RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359238.6

SNX11-201, Transcript of sorting nexin 11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SNX11, Length 2,315 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX11-201ENST00000359238 IL13P35225 146 aa24.01■■□□□ 1.43
SNX11-201ENST00000359238 E9PSI1 815 aa24.01■■□□□ 1.43
SNX11-201ENST00000359238 BRPF3Q9ULD4 1205 aa24.01■■□□□ 1.43
SNX11-201ENST00000359238 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
SNX11-201ENST00000359238 TTC21AQ8NDW8 1320 aa24■■□□□ 1.43
SNX11-201ENST00000359238 NUTM2GQ5VZR2 741 aa24■■□□□ 1.43
SNX11-201ENST00000359238 ORAI2Q96SN7 254 aa24■■□□□ 1.43
SNX11-201ENST00000359238 TRIM35Q9UPQ4 493 aa24■■□□□ 1.43
SNX11-201ENST00000359238 STRCQ7RTU9 1775 aa24■■□□□ 1.43
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SNX11-201ENST00000359238 PHACTR3Q96KR7 559 aa24■■□□□ 1.43
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SNX11-201ENST00000359238 C19orf44Q9H6X5 657 aa23.98■■□□□ 1.43
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SNX11-201ENST00000359238 AEBP1Q8IUX7 1158 aa23.93■■□□□ 1.42
SNX11-201ENST00000359238 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa23.93■■□□□ 1.42
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SNX11-201ENST00000359238 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
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SNX11-201ENST00000359238 MAP3K19Q56UN5 1328 aa23.91■■□□□ 1.42
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SNX11-201ENST00000359238 C1orf167Q5SNV9 1468 aa23.91■■□□□ 1.42
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SNX11-201ENST00000359238 BCL2L13Q9BXK5 485 aa23.87■■□□□ 1.41
SNX11-201ENST00000359238 MST1RQ04912 1400 aa23.87■■□□□ 1.41
SNX11-201ENST00000359238 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP23.87■■□□□ 1.41
SNX11-201ENST00000359238 PLEKHG5O94827 1062 aa23.85■■□□□ 1.41
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SNX11-201ENST00000359238 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa23.84■■□□□ 1.41
SNX11-201ENST00000359238 MSH6P52701 1360 aa23.83■■□□□ 1.41
SNX11-201ENST00000359238 SULT6B1Q6IMI4 303 aa23.83■■□□□ 1.41
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SNX11-201ENST00000359238 CADPS2Q86UW7 1296 aa23.82■■□□□ 1.4
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SNX11-201ENST00000359238 FAM43AQ8N2R8 423 aa23.79■■□□□ 1.4
SNX11-201ENST00000359238 SBNO1A3KN83 1393 aa23.79■■□□□ 1.4
SNX11-201ENST00000359238 USP54Q70EL1 1684 aa23.79■■□□□ 1.4
SNX11-201ENST00000359238 FLT4P35916 1363 aa23.78■■□□□ 1.4
SNX11-201ENST00000359238 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP23.78■■□□□ 1.4
SNX11-201ENST00000359238 MYH16Q9H6N6 1097 aa23.77■■□□□ 1.4
SNX11-201ENST00000359238 KIF1AQ12756 1690 aa23.77■■□□□ 1.4
SNX11-201ENST00000359238 LTN1O94822 1766 aa23.76■■□□□ 1.39
SNX11-201ENST00000359238 PANK1Q8TE04 598 aa23.76■■□□□ 1.39
SNX11-201ENST00000359238 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP23.76■■□□□ 1.39
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SNX11-201ENST00000359238 HOXC9P31274 260 aa23.73■■□□□ 1.39
SNX11-201ENST00000359238 RLBP1P12271 317 aa23.73■■□□□ 1.39
SNX11-201ENST00000359238 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
SNX11-201ENST00000359238 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
SNX11-201ENST00000359238 NFAT5O94916 1531 aa23.71■■□□□ 1.39
SNX11-201ENST00000359238 IL16Q14005 1332 aa23.7■■□□□ 1.39
SNX11-201ENST00000359238 SLC4A3P48751 1232 aa23.7■■□□□ 1.38
SNX11-201ENST00000359238 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.38
SNX11-201ENST00000359238 CLUAP1Q96AJ1 413 aa23.7■■□□□ 1.38
SNX11-201ENST00000359238 COG6Q9Y2V7 657 aa23.7■■□□□ 1.38
SNX11-201ENST00000359238 BRINP3Q76B58 766 aa23.69■■□□□ 1.38
SNX11-201ENST00000359238 GCP02774 474 aa23.68■■□□□ 1.38
SNX11-201ENST00000359238 TSPYL6Q8N831 410 aa23.68■■□□□ 1.38
SNX11-201ENST00000359238 KCNH5Q8NCM2 988 aa23.68■■□□□ 1.38
SNX11-201ENST00000359238 SSH1Q8WYL5 1049 aa23.68■■□□□ 1.38
SNX11-201ENST00000359238 NPHP3Q7Z494 1330 aa23.68■■□□□ 1.38
SNX11-201ENST00000359238 RGPD2P0DJD1 1756 aa23.67■■□□□ 1.38
SNX11-201ENST00000359238 MCM10Q7L590 875 aa23.67■■□□□ 1.38
SNX11-201ENST00000359238 USHBP1Q8N6Y0 703 aa23.67■■□□□ 1.38
SNX11-201ENST00000359238 MBIPQ9NS73 344 aa23.67■■□□□ 1.38
SNX11-201ENST00000359238 IGSF1Q8N6C5 1336 aa23.67■■□□□ 1.38
SNX11-201ENST00000359238 KDM2BQ8NHM5 1336 aa23.67■■□□□ 1.38
SNX11-201ENST00000359238 CANXP27824 592 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
SNX11-201ENST00000359238 SLAIN2Q9P270 581 aa23.66■■□□□ 1.38
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