RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3-205ENST00000563559 VAMP4O75379 141 aa23.2■■□□□ 1.3
RRN3-205ENST00000563559 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
RRN3-205ENST00000563559 ANTXR1Q9H6X2 564 aa23.2■■□□□ 1.3
RRN3-205ENST00000563559 PIK3R4Q99570 1358 aa23.2■■□□□ 1.3
RRN3-205ENST00000563559 ZNF853P0CG23 659 aa23.2■■□□□ 1.3
RRN3-205ENST00000563559 FBLN1P23142 703 aa23.2■■□□□ 1.3
RRN3-205ENST00000563559 NME9Q86XW9 330 aa23.2■■□□□ 1.3
RRN3-205ENST00000563559 PTCH1Q13635 1447 aa23.19■■□□□ 1.3
RRN3-205ENST00000563559 MON2Q7Z3U7 1717 aa23.19■■□□□ 1.3
RRN3-205ENST00000563559 MLECQ14165 292 aa23.18■■□□□ 1.3
RRN3-205ENST00000563559 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
RRN3-205ENST00000563559 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
RRN3-205ENST00000563559 TXNDC2Q86VQ3 553 aa23.18■■□□□ 1.3
RRN3-205ENST00000563559 GCC1Q96CN9 775 aa23.17■■□□□ 1.3
RRN3-205ENST00000563559 CFAP44Q96MT7 982 aa23.17■■□□□ 1.3
RRN3-205ENST00000563559 CPS1P31327 1500 aa23.16■■□□□ 1.3
RRN3-205ENST00000563559 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
RRN3-205ENST00000563559 CHD1LQ86WJ1 897 aa23.16■■□□□ 1.3
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RRN3-205ENST00000563559 MBIPQ9NS73 344 aa23.15■■□□□ 1.3
RRN3-205ENST00000563559 AKAP12Q02952 1782 aa23.14■■□□□ 1.29
RRN3-205ENST00000563559 ITSN1Q15811 1721 aa23.13■■□□□ 1.29
RRN3-205ENST00000563559 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
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RRN3-205ENST00000563559 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
RRN3-205ENST00000563559 ABCC4O15439 1325 aa23.12■■□□□ 1.29
RRN3-205ENST00000563559 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
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RRN3-205ENST00000563559 TSPYL6Q8N831 410 aa23.11■■□□□ 1.29
RRN3-205ENST00000563559 LNPKQ9C0E8 428 aa23.11■■□□□ 1.29
RRN3-205ENST00000563559 ZRANB1Q9UGI0 708 aa23.11■■□□□ 1.29
RRN3-205ENST00000563559 KIF24Q5T7B8 1368 aa23.1■■□□□ 1.29
RRN3-205ENST00000563559 DLG5Q8TDM6 1919 aa23.1■■□□□ 1.29
RRN3-205ENST00000563559 TNRQ92752 1358 aa23.09■■□□□ 1.29
RRN3-205ENST00000563559 IL27Q8NEV9 243 aa23.09■■□□□ 1.29
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RRN3-205ENST00000563559 TMEM2Q9UHN6 1383 aa23.08■■□□□ 1.28
RRN3-205ENST00000563559 NRKQ7Z2Y5 1582 aa23.07■■□□□ 1.28
RRN3-205ENST00000563559 HSCBQ8IWL3 235 aa23.07■■□□□ 1.28
RRN3-205ENST00000563559 ANKRD45Q5TZF3 282 aa23.06■■□□□ 1.28
RRN3-205ENST00000563559 CHMP5Q9NZZ3 219 aa23.06■■□□□ 1.28
RRN3-205ENST00000563559 C8orf58Q8NAV2 365 aa23.05■■□□□ 1.28
RRN3-205ENST00000563559 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa23.05■■□□□ 1.28
RRN3-205ENST00000563559 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
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RRN3-205ENST00000563559 FAM83GA6ND36 823 aa23■■□□□ 1.27
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RRN3-205ENST00000563559 KIAA0232Q92628 1395 aa22.98■■□□□ 1.27
RRN3-205ENST00000563559 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa22.98■■□□□ 1.27
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RRN3-205ENST00000563559 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa22.97■■□□□ 1.27
RRN3-205ENST00000563559 USP6P35125 1406 aa22.97■■□□□ 1.27
RRN3-205ENST00000563559 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa22.97■■□□□ 1.27
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RRN3-205ENST00000563559 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
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RRN3-205ENST00000563559 DCTPP1Q9H773 170 aa22.94■■□□□ 1.26
RRN3-205ENST00000563559 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa22.93■■□□□ 1.26
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RRN3-205ENST00000563559 ANKRD44Q8N8A2 993 aa22.9■■□□□ 1.26
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RRN3-205ENST00000563559 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa22.89■■□□□ 1.25
RRN3-205ENST00000563559 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
RRN3-205ENST00000563559 EID1Q9Y6B2 187 aa22.89■■□□□ 1.25
RRN3-205ENST00000563559 LTKP29376 864 aa22.88■■□□□ 1.25
RRN3-205ENST00000563559 MCM10Q7L590 875 aa22.88■■□□□ 1.25
RRN3-205ENST00000563559 RGS12O14924 1447 aa22.87■■□□□ 1.25
RRN3-205ENST00000563559 PEAK1Q9H792 1746 aa22.87■■□□□ 1.25
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