RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000321027.7

GCFC2-201, Transcript of GC-rich sequence DNA-binding factor 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GCFC2, Length 4,440 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCFC2-201ENST00000321027 TRIM17Q9Y577 477 aa15.49■□□□□ 0.07
GCFC2-201ENST00000321027 MYH7BA7E2Y1 1941 aa15.49■□□□□ 0.07
GCFC2-201ENST00000321027 AMHP03971 560 aa15.49■□□□□ 0.07
GCFC2-201ENST00000321027 URODP06132 367 aa15.49■□□□□ 0.07
GCFC2-201ENST00000321027 GSTM1P09488 218 aa15.49■□□□□ 0.07
GCFC2-201ENST00000321027 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
GCFC2-201ENST00000321027 SOWAHAQ2M3V2 549 aa15.49■□□□□ 0.07
GCFC2-201ENST00000321027 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
GCFC2-201ENST00000321027 FBXO48Q5FWF7 155 aa15.49■□□□□ 0.07
GCFC2-201ENST00000321027 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa15.49■□□□□ 0.07
GCFC2-201ENST00000321027 HEATR4Q86WZ0 1026 aa15.49■□□□□ 0.07
GCFC2-201ENST00000321027 KLHL25Q9H0H3 589 aa15.49■□□□□ 0.07
GCFC2-201ENST00000321027 ATP13A1Q9HD20 1204 aa15.49■□□□□ 0.07
GCFC2-201ENST00000321027 ABCC13Q9NSE7 274 aa15.49■□□□□ 0.07
GCFC2-201ENST00000321027 SH3BP4Q9P0V3 963 aa15.49■□□□□ 0.07
GCFC2-201ENST00000321027 TMCC3Q9ULS5 477 aa15.49■□□□□ 0.07
GCFC2-201ENST00000321027 AP2A1O95782 977 aa15.49■□□□□ 0.07
GCFC2-201ENST00000321027 L1CAMP32004 1257 aa15.49■□□□□ 0.07
GCFC2-201ENST00000321027 SQLEQ14534 574 aa15.49■□□□□ 0.07
GCFC2-201ENST00000321027 LGI2Q8N0V4 545 aa15.49■□□□□ 0.07
GCFC2-201ENST00000321027 PRKAG3Q9UGI9 489 aa15.49■□□□□ 0.07
GCFC2-201ENST00000321027 TAF1P21675 1872 aa15.49■□□□□ 0.07
GCFC2-201ENST00000321027 BCL10O95999 233 aa15.48■□□□□ 0.07
GCFC2-201ENST00000321027 PCNAP12004 261 aa15.48■□□□□ 0.07
GCFC2-201ENST00000321027 NMBRP28336 390 aa15.48■□□□□ 0.07
GCFC2-201ENST00000321027 PSEN1P49768 467 aa15.48■□□□□ 0.07
GCFC2-201ENST00000321027 OLIG2Q13516 323 aa15.48■□□□□ 0.07
GCFC2-201ENST00000321027 DENND6AQ8IWF6 608 aa15.48■□□□□ 0.07
GCFC2-201ENST00000321027 FAM47BQ8NA70 645 aa15.48■□□□□ 0.07
GCFC2-201ENST00000321027 SPPL2AQ8TCT8 520 aa15.48■□□□□ 0.07
GCFC2-201ENST00000321027 SH3GL1Q99961 368 aa15.48■□□□□ 0.07
GCFC2-201ENST00000321027 C1orf50Q9BV19 199 aa15.48■□□□□ 0.07
GCFC2-201ENST00000321027 DERAQ9Y315 318 aa15.48■□□□□ 0.07
GCFC2-201ENST00000321027 A8MX80 341 aa15.48■□□□□ 0.07
GCFC2-201ENST00000321027 SEMA5AQ13591 1074 aa15.48■□□□□ 0.07
GCFC2-201ENST00000321027 KCNJ11Q14654 390 aa15.48■□□□□ 0.07
GCFC2-201ENST00000321027 TRAF7Q6Q0C0 670 aa15.48■□□□□ 0.07
GCFC2-201ENST00000321027 CUZD1Q86UP6 607 aa15.48■□□□□ 0.07
GCFC2-201ENST00000321027 OSCP1Q8WVF1 389 aa15.48■□□□□ 0.07
GCFC2-201ENST00000321027 DGCR6LQ9BY27 220 aa15.48■□□□□ 0.07
GCFC2-201ENST00000321027 GIMAP4Q9NUV9 329 aa15.48■□□□□ 0.07
GCFC2-201ENST00000321027 MARCH2Q9P0N8 246 aa15.48■□□□□ 0.07
GCFC2-201ENST00000321027 VWA7Q9Y334 891 aa15.48■□□□□ 0.07
GCFC2-201ENST00000321027 TRAF6Q9Y4K3 522 aa15.48■□□□□ 0.07
GCFC2-201ENST00000321027 RGS20O76081 388 aa15.48■□□□□ 0.07
GCFC2-201ENST00000321027 LRIG2O94898 1065 aa15.48■□□□□ 0.07
GCFC2-201ENST00000321027 LINC00032P0C843 101 aa15.48■□□□□ 0.07
GCFC2-201ENST00000321027 CLCN5P51795 746 aa15.48■□□□□ 0.07
GCFC2-201ENST00000321027 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
GCFC2-201ENST00000321027 IL27RAQ6UWB1 636 aa15.48■□□□□ 0.07
GCFC2-201ENST00000321027 FBXO30Q8TB52 745 aa15.48■□□□□ 0.07
