RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000277657.12

CCDC7-201, Transcript of coiled-coil domain containing 7, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC7, Length 1,899 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7-201ENST00000277657 PIRTP0C851 137 aa22.19■■□□□ 1.14
CCDC7-201ENST00000277657 PSMA3P25788 255 aa22.19■■□□□ 1.14
CCDC7-201ENST00000277657 HLA-FP30511 346 aa22.19■■□□□ 1.14
CCDC7-201ENST00000277657 AP1S1P61966 158 aa22.19■■□□□ 1.14
CCDC7-201ENST00000277657 CLEC14AQ86T13 490 aa22.19■■□□□ 1.14
CCDC7-201ENST00000277657 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
CCDC7-201ENST00000277657 STYXQ8WUJ0 223 aa22.19■■□□□ 1.14
CCDC7-201ENST00000277657 RMDN1Q96DB5 314 aa22.19■■□□□ 1.14
CCDC7-201ENST00000277657 PBX4Q9BYU1 374 aa22.19■■□□□ 1.14
CCDC7-201ENST00000277657 LMAN2LQ9H0V9 348 aa22.19■■□□□ 1.14
CCDC7-201ENST00000277657 SIRPGQ9P1W8 387 aa22.19■■□□□ 1.14
CCDC7-201ENST00000277657 MYOFQ9NZM1 2061 aa22.19■■□□□ 1.14
CCDC7-201ENST00000277657 A0A096LPK6 155 aa22.18■■□□□ 1.14
CCDC7-201ENST00000277657 KLF11O14901 512 aa22.18■■□□□ 1.14
CCDC7-201ENST00000277657 BIRC5O15392 142 aa22.18■■□□□ 1.14
CCDC7-201ENST00000277657 FZD6O60353 706 aa22.18■■□□□ 1.14
CCDC7-201ENST00000277657 CRTAMO95727 393 aa22.18■■□□□ 1.14
CCDC7-201ENST00000277657 GSRP00390 522 aa22.18■■□□□ 1.14
CCDC7-201ENST00000277657 CD151P48509 253 aa22.18■■□□□ 1.14
CCDC7-201ENST00000277657 CSNK1DP48730 415 aa22.18■■□□□ 1.14
CCDC7-201ENST00000277657 DLG2Q15700 870 aa22.18■■□□□ 1.14
CCDC7-201ENST00000277657 PITRM1Q5JRX3 1037 aa22.18■■□□□ 1.14
CCDC7-201ENST00000277657 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
CCDC7-201ENST00000277657 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
CCDC7-201ENST00000277657 SPATA21Q7Z572 469 aa22.18■■□□□ 1.14
CCDC7-201ENST00000277657 ITFG1Q8TB96 612 aa22.18■■□□□ 1.14
CCDC7-201ENST00000277657 ING5Q8WYH8 240 aa22.18■■□□□ 1.14
CCDC7-201ENST00000277657 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
CCDC7-201ENST00000277657 OTUB2Q96DC9 234 aa22.18■■□□□ 1.14
CCDC7-201ENST00000277657 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
CCDC7-201ENST00000277657 LINC00597Q9H2U6 94 aa22.18■■□□□ 1.14
CCDC7-201ENST00000277657 SPHK2Q9NRA0 654 aa22.18■■□□□ 1.14
CCDC7-201ENST00000277657 SLC39A10Q9ULF5 831 aa22.18■■□□□ 1.14
CCDC7-201ENST00000277657 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
CCDC7-201ENST00000277657 CDH23Q9H251 3354 aa22.18■■□□□ 1.14
CCDC7-201ENST00000277657 ANKRD66B4E2M5 251 aa22.17■■□□□ 1.14
CCDC7-201ENST00000277657 PLIN3O60664 434 aa22.17■■□□□ 1.14
CCDC7-201ENST00000277657 C2P06681 752 aa22.17■■□□□ 1.14
CCDC7-201ENST00000277657 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
CCDC7-201ENST00000277657 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
CCDC7-201ENST00000277657 PRAMEP78395 509 aa22.17■■□□□ 1.14
CCDC7-201ENST00000277657 CILP2Q8IUL8 1156 aa22.17■■□□□ 1.14
CCDC7-201ENST00000277657 ANKS4BQ8N8V4 417 aa22.17■■□□□ 1.14
CCDC7-201ENST00000277657 LPCAT1Q8NF37 534 aa22.17■■□□□ 1.14
CCDC7-201ENST00000277657 TBATAQ96M53 351 aa22.17■■□□□ 1.14
CCDC7-201ENST00000277657 PIDD1Q9HB75 910 aa22.17■■□□□ 1.14
CCDC7-201ENST00000277657 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
CCDC7-201ENST00000277657 RPP40O75818 363 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
CCDC7-201ENST00000277657 HAUS5O94927 633 aa22.17■■□□□ 1.14
CCDC7-201ENST00000277657 BPGMP07738 259 aa22.17■■□□□ 1.14
