RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418331.6

PTPRJ-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRJ, Length 5,122 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-201ENST00000418331 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP25.65■■□□□ 1.7
PTPRJ-201ENST00000418331 HOMER1Q86YM7 354 aa25.65■■□□□ 1.7
PTPRJ-201ENST00000418331 GNAT3A8MTJ3 354 aa25.64■■□□□ 1.69
PTPRJ-201ENST00000418331 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP25.64■■□□□ 1.69
PTPRJ-201ENST00000418331 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP25.63■■□□□ 1.69
PTPRJ-201ENST00000418331 NASPP49321 788 aaPredicted RBP25.63■■□□□ 1.69
PTPRJ-201ENST00000418331 RNF214Q8ND24 703 aa25.63■■□□□ 1.69
PTPRJ-201ENST00000418331 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP25.62■■□□□ 1.69
PTPRJ-201ENST00000418331 KCNH5Q8NCM2 988 aa25.62■■□□□ 1.69
PTPRJ-201ENST00000418331 IDI1Q13907 227 aa25.62■■□□□ 1.69
PTPRJ-201ENST00000418331 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa25.62■■□□□ 1.69
PTPRJ-201ENST00000418331 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP25.62■■□□□ 1.69
PTPRJ-201ENST00000418331 MTMR7Q9Y216 660 aa25.61■■□□□ 1.69
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PTPRJ-201ENST00000418331 KDM4AO75164 1064 aa25.61■■□□□ 1.69
PTPRJ-201ENST00000418331 PEG3Q9GZU2 1588 aa25.61■■□□□ 1.69
PTPRJ-201ENST00000418331 CCDC70Q6NSX1 233 aa25.6■■□□□ 1.69
PTPRJ-201ENST00000418331 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP25.6■■□□□ 1.69
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PTPRJ-201ENST00000418331 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP25.6■■□□□ 1.69
PTPRJ-201ENST00000418331 NME9Q86XW9 330 aa25.6■■□□□ 1.69
PTPRJ-201ENST00000418331 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP25.6■■□□□ 1.69
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PTPRJ-201ENST00000418331 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP25.59■■□□□ 1.69
PTPRJ-201ENST00000418331 AACSQ86V21 672 aa25.59■■□□□ 1.69
PTPRJ-201ENST00000418331 MIS18AQ9NYP9 233 aa25.59■■□□□ 1.69
PTPRJ-201ENST00000418331 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP25.59■■□□□ 1.69
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PTPRJ-201ENST00000418331 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa25.58■■□□□ 1.69
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.58■■□□□ 1.69
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PTPRJ-201ENST00000418331 FAM43AQ8N2R8 423 aa25.58■■□□□ 1.69
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PTPRJ-201ENST00000418331 FIBPO43427 364 aa25.58■■□□□ 1.69
PTPRJ-201ENST00000418331 OLFM4Q6UX06 510 aa25.58■■□□□ 1.69
PTPRJ-201ENST00000418331 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.69
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PTPRJ-201ENST00000418331 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
PTPRJ-201ENST00000418331 ABCC11Q96J66 1382 aa25.57■■□□□ 1.68
PTPRJ-201ENST00000418331 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP25.57■■□□□ 1.68
PTPRJ-201ENST00000418331 ATP2B1P20020 1258 aa25.57■■□□□ 1.68
PTPRJ-201ENST00000418331 DCTN1Q14203 1278 aa25.57■■□□□ 1.68
PTPRJ-201ENST00000418331 SSH1Q8WYL5 1049 aa25.57■■□□□ 1.68
PTPRJ-201ENST00000418331 IFT57Q9NWB7 429 aa25.57■■□□□ 1.68
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PTPRJ-201ENST00000418331 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP25.56■■□□□ 1.68
PTPRJ-201ENST00000418331 FAM135AQ9P2D6 1515 aa25.56■■□□□ 1.68
PTPRJ-201ENST00000418331 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
PTPRJ-201ENST00000418331 ANKRD1Q15327 319 aa25.55■■□□□ 1.68
PTPRJ-201ENST00000418331 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa25.55■■□□□ 1.68
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PTPRJ-201ENST00000418331 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
PTPRJ-201ENST00000418331 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
PTPRJ-201ENST00000418331 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.54■■□□□ 1.68
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PTPRJ-201ENST00000418331 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
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PTPRJ-201ENST00000418331 GPS2Q13227 327 aa25.53■■□□□ 1.68
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
PTPRJ-201ENST00000418331 CEP126Q9P2H0 1117 aa25.53■■□□□ 1.68
PTPRJ-201ENST00000418331 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa25.52■■□□□ 1.68
PTPRJ-201ENST00000418331 NOS1P29475 1434 aa25.52■■□□□ 1.68
PTPRJ-201ENST00000418331 CCDC39Q9UFE4 941 aa25.52■■□□□ 1.68
PTPRJ-201ENST00000418331 STK3Q13188 491 aa25.51■■□□□ 1.67
PTPRJ-201ENST00000418331 C20orf194Q5TEA3 1177 aa25.51■■□□□ 1.67
PTPRJ-201ENST00000418331 FANCAO15360 1455 aa25.51■■□□□ 1.67
PTPRJ-201ENST00000418331 STK38Q15208 465 aa25.51■■□□□ 1.67
PTPRJ-201ENST00000418331 NACAP1Q9BZK3 213 aa25.51■■□□□ 1.67
PTPRJ-201ENST00000418331 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
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PTPRJ-201ENST00000418331 AEBP1Q8IUX7 1158 aa25.51■■□□□ 1.67
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PTPRJ-201ENST00000418331 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
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PTPRJ-201ENST00000418331 TSPY26PQ9H489 355 aa25.5■■□□□ 1.67
PTPRJ-201ENST00000418331 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
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PTPRJ-201ENST00000418331 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa25.49■■□□□ 1.67
PTPRJ-201ENST00000418331 TRIM5Q9C035 493 aa25.49■■□□□ 1.67
PTPRJ-201ENST00000418331 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
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PTPRJ-201ENST00000418331 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
PTPRJ-201ENST00000418331 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
PTPRJ-201ENST00000418331 PHF8Q9UPP1 1060 aa25.48■■□□□ 1.67
PTPRJ-201ENST00000418331 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
PTPRJ-201ENST00000418331 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
PTPRJ-201ENST00000418331 FAM13BQ9NYF5 915 aa25.46■■□□□ 1.67
PTPRJ-201ENST00000418331 NUTM1Q86Y26 1132 aa25.46■■□□□ 1.67
PTPRJ-201ENST00000418331 USHBP1Q8N6Y0 703 aa25.45■■□□□ 1.67
PTPRJ-201ENST00000418331 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
PTPRJ-201ENST00000418331 PDILTQ8N807 584 aa25.45■■□□□ 1.66
PTPRJ-201ENST00000418331 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
PTPRJ-201ENST00000418331 KIF1BPQ96EK5 621 aa25.45■■□□□ 1.66
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