RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000381222.8

ZBED1-202, Transcript of zinc finger BED-type containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZBED1, Length 4,507 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1-202ENST00000381222 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
ZBED1-202ENST00000381222 CHMP4AQ9BY43 222 aa18.23■□□□□ 0.51
ZBED1-202ENST00000381222 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
ZBED1-202ENST00000381222 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
ZBED1-202ENST00000381222 TOMM22Q9NS69 142 aa18.22■□□□□ 0.51
ZBED1-202ENST00000381222 DDX58O95786 925 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
ZBED1-202ENST00000381222 GNAI2P04899 355 aa18.22■□□□□ 0.51
ZBED1-202ENST00000381222 LTKP29376 864 aa18.22■□□□□ 0.51
ZBED1-202ENST00000381222 ATP10AO60312 1499 aa18.22■□□□□ 0.51
ZBED1-202ENST00000381222 MAST1Q9Y2H9 1570 aa18.21■□□□□ 0.51
ZBED1-202ENST00000381222 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.5
ZBED1-202ENST00000381222 MAGI2Q86UL8 1455 aa18.2■□□□□ 0.5
ZBED1-202ENST00000381222 SRGAP3O43295 1099 aa18.2■□□□□ 0.5
ZBED1-202ENST00000381222 TATP17735 454 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
ZBED1-202ENST00000381222 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
ZBED1-202ENST00000381222 FOSBP53539 338 aa18.2■□□□□ 0.5
ZBED1-202ENST00000381222 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
ZBED1-202ENST00000381222 KAT6BQ8WYB5 2073 aa18.19■□□□□ 0.5
ZBED1-202ENST00000381222 CDC45O75419 566 aa18.19■□□□□ 0.5
ZBED1-202ENST00000381222 GSE1Q14687 1217 aa18.19■□□□□ 0.5
ZBED1-202ENST00000381222 NUTM1Q86Y26 1132 aa18.19■□□□□ 0.5
ZBED1-202ENST00000381222 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
ZBED1-202ENST00000381222 GNAI3P08754 354 aa18.19■□□□□ 0.5
ZBED1-202ENST00000381222 IFT57Q9NWB7 429 aa18.19■□□□□ 0.5
ZBED1-202ENST00000381222 REC8O95072 547 aa18.18■□□□□ 0.5
ZBED1-202ENST00000381222 PIP4K2BP78356 416 aa18.18■□□□□ 0.5
ZBED1-202ENST00000381222 CFAP44Q96MT7 982 aa18.18■□□□□ 0.5
ZBED1-202ENST00000381222 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa18.18■□□□□ 0.5
ZBED1-202ENST00000381222 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
ZBED1-202ENST00000381222 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
ZBED1-202ENST00000381222 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
ZBED1-202ENST00000381222 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
ZBED1-202ENST00000381222 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
ZBED1-202ENST00000381222 HDAC5Q9UQL6 1122 aa18.17■□□□□ 0.5
ZBED1-202ENST00000381222 NEK4P51957 841 aa18.16■□□□□ 0.5
ZBED1-202ENST00000381222 CABP4P57796 275 aa18.16■□□□□ 0.5
ZBED1-202ENST00000381222 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
ZBED1-202ENST00000381222 KRT28Q7Z3Y7 464 aa18.16■□□□□ 0.5
ZBED1-202ENST00000381222 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa18.16■□□□□ 0.5
ZBED1-202ENST00000381222 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP18.15■□□□□ 0.5
ZBED1-202ENST00000381222 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP18.15■□□□□ 0.5
ZBED1-202ENST00000381222 GCC1Q96CN9 775 aa18.15■□□□□ 0.5
ZBED1-202ENST00000381222 KDM4AO75164 1064 aa18.15■□□□□ 0.5
ZBED1-202ENST00000381222 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP18.15■□□□□ 0.5
ZBED1-202ENST00000381222 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP18.15■□□□□ 0.5
ZBED1-202ENST00000381222 MEIS3Q99687 375 aa18.14■□□□□ 0.49
ZBED1-202ENST00000381222 PPP6R1Q9UPN7 881 aa18.14■□□□□ 0.49
ZBED1-202ENST00000381222 SLC39A6Q13433 755 aa18.14■□□□□ 0.49
