RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317243.9

ZNF554-201, Transcript of zinc finger protein 554, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZNF554, Length 2,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF554-201ENST00000317243 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
ZNF554-201ENST00000317243 ATP7BP35670 1465 aa24.5■■□□□ 1.51
ZNF554-201ENST00000317243 CLCN1P35523 988 aa24.5■■□□□ 1.51
ZNF554-201ENST00000317243 DCTN1Q14203 1278 aa24.5■■□□□ 1.51
ZNF554-201ENST00000317243 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
ZNF554-201ENST00000317243 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP24.49■■□□□ 1.51
ZNF554-201ENST00000317243 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa24.49■■□□□ 1.51
ZNF554-201ENST00000317243 CCDC61Q9Y6R9 512 aa24.49■■□□□ 1.51
ZNF554-201ENST00000317243 ITPRIPQ8IWB1 547 aa24.49■■□□□ 1.51
ZNF554-201ENST00000317243 TMEM2Q9UHN6 1383 aa24.49■■□□□ 1.51
ZNF554-201ENST00000317243 TSPYL6Q8N831 410 aa24.48■■□□□ 1.51
ZNF554-201ENST00000317243 FCHSD2O94868 740 aa24.48■■□□□ 1.51
ZNF554-201ENST00000317243 IL13P35225 146 aa24.48■■□□□ 1.51
ZNF554-201ENST00000317243 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa24.47■■□□□ 1.51
ZNF554-201ENST00000317243 AEBP1Q8IUX7 1158 aa24.46■■□□□ 1.51
ZNF554-201ENST00000317243 TMEM57Q8N5G2 664 aa24.46■■□□□ 1.51
ZNF554-201ENST00000317243 FAM135BQ49AJ0 1406 aa24.46■■□□□ 1.51
ZNF554-201ENST00000317243 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
ZNF554-201ENST00000317243 FSD2A1L4K1 749 aa24.46■■□□□ 1.51
ZNF554-201ENST00000317243 COG3Q96JB2 828 aa24.46■■□□□ 1.51
ZNF554-201ENST00000317243 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa24.45■■□□□ 1.5
ZNF554-201ENST00000317243 RRP9O43818 475 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
ZNF554-201ENST00000317243 TBC1D2Q9BYX2 928 aa24.45■■□□□ 1.5
ZNF554-201ENST00000317243 UBR1Q8IWV7 1749 aa24.45■■□□□ 1.5
ZNF554-201ENST00000317243 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa24.43■■□□□ 1.5
ZNF554-201ENST00000317243 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
ZNF554-201ENST00000317243 MCM4P33991 863 aa24.41■■□□□ 1.5
ZNF554-201ENST00000317243 NFE2L2Q16236 605 aa24.41■■□□□ 1.5
ZNF554-201ENST00000317243 TBC1D32Q96NH3 1257 aa24.41■■□□□ 1.5
ZNF554-201ENST00000317243 ACEP12821 1306 aa24.41■■□□□ 1.5
ZNF554-201ENST00000317243 PTPRUQ92729 1446 aa24.4■■□□□ 1.5
ZNF554-201ENST00000317243 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa24.4■■□□□ 1.5
ZNF554-201ENST00000317243 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.49
ZNF554-201ENST00000317243 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
ZNF554-201ENST00000317243 C1orf115Q9H7X2 142 aa24.38■■□□□ 1.49
ZNF554-201ENST00000317243 MBIPQ9NS73 344 aa24.38■■□□□ 1.49
ZNF554-201ENST00000317243 KRT24Q2M2I5 525 aa24.37■■□□□ 1.49
ZNF554-201ENST00000317243 IL16Q14005 1332 aa24.37■■□□□ 1.49
ZNF554-201ENST00000317243 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa24.36■■□□□ 1.49
ZNF554-201ENST00000317243 TECPR2O15040 1411 aa24.36■■□□□ 1.49
ZNF554-201ENST00000317243 C8orf58Q8NAV2 365 aa24.35■■□□□ 1.49
ZNF554-201ENST00000317243 MON2Q7Z3U7 1717 aa24.35■■□□□ 1.49
ZNF554-201ENST00000317243 TRAK2O60296 914 aa24.35■■□□□ 1.49
ZNF554-201ENST00000317243 HDGFP51858 240 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
ZNF554-201ENST00000317243 DLG5Q8TDM6 1919 aa24.35■■□□□ 1.49
ZNF554-201ENST00000317243 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa24.35■■□□□ 1.49
ZNF554-201ENST00000317243 SULT6B1Q6IMI4 303 aa24.34■■□□□ 1.49
ZNF554-201ENST00000317243 VAMP4O75379 141 aa24.34■■□□□ 1.49