CCDC7-201ENST00000277657 WEE1P30291 646 aa22.17■■□□□ 1.14
CCDC7-201ENST00000277657 NRIP1P48552 1158 aa22.17■■□□□ 1.14
CCDC7-201ENST00000277657 KCNC3Q14003 757 aa22.17■■□□□ 1.14
CCDC7-201ENST00000277657 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
CCDC7-201ENST00000277657 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
CCDC7-201ENST00000277657 DBN1Q16643 649 aa22.17■■□□□ 1.14
CCDC7-201ENST00000277657 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
CCDC7-201ENST00000277657 C16orf46Q6P387 395 aa22.17■■□□□ 1.14
CCDC7-201ENST00000277657 MFSD6LQ8IWD5 586 aa22.17■■□□□ 1.14
CCDC7-201ENST00000277657 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
CCDC7-201ENST00000277657 OR6P1Q8NGX9 317 aa22.17■■□□□ 1.14
CCDC7-201ENST00000277657 BBS2Q9BXC9 721 aa22.17■■□□□ 1.14
CCDC7-201ENST00000277657 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
CCDC7-201ENST00000277657 CEP290O15078 2479 aa22.17■■□□□ 1.14
CCDC7-201ENST00000277657 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
CCDC7-201ENST00000277657 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
CCDC7-201ENST00000277657 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa22.16■■□□□ 1.14
CCDC7-201ENST00000277657 CCL22O00626 93 aa22.16■■□□□ 1.14
CCDC7-201ENST00000277657 PROCP04070 461 aa22.16■■□□□ 1.14
CCDC7-201ENST00000277657 BGNP21810 368 aa22.16■■□□□ 1.14
CCDC7-201ENST00000277657 USP10Q14694 798 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
CCDC7-201ENST00000277657 PTPRCAPQ14761 206 aa22.16■■□□□ 1.14
CCDC7-201ENST00000277657 FUT11Q495W5 492 aa22.16■■□□□ 1.14
CCDC7-201ENST00000277657 OTOAQ7RTW8 1153 aa22.16■■□□□ 1.14
CCDC7-201ENST00000277657 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
CCDC7-201ENST00000277657 TRIM42Q8IWZ5 723 aa22.16■■□□□ 1.14
CCDC7-201ENST00000277657 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa22.16■■□□□ 1.14
CCDC7-201ENST00000277657 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
CCDC7-201ENST00000277657 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
CCDC7-201ENST00000277657 MDGA1Q8NFP4 955 aa22.16■■□□□ 1.14
CCDC7-201ENST00000277657 OR13C4Q8NGS5 318 aa22.16■■□□□ 1.14
CCDC7-201ENST00000277657 GPR150Q8NGU9 434 aa22.16■■□□□ 1.14
CCDC7-201ENST00000277657 MECRQ9BV79 373 aa22.16■■□□□ 1.14
CCDC7-201ENST00000277657 TM6SF2Q9BZW4 377 aa22.16■■□□□ 1.14
CCDC7-201ENST00000277657 MARK1Q9P0L2 795 aa22.16■■□□□ 1.14
CCDC7-201ENST00000277657 TMEM216Q9P0N5 145 aa22.16■■□□□ 1.14
CCDC7-201ENST00000277657 HS3ST2Q9Y278 367 aa22.16■■□□□ 1.14
CCDC7-201ENST00000277657 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa22.15■■□□□ 1.14
CCDC7-201ENST00000277657 AURKAO14965 403 aa22.15■■□□□ 1.14
CCDC7-201ENST00000277657 BUD23O43709 281 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
CCDC7-201ENST00000277657 IL1BP01584 269 aa22.15■■□□□ 1.14
CCDC7-201ENST00000277657 GMPRP36959 345 aa22.15■■□□□ 1.14
CCDC7-201ENST00000277657 MAPK8P45983 427 aa22.15■■□□□ 1.14
CCDC7-201ENST00000277657 KIAA1958Q8N8K9 716 aa22.15■■□□□ 1.14
CCDC7-201ENST00000277657 VN1R2Q8NFZ6 395 aa22.15■■□□□ 1.14
CCDC7-201ENST00000277657 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa22.15■■□□□ 1.14
CCDC7-201ENST00000277657 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa22.15■■□□□ 1.14
CCDC7-201ENST00000277657 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
CCDC7-201ENST00000277657 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
CCDC7-201ENST00000277657 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.2 ms