ZBED1-202ENST00000381222 ORAI2Q96SN7 254 aa18.14■□□□□ 0.49
ZBED1-202ENST00000381222 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP18.14■□□□□ 0.49
ZBED1-202ENST00000381222 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa18.14■□□□□ 0.49
ZBED1-202ENST00000381222 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP18.13■□□□□ 0.49
ZBED1-202ENST00000381222 PTPRTO14522 1441 aa18.13■□□□□ 0.49
ZBED1-202ENST00000381222 MAP3K19Q56UN5 1328 aa18.13■□□□□ 0.49
ZBED1-202ENST00000381222 SEC24BO95487 1268 aa18.13■□□□□ 0.49
ZBED1-202ENST00000381222 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP18.13■□□□□ 0.49
ZBED1-202ENST00000381222 EYA1Q99502 592 aa18.13■□□□□ 0.49
ZBED1-202ENST00000381222 CHMP5Q9NZZ3 219 aa18.13■□□□□ 0.49
ZBED1-202ENST00000381222 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
ZBED1-202ENST00000381222 ARHGEF5Q12774 1597 aa18.12■□□□□ 0.49
ZBED1-202ENST00000381222 MYO5CQ9NQX4 1742 aa18.12■□□□□ 0.49
ZBED1-202ENST00000381222 CCT4P50991 539 aaKnown RBP18.11■□□□□ 0.49
ZBED1-202ENST00000381222 TRIM35Q9UPQ4 493 aa18.11■□□□□ 0.49
ZBED1-202ENST00000381222 ADAMTS2O95450 1211 aa18.11■□□□□ 0.49
ZBED1-202ENST00000381222 AAMPQ13685 434 aa18.11■□□□□ 0.49
ZBED1-202ENST00000381222 LRRCC1Q9C099 1032 aa18.11■□□□□ 0.49
ZBED1-202ENST00000381222 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa18.11■□□□□ 0.49
ZBED1-202ENST00000381222 FLIIQ13045 1269 aa18.11■□□□□ 0.49
ZBED1-202ENST00000381222 APPP05067 770 aa18.11■□□□□ 0.49
ZBED1-202ENST00000381222 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
ZBED1-202ENST00000381222 MCTP1Q6DN14 999 aa18.1■□□□□ 0.49
ZBED1-202ENST00000381222 RSPH6AQ9H0K4 717 aa18.1■□□□□ 0.49
ZBED1-202ENST00000381222 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
ZBED1-202ENST00000381222 ADGBQ8N7X0 1667 aa18.1■□□□□ 0.49
ZBED1-202ENST00000381222 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
ZBED1-202ENST00000381222 VAMP4O75379 141 aa18.1■□□□□ 0.49
ZBED1-202ENST00000381222 FSD1Q9BTV5 496 aa18.09■□□□□ 0.49
ZBED1-202ENST00000381222 NSD2O96028 1365 aa18.09■□□□□ 0.49
ZBED1-202ENST00000381222 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
ZBED1-202ENST00000381222 PI4KAP2A4QPH2 592 aa18.09■□□□□ 0.49
ZBED1-202ENST00000381222 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
ZBED1-202ENST00000381222 ALDH1L2Q3SY69 923 aa18.09■□□□□ 0.49
ZBED1-202ENST00000381222 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa18.09■□□□□ 0.49
ZBED1-202ENST00000381222 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
ZBED1-202ENST00000381222 KCNH5Q8NCM2 988 aa18.08■□□□□ 0.49
ZBED1-202ENST00000381222 ANKRD24Q8TF21 1146 aa18.08■□□□□ 0.49
ZBED1-202ENST00000381222 ABCC1P33527 1531 aa18.08■□□□□ 0.48
ZBED1-202ENST00000381222 PIK3C2GO75747 1445 aa18.07■□□□□ 0.48
ZBED1-202ENST00000381222 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
ZBED1-202ENST00000381222 METP08581 1390 aa18.07■□□□□ 0.48
ZBED1-202ENST00000381222 ABCC11Q96J66 1382 aa18.07■□□□□ 0.48
ZBED1-202ENST00000381222 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa18.07■□□□□ 0.48
ZBED1-202ENST00000381222 G2E3Q7L622 706 aa18.07■□□□□ 0.48
ZBED1-202ENST00000381222 CCDC27Q2M243 656 aa18.06■□□□□ 0.48
ZBED1-202ENST00000381222 STK11IPQ8N1F8 1099 aa18.06■□□□□ 0.48
ZBED1-202ENST00000381222 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
ZBED1-202ENST00000381222 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP18.06■□□□□ 0.48
ZBED1-202ENST00000381222 WASHC4Q2M389 1173 aa18.06■□□□□ 0.48
ZBED1-202ENST00000381222 ARID3AQ99856 593 aa18.06■□□□□ 0.48
ZBED1-202ENST00000381222 SPG7Q9UQ90 795 aa18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.3 ms