RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331163.10

PDGFB-201, Transcript of platelet derived growth factor subunit B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDGFB, Length 3,497 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFB-201ENST00000331163 TXLNGYQ9BZA5 131 aa15.99■□□□□ 0.15
PDGFB-201ENST00000331163 ZFP14Q9HCL3 533 aa15.99■□□□□ 0.15
PDGFB-201ENST00000331163 NPHS2Q9NP85 383 aa15.99■□□□□ 0.15
PDGFB-201ENST00000331163 DYRK4Q9NR20 520 aa15.99■□□□□ 0.15
PDGFB-201ENST00000331163 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
PDGFB-201ENST00000331163 A0A1B0GVG6 124 aa15.99■□□□□ 0.15
PDGFB-201ENST00000331163 ANTXRLA6NF34 631 aa15.99■□□□□ 0.15
PDGFB-201ENST00000331163 AGRPO00253 132 aa15.99■□□□□ 0.15
PDGFB-201ENST00000331163 AP2A1O95782 977 aa15.99■□□□□ 0.15
PDGFB-201ENST00000331163 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
PDGFB-201ENST00000331163 ALDH3A1P30838 453 aa15.99■□□□□ 0.15
PDGFB-201ENST00000331163 FOXN2P32314 431 aa15.99■□□□□ 0.15
PDGFB-201ENST00000331163 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
PDGFB-201ENST00000331163 IL9RQ01113 521 aa15.99■□□□□ 0.15
PDGFB-201ENST00000331163 CFAP157Q5JU67 520 aa15.99■□□□□ 0.15
PDGFB-201ENST00000331163 FAM13CQ8NE31 585 aa15.99■□□□□ 0.15
PDGFB-201ENST00000331163 TCP10LQ8TDR4 215 aa15.99■□□□□ 0.15
PDGFB-201ENST00000331163 PBXIP1Q96AQ6 731 aa15.99■□□□□ 0.15
PDGFB-201ENST00000331163 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
PDGFB-201ENST00000331163 ZNF576Q9H609 170 aa15.99■□□□□ 0.15
PDGFB-201ENST00000331163 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa15.99■□□□□ 0.15
PDGFB-201ENST00000331163 DEC1Q9P2X7 70 aa15.99■□□□□ 0.15
PDGFB-201ENST00000331163 MUSKO15146 869 aa15.98■□□□□ 0.15
PDGFB-201ENST00000331163 MTX2O75431 263 aa15.98■□□□□ 0.15
PDGFB-201ENST00000331163 UNC5CO95185 931 aa15.98■□□□□ 0.15
PDGFB-201ENST00000331163 ZCCHC18P0CG32 403 aa15.98■□□□□ 0.15
PDGFB-201ENST00000331163 KLC1Q07866 573 aa15.98■□□□□ 0.15
PDGFB-201ENST00000331163 ARHGEF7Q14155 803 aa15.98■□□□□ 0.15
PDGFB-201ENST00000331163 CSHL1Q14406 222 aa15.98■□□□□ 0.15
PDGFB-201ENST00000331163 KCNJ11Q14654 390 aa15.98■□□□□ 0.15
PDGFB-201ENST00000331163 MPPE1Q53F39 396 aa15.98■□□□□ 0.15
PDGFB-201ENST00000331163 NXNQ6DKJ4 435 aa15.98■□□□□ 0.15
PDGFB-201ENST00000331163 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
PDGFB-201ENST00000331163 LINC00523Q86TU6 105 aa15.98■□□□□ 0.15
PDGFB-201ENST00000331163 PLD4Q96BZ4 506 aa15.98■□□□□ 0.15
PDGFB-201ENST00000331163 CERS2Q96G23 380 aa15.98■□□□□ 0.15
PDGFB-201ENST00000331163 SLC39A13Q96H72 371 aa15.98■□□□□ 0.15
PDGFB-201ENST00000331163 FEM1AQ9BSK4 669 aa15.98■□□□□ 0.15
PDGFB-201ENST00000331163 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa15.98■□□□□ 0.15
PDGFB-201ENST00000331163 PKP3Q9Y446 797 aa15.98■□□□□ 0.15
PDGFB-201ENST00000331163 TSPAN8P19075 237 aa15.98■□□□□ 0.15
PDGFB-201ENST00000331163 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
PDGFB-201ENST00000331163 SERINC3Q13530 473 aa15.98■□□□□ 0.15
PDGFB-201ENST00000331163 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
PDGFB-201ENST00000331163 SLC26A11Q86WA9 606 aa15.98■□□□□ 0.15
PDGFB-201ENST00000331163 PPP4R1Q8TF05 950 aa15.98■□□□□ 0.15
PDGFB-201ENST00000331163 CKAP2Q8WWK9 683 aa15.98■□□□□ 0.15
PDGFB-201ENST00000331163 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
