RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000329078.7

SPNS2-201, Transcript of sphingolipid transporter 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS2, Length 3,447 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS2-201ENST00000329078 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa24.69■■□□□ 1.54
SPNS2-201ENST00000329078 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa24.69■■□□□ 1.54
SPNS2-201ENST00000329078 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
SPNS2-201ENST00000329078 CCDC61Q9Y6R9 512 aa24.68■■□□□ 1.54
SPNS2-201ENST00000329078 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa24.68■■□□□ 1.54
SPNS2-201ENST00000329078 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
SPNS2-201ENST00000329078 ANTXR1Q9H6X2 564 aa24.67■■□□□ 1.54
SPNS2-201ENST00000329078 F6X3S4 739 aa24.67■■□□□ 1.54
SPNS2-201ENST00000329078 HECW2Q9P2P5 1572 aa24.67■■□□□ 1.54
SPNS2-201ENST00000329078 FOXO3O43524 673 aa24.66■■□□□ 1.54
SPNS2-201ENST00000329078 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa24.66■■□□□ 1.54
SPNS2-201ENST00000329078 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
SPNS2-201ENST00000329078 ZNF428Q96B54 188 aa24.66■■□□□ 1.54
SPNS2-201ENST00000329078 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
SPNS2-201ENST00000329078 ALDH1L2Q3SY69 923 aa24.65■■□□□ 1.54
SPNS2-201ENST00000329078 TSHZ3Q63HK5 1081 aa24.65■■□□□ 1.54
SPNS2-201ENST00000329078 IL13P35225 146 aa24.64■■□□□ 1.54
SPNS2-201ENST00000329078 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.54
SPNS2-201ENST00000329078 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.54
SPNS2-201ENST00000329078 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.54
SPNS2-201ENST00000329078 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa24.64■■□□□ 1.53
SPNS2-201ENST00000329078 SLC4A2P04920 1241 aa24.64■■□□□ 1.53
SPNS2-201ENST00000329078 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa24.63■■□□□ 1.53
SPNS2-201ENST00000329078 SHPRHQ149N8 1683 aa24.63■■□□□ 1.53
SPNS2-201ENST00000329078 IL16Q14005 1332 aa24.63■■□□□ 1.53
SPNS2-201ENST00000329078 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
SPNS2-201ENST00000329078 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
SPNS2-201ENST00000329078 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
SPNS2-201ENST00000329078 SIRT2Q8IXJ6 389 aa24.62■■□□□ 1.53
SPNS2-201ENST00000329078 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
SPNS2-201ENST00000329078 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa24.62■■□□□ 1.53
SPNS2-201ENST00000329078 AMPHP49418 695 aa24.61■■□□□ 1.53
SPNS2-201ENST00000329078 LMOD3Q0VAK6 560 aa24.61■■□□□ 1.53
SPNS2-201ENST00000329078 GRPEL1Q9HAV7 217 aa24.61■■□□□ 1.53
SPNS2-201ENST00000329078 CFAP44Q96MT7 982 aa24.61■■□□□ 1.53
SPNS2-201ENST00000329078 IFT57Q9NWB7 429 aa24.61■■□□□ 1.53
SPNS2-201ENST00000329078 LMTK2Q8IWU2 1503 aa24.61■■□□□ 1.53
SPNS2-201ENST00000329078 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa24.6■■□□□ 1.53
SPNS2-201ENST00000329078 PPLO60437 1756 aa24.6■■□□□ 1.53
SPNS2-201ENST00000329078 ESPNB1AK53 854 aa24.59■■□□□ 1.53
SPNS2-201ENST00000329078 RBM10P98175 930 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
SPNS2-201ENST00000329078 METP08581 1390 aa24.59■■□□□ 1.53
SPNS2-201ENST00000329078 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
SPNS2-201ENST00000329078 GCC1Q96CN9 775 aa24.58■■□□□ 1.53
SPNS2-201ENST00000329078 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
SPNS2-201ENST00000329078 TSPYL4Q9UJ04 414 aa24.58■■□□□ 1.53
SPNS2-201ENST00000329078 RIMS2Q9UQ26 1411 aa24.58■■□□□ 1.53
SPNS2-201ENST00000329078 ERBB4Q15303 1308 aa24.58■■□□□ 1.52
