RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437078.6

RABGEF1-210, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene RABGEF1, Length 4,319 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-210ENST00000437078 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP16.93■□□□□ 0.3
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RABGEF1-210ENST00000437078 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP16.92■□□□□ 0.3
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RABGEF1-210ENST00000437078 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP16.8■□□□□ 0.28
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RABGEF1-210ENST00000437078 NUTM1Q86Y26 1132 aa16.74■□□□□ 0.27
RABGEF1-210ENST00000437078 CFAP74Q9C0B2 1584 aa16.74■□□□□ 0.27
RABGEF1-210ENST00000437078 ALKQ9UM73 1620 aa16.74■□□□□ 0.27
RABGEF1-210ENST00000437078 KCNJ4P48050 445 aa16.74■□□□□ 0.27
RABGEF1-210ENST00000437078 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
RABGEF1-210ENST00000437078 LAMC1P11047 1609 aa16.74■□□□□ 0.27
RABGEF1-210ENST00000437078 PIK3C2BO00750 1634 aa16.73■□□□□ 0.27
RABGEF1-210ENST00000437078 DEPDC5O75140 1603 aa16.73■□□□□ 0.27
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