ZNF554-201ENST00000317243 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
ZNF554-201ENST00000317243 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
ZNF554-201ENST00000317243 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
ZNF554-201ENST00000317243 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa24.34■■□□□ 1.49
ZNF554-201ENST00000317243 C3P01024 1663 aa24.33■■□□□ 1.49
ZNF554-201ENST00000317243 KNDC1Q76NI1 1749 aa24.33■■□□□ 1.48
ZNF554-201ENST00000317243 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.48
ZNF554-201ENST00000317243 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
ZNF554-201ENST00000317243 ITSN1Q15811 1721 aa24.32■■□□□ 1.48
ZNF554-201ENST00000317243 ERBB4Q15303 1308 aa24.32■■□□□ 1.48
ZNF554-201ENST00000317243 AKAP12Q02952 1782 aa24.32■■□□□ 1.48
ZNF554-201ENST00000317243 MRE11P49959 708 aa24.31■■□□□ 1.48
ZNF554-201ENST00000317243 NUTM2GQ5VZR2 741 aa24.31■■□□□ 1.48
ZNF554-201ENST00000317243 MCM10Q7L590 875 aa24.31■■□□□ 1.48
ZNF554-201ENST00000317243 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa24.31■■□□□ 1.48
ZNF554-201ENST00000317243 DDX19BQ9UMR2 479 aa24.31■■□□□ 1.48
ZNF554-201ENST00000317243 ESPNB1AK53 854 aa24.3■■□□□ 1.48
ZNF554-201ENST00000317243 AAMPQ13685 434 aa24.29■■□□□ 1.48
ZNF554-201ENST00000317243 AATKQ6ZMQ8 1374 aa24.29■■□□□ 1.48
ZNF554-201ENST00000317243 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
ZNF554-201ENST00000317243 C22orf23Q9BZE7 217 aa24.28■■□□□ 1.48
ZNF554-201ENST00000317243 GRPEL1Q9HAV7 217 aa24.28■■□□□ 1.48
ZNF554-201ENST00000317243 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa24.27■■□□□ 1.48
ZNF554-201ENST00000317243 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
ZNF554-201ENST00000317243 MIS18AQ9NYP9 233 aa24.27■■□□□ 1.48
ZNF554-201ENST00000317243 FOXO3O43524 673 aa24.27■■□□□ 1.48
ZNF554-201ENST00000317243 SIRT1Q96EB6 747 aa24.27■■□□□ 1.48
ZNF554-201ENST00000317243 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
ZNF554-201ENST00000317243 ZNF853P0CG23 659 aa24.26■■□□□ 1.47
ZNF554-201ENST00000317243 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
ZNF554-201ENST00000317243 KIF16BQ96L93 1317 aa24.26■■□□□ 1.47
ZNF554-201ENST00000317243 LNPKQ9C0E8 428 aa24.25■■□□□ 1.47
ZNF554-201ENST00000317243 PEAK1Q9H792 1746 aa24.25■■□□□ 1.47
ZNF554-201ENST00000317243 CHMP5Q9NZZ3 219 aa24.25■■□□□ 1.47
ZNF554-201ENST00000317243 EID1Q9Y6B2 187 aa24.25■■□□□ 1.47
ZNF554-201ENST00000317243 GNAI1P63096 354 aa24.24■■□□□ 1.47
ZNF554-201ENST00000317243 ALDH1L2Q3SY69 923 aa24.24■■□□□ 1.47
ZNF554-201ENST00000317243 IFT57Q9NWB7 429 aa24.24■■□□□ 1.47
ZNF554-201ENST00000317243 USP6P35125 1406 aa24.24■■□□□ 1.47
ZNF554-201ENST00000317243 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
ZNF554-201ENST00000317243 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
ZNF554-201ENST00000317243 CFAP44Q96MT7 982 aa24.22■■□□□ 1.47
ZNF554-201ENST00000317243 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
ZNF554-201ENST00000317243 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa24.21■■□□□ 1.47
ZNF554-201ENST00000317243 OVOS2Q6IE36 1432 aa24.21■■□□□ 1.47
ZNF554-201ENST00000317243 PLEKHG3A1L390 1219 aa24.21■■□□□ 1.47
ZNF554-201ENST00000317243 TRHP20396 242 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
ZNF554-201ENST00000317243 MAP3K19Q56UN5 1328 aa24.2■■□□□ 1.47
ZNF554-201ENST00000317243 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.47
ZNF554-201ENST00000317243 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.47
ZNF554-201ENST00000317243 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.47
ZNF554-201ENST00000317243 NRKQ7Z2Y5 1582 aa24.2■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.4 ms