GCFC2-201ENST00000321027 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
GCFC2-201ENST00000321027 PEBP4Q96S96 227 aa15.48■□□□□ 0.07
GCFC2-201ENST00000321027 YME1L1Q96TA2 773 aa15.48■□□□□ 0.07
GCFC2-201ENST00000321027 KRT84Q9NSB2 600 aa15.48■□□□□ 0.07
GCFC2-201ENST00000321027 KRT87PA6NCN2 255 aa15.48■□□□□ 0.07
GCFC2-201ENST00000321027 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
GCFC2-201ENST00000321027 PPEF2O14830 753 aa15.48■□□□□ 0.07
GCFC2-201ENST00000321027 HCRTO43612 131 aa15.48■□□□□ 0.07
GCFC2-201ENST00000321027 KRT75O95678 551 aa15.48■□□□□ 0.07
GCFC2-201ENST00000321027 KRT6AP02538 564 aa15.48■□□□□ 0.07
GCFC2-201ENST00000321027 KRT6BP04259 564 aa15.48■□□□□ 0.07
GCFC2-201ENST00000321027 KRT6CP48668 564 aa15.48■□□□□ 0.07
GCFC2-201ENST00000321027 STARD3Q14849 445 aa15.48■□□□□ 0.07
GCFC2-201ENST00000321027 ZNF284Q2VY69 593 aa15.48■□□□□ 0.07
GCFC2-201ENST00000321027 PRMT9Q6P2P2 845 aa15.48■□□□□ 0.07
GCFC2-201ENST00000321027 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa15.48■□□□□ 0.07
GCFC2-201ENST00000321027 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
GCFC2-201ENST00000321027 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
GCFC2-201ENST00000321027 GLOD4Q9HC38 313 aa15.48■□□□□ 0.07
GCFC2-201ENST00000321027 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa15.48■□□□□ 0.07
GCFC2-201ENST00000321027 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
GCFC2-201ENST00000321027 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa15.48■□□□□ 0.07
GCFC2-201ENST00000321027 AKAP11Q9UKA4 1901 aa15.48■□□□□ 0.07
GCFC2-201ENST00000321027 MOGSQ13724 837 aa15.47■□□□□ 0.07
GCFC2-201ENST00000321027 ERAP2Q6P179 960 aa15.47■□□□□ 0.07
GCFC2-201ENST00000321027 POTEHQ6S545 545 aa15.47■□□□□ 0.07
GCFC2-201ENST00000321027 TOP6BLQ8N6T0 577 aa15.47■□□□□ 0.07
GCFC2-201ENST00000321027 OR56A4Q8NGH8 313 aa15.47■□□□□ 0.07
GCFC2-201ENST00000321027 CASP10Q92851 521 aa15.47■□□□□ 0.07
GCFC2-201ENST00000321027 SYT11Q9BT88 431 aa15.47■□□□□ 0.07
GCFC2-201ENST00000321027 RNF208Q9H0X6 261 aa15.47■□□□□ 0.07
GCFC2-201ENST00000321027 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa15.47■□□□□ 0.07
GCFC2-201ENST00000321027 COMMD8Q9NX08 183 aa15.47■□□□□ 0.07
GCFC2-201ENST00000321027 ANAPC2Q9UJX6 822 aa15.47■□□□□ 0.07
GCFC2-201ENST00000321027 GIT1Q9Y2X7 761 aa15.47■□□□□ 0.07
GCFC2-201ENST00000321027 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
GCFC2-201ENST00000321027 MAP3K13O43283 966 aa15.47■□□□□ 0.07
GCFC2-201ENST00000321027 NRP2O60462 931 aa15.47■□□□□ 0.07
GCFC2-201ENST00000321027 EFCAB14O75071 495 aa15.47■□□□□ 0.07
GCFC2-201ENST00000321027 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
GCFC2-201ENST00000321027 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
GCFC2-201ENST00000321027 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
GCFC2-201ENST00000321027 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
GCFC2-201ENST00000321027 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
GCFC2-201ENST00000321027 METTL21CQ5VZV1 264 aa15.47■□□□□ 0.07
GCFC2-201ENST00000321027 CLEC6AQ6EIG7 209 aa15.47■□□□□ 0.07
GCFC2-201ENST00000321027 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
GCFC2-201ENST00000321027 CDYL2Q8N8U2 506 aa15.47■□□□□ 0.07
GCFC2-201ENST00000321027 ITFG1Q8TB96 612 aa15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.2 ms