PDGFB-201ENST00000331163 ZNF236Q9UL36 1845 aa15.98■□□□□ 0.15
PDGFB-201ENST00000331163 PCDH8O95206 1070 aa15.98■□□□□ 0.15
PDGFB-201ENST00000331163 EPHX1P07099 455 aa15.98■□□□□ 0.15
PDGFB-201ENST00000331163 BMP1P13497 986 aa15.98■□□□□ 0.15
PDGFB-201ENST00000331163 CALB2P22676 271 aa15.98■□□□□ 0.15
PDGFB-201ENST00000331163 FMO4P31512 558 aa15.98■□□□□ 0.15
PDGFB-201ENST00000331163 CPA2P48052 419 aa15.98■□□□□ 0.15
PDGFB-201ENST00000331163 CLCN4P51793 760 aa15.98■□□□□ 0.15
PDGFB-201ENST00000331163 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
PDGFB-201ENST00000331163 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa15.98■□□□□ 0.15
PDGFB-201ENST00000331163 EPOPA6NHQ4 379 aa15.97■□□□□ 0.15
PDGFB-201ENST00000331163 GM2AP17900 193 aa15.97■□□□□ 0.15
PDGFB-201ENST00000331163 PARP15Q460N3 678 aa15.97■□□□□ 0.15
PDGFB-201ENST00000331163 NEPROQ6NW34 567 aa15.97■□□□□ 0.15
PDGFB-201ENST00000331163 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa15.97■□□□□ 0.15
PDGFB-201ENST00000331163 MCUR1Q96AQ8 359 aa15.97■□□□□ 0.15
PDGFB-201ENST00000331163 PRKD2Q9BZL6 878 aa15.97■□□□□ 0.15
PDGFB-201ENST00000331163 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa15.97■□□□□ 0.15
PDGFB-201ENST00000331163 PHTF1Q9UMS5 762 aa15.97■□□□□ 0.15
PDGFB-201ENST00000331163 RWDD3Q9Y3V2 267 aa15.97■□□□□ 0.15
PDGFB-201ENST00000331163 ASB3Q9Y575 518 aa15.97■□□□□ 0.15
PDGFB-201ENST00000331163 CHD9Q3L8U1 2897 aa15.97■□□□□ 0.15
PDGFB-201ENST00000331163 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
PDGFB-201ENST00000331163 HEPACAM2A8MVW5 462 aa15.97■□□□□ 0.15
PDGFB-201ENST00000331163 SCAPQ12770 1279 aa15.97■□□□□ 0.15
PDGFB-201ENST00000331163 CROCCP2Q86T23 111 aa15.97■□□□□ 0.15
PDGFB-201ENST00000331163 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
PDGFB-201ENST00000331163 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
PDGFB-201ENST00000331163 SLC17A7Q9P2U7 560 aa15.97■□□□□ 0.15
PDGFB-201ENST00000331163 CRLS1Q9UJA2 301 aa15.97■□□□□ 0.15
PDGFB-201ENST00000331163 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
PDGFB-201ENST00000331163 INPP4BO15327 924 aa15.96■□□□□ 0.15
PDGFB-201ENST00000331163 GSTA2P09210 222 aa15.96■□□□□ 0.15
PDGFB-201ENST00000331163 UGT1A6P19224 532 aa15.96■□□□□ 0.15
PDGFB-201ENST00000331163 UGT1A1P22309 533 aa15.96■□□□□ 0.15
PDGFB-201ENST00000331163 UGT1A4P22310 534 aa15.96■□□□□ 0.15
PDGFB-201ENST00000331163 UGT1A3P35503 534 aa15.96■□□□□ 0.15
PDGFB-201ENST00000331163 UGT1A5P35504 534 aa15.96■□□□□ 0.15
PDGFB-201ENST00000331163 DGKGP49619 791 aa15.96■□□□□ 0.15
PDGFB-201ENST00000331163 RCN1Q15293 331 aa15.96■□□□□ 0.15
PDGFB-201ENST00000331163 SEC14L1Q92503 715 aa15.96■□□□□ 0.15
PDGFB-201ENST00000331163 PHF21BQ96EK2 531 aa15.96■□□□□ 0.15
PDGFB-201ENST00000331163 VAT1Q99536 393 aa15.96■□□□□ 0.15
PDGFB-201ENST00000331163 IL21Q9HBE4 155 aa15.96■□□□□ 0.15
PDGFB-201ENST00000331163 LATS2Q9NRM7 1088 aa15.96■□□□□ 0.15
PDGFB-201ENST00000331163 WDR70Q9NW82 654 aa15.96■□□□□ 0.15
PDGFB-201ENST00000331163 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
PDGFB-201ENST00000331163 USH1CQ9Y6N9 552 aa15.96■□□□□ 0.15
PDGFB-201ENST00000331163 C2orf81A6NN90 581 aa15.96■□□□□ 0.15
PDGFB-201ENST00000331163 AURKAO14965 403 aa15.96■□□□□ 0.15
PDGFB-201ENST00000331163 TIE1P35590 1138 aa15.96■□□□□ 0.15
PDGFB-201ENST00000331163 PFKPQ01813 784 aa15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.1 ms