RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345512.7

PTPRU-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 4,470 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-201ENST00000345512 LRRCC1Q9C099 1032 aa18.82■□□□□ 0.6
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PTPRU-201ENST00000345512 NUTM1Q86Y26 1132 aa18.69■□□□□ 0.58
PTPRU-201ENST00000345512 ABCA8O94911 1581 aa18.69■□□□□ 0.58
PTPRU-201ENST00000345512 WASLO00401 505 aaPredicted RBP18.68■□□□□ 0.58
PTPRU-201ENST00000345512 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP18.68■□□□□ 0.58
PTPRU-201ENST00000345512 SRGAP3O43295 1099 aa18.68■□□□□ 0.58
PTPRU-201ENST00000345512 NEXNQ0ZGT2 675 aa18.68■□□□□ 0.58
PTPRU-201ENST00000345512 GDPD2Q9HCC8 539 aa18.68■□□□□ 0.58
PTPRU-201ENST00000345512 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP18.68■□□□□ 0.58
PTPRU-201ENST00000345512 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP18.67■□□□□ 0.58
PTPRU-201ENST00000345512 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa18.67■□□□□ 0.58
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