf50Q9HD87 102 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 THSD1Q9NS62 852 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 SLC38A7Q9NVC3 462 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 SCOCQ9UIL1 159 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 PLAAQ9Y263 795 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 NOX1Q9Y5S8 564 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 GON4LQ3T8J9 2241 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 A0A1B0GVT2 93 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 TBC1D3BA6NDS4 549 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 LRRC3CA6NJW4 275 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 MSH4O15457 936 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 PCDHGA12O60330 932 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 DFNA5O60443 496 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 AGFG2O95081 481 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 STBD1O95210 358 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 KAT7O95251 611 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 HOXB2P14652 356 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 SLC6A2P23975 617 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 CD6P30203 668 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 TNFRSF4P43489 277 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 QARSP47897 775 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 ERVPABLB-1P60509 514 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 SP140Q13342 867 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 IGFBP7Q16270 282 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 XKR9Q5GH70 373 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 EMC10Q5UCC4 262 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 DCAF12L1Q5VU92 463 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 TXNDC8Q6A555 127 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRK-211ENST00000429595 CENPPQ6IPU0 288 aa6.54□□□□□ -1.36
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