SPNS2-201ENST00000329078 MEIS3Q99687 375 aa24.58■■□□□ 1.52
SPNS2-201ENST00000329078 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
SPNS2-201ENST00000329078 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa24.55■■□□□ 1.52
SPNS2-201ENST00000329078 CLCN1P35523 988 aa24.55■■□□□ 1.52
SPNS2-201ENST00000329078 MRE11P49959 708 aa24.55■■□□□ 1.52
SPNS2-201ENST00000329078 LMOD2Q6P5Q4 547 aa24.55■■□□□ 1.52
SPNS2-201ENST00000329078 ACEP12821 1306 aa24.54■■□□□ 1.52
SPNS2-201ENST00000329078 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa24.54■■□□□ 1.52
SPNS2-201ENST00000329078 BMP2KLQ5H9B9 411 aa24.54■■□□□ 1.52
SPNS2-201ENST00000329078 PTPRMP28827 1452 aa24.54■■□□□ 1.52
SPNS2-201ENST00000329078 CDC45O75419 566 aa24.54■■□□□ 1.52
SPNS2-201ENST00000329078 SSFA2P28290 1259 aa24.54■■□□□ 1.52
SPNS2-201ENST00000329078 GAS2L3Q86XJ1 694 aa24.53■■□□□ 1.52
SPNS2-201ENST00000329078 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa24.52■■□□□ 1.52
SPNS2-201ENST00000329078 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP24.52■■□□□ 1.52
SPNS2-201ENST00000329078 RILPL2Q969X0 211 aa24.52■■□□□ 1.52
SPNS2-201ENST00000329078 GBP4Q96PP9 640 aa24.52■■□□□ 1.52
SPNS2-201ENST00000329078 NLRP1Q9C000 1473 aa24.52■■□□□ 1.52
SPNS2-201ENST00000329078 HDGFP51858 240 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
SPNS2-201ENST00000329078 G2E3Q7L622 706 aa24.52■■□□□ 1.52
SPNS2-201ENST00000329078 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
SPNS2-201ENST00000329078 IFT172Q9UG01 1749 aa24.51■■□□□ 1.51
SPNS2-201ENST00000329078 PIK3C2BO00750 1634 aa24.51■■□□□ 1.51
SPNS2-201ENST00000329078 CD163L1Q9NR16 1453 aa24.51■■□□□ 1.51
SPNS2-201ENST00000329078 USHBP1Q8N6Y0 703 aa24.51■■□□□ 1.51
SPNS2-201ENST00000329078 GAS2L2Q8NHY3 880 aa24.51■■□□□ 1.51
SPNS2-201ENST00000329078 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
SPNS2-201ENST00000329078 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
SPNS2-201ENST00000329078 NLRP6P59044 892 aa24.49■■□□□ 1.51
SPNS2-201ENST00000329078 PRR36Q9H6K5 1346 aa24.49■■□□□ 1.51
SPNS2-201ENST00000329078 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
SPNS2-201ENST00000329078 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
SPNS2-201ENST00000329078 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
SPNS2-201ENST00000329078 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
SPNS2-201ENST00000329078 TSPOAP1O95153 1857 aa24.49■■□□□ 1.51
SPNS2-201ENST00000329078 MYO3AQ8NEV4 1616 aa24.49■■□□□ 1.51
SPNS2-201ENST00000329078 DDX11L8A8MPP1 907 aa24.48■■□□□ 1.51
SPNS2-201ENST00000329078 CASC1Q6TDU7 716 aa24.48■■□□□ 1.51
SPNS2-201ENST00000329078 CHAMP1Q96JM3 812 aa24.48■■□□□ 1.51
SPNS2-201ENST00000329078 LRRC7Q96NW7 1537 aa24.48■■□□□ 1.51
SPNS2-201ENST00000329078 MCTP1Q6DN14 999 aa24.48■■□□□ 1.51
SPNS2-201ENST00000329078 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa24.48■■□□□ 1.51
SPNS2-201ENST00000329078 STK31Q9BXU1 1019 aa24.48■■□□□ 1.51
SPNS2-201ENST00000329078 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa24.48■■□□□ 1.51
SPNS2-201ENST00000329078 GOLGA6L22H0YM25 854 aa24.47■■□□□ 1.51
SPNS2-201ENST00000329078 NEO1Q92859 1461 aa24.47■■□□□ 1.51
SPNS2-201ENST00000329078 FSD2A1L4K1 749 aa24.47■■□□□ 1.51
SPNS2-201ENST00000329078 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa24.46■■□□□ 1.51
SPNS2-201ENST00000329078 FAM13BQ9NYF5 915 aa24.46■■□□□ 1.51
SPNS2-201ENST00000329078 MYO5BQ9ULV0 1848 aa24.46■■□□□ 1.51
SPNS2-201ENST00000329078 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
SPNS2-201ENST00000329078 PNPLA6Q8IY17 1366 aa24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55 ms