RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284957.9

RABGEF1-201, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-201ENST00000284957 ZWINTO95229 277 aa9.4□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 FSHRP23945 695 aa9.4□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 GKP32189 559 aa9.4□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 GMPRP36959 345 aa9.4□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 MPP1Q00013 466 aa9.4□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 DNAJC3Q13217 504 aa9.4□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 DHCR24Q15392 516 aa9.4□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 QPCTQ16769 361 aa9.4□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 EML3Q32P44 896 aa9.4□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 LVRNQ6Q4G3 990 aa9.4□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 TDHQ8IZJ6 230 aa9.4□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 DCLK2Q8N568 766 aa9.4□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 ISL2Q96A47 359 aa9.4□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC13A1Q9BZW2 595 aa9.4□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 TNKS2Q9H2K2 1166 aa9.4□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 DZANK1Q9NVP4 752 aa9.4□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 TXNDC16Q9P2K2 825 aa9.4□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa9.4□□□□□ -0.9
RABGEF1-201ENST00000284957 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa9.4□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 TM9SF1O15321 606 aa9.4□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 FAM107AO95990 144 aa9.4□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 CYP17A1P05093 508 aa9.4□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 DHRS4L1P0CG22 281 aa9.4□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 FCARP24071 287 aa9.4□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 BMP8BP34820 402 aa9.4□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC1A2P43004 574 aa9.4□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 MAGEA12P43365 314 aa9.4□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 CSRP3P50461 194 aa9.4□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 PPM1JQ5JR12 505 aa9.4□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 CMC1Q7Z7K0 106 aa9.4□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 CAMK1DQ8IU85 385 aa9.4□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 MFSD6LQ8IWD5 586 aa9.4□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 NDUFAF2Q8N183 169 aa9.4□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 LPCAT1Q8NF37 534 aa9.4□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 OR13C4Q8NGS5 318 aa9.4□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 OSCP1Q8WVF1 389 aa9.4□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 RMDN1Q96DB5 314 aa9.4□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 CHMP6Q96FZ7 201 aa9.4□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 VPS39Q96JC1 886 aa9.4□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 ZFYVE19Q96K21 471 aa9.4□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 PCMTD2Q9NV79 361 aa9.4□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 MKS1Q9NXB0 559 aa9.4□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa9.4□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 FBXO10Q9UK96 956 aa9.4□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 A0A0U1RQS6 177 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 OR51F1A6NGY5 319 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 PAMP19021 973 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 DRD4P21917 467 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 RALGPS1Q5JS13 557 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 NEPROQ6NW34 567 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 C12orf40Q86WS4 652 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 DYDC1Q8WWB3 177 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 SMARCD2Q92925 531 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 HDAC10Q969S8 669 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 TBATAQ96M53 351 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 CAB39LQ9H9S4 337 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 COPEO14579 308 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 PIGNO95427 931 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 SPRP35270 261 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 CSNK1DP48730 415 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 PGGT1BP53609 377 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 AP1S1P61966 158 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 MESP2Q0VG99 397 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 GRM3Q14832 879 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 DLG2Q15700 870 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 GEN1Q17RS7 908 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF789Q5FWF6 425 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF470Q6ECI4 717 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 ANKRD54Q6NXT1 300 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 NLRP9Q7RTR0 991 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 TAX1BP1Q86VP1 789 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 PACS2Q86VP3 889 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 LRRC34Q8IZ02 419 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 EFHBQ8N7U6 833 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 SPOCK2Q92563 424 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 PTPRN2Q92932 1015 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 FAM111AQ96PZ2 611 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 FAM107BQ9H098 131 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
RABGEF1-201ENST00000284957 PLLPQ9Y342 182 aa9.39□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.6 ms