RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000291906.4

PKN3-201, Transcript of protein kinase N3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PKN3, Length 3,375 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN3-201ENST00000291906 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
PKN3-201ENST00000291906 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa21.56■■□□□ 1.04
PKN3-201ENST00000291906 TRIM27P14373 513 aa21.56■■□□□ 1.04
PKN3-201ENST00000291906 TSPYL6Q8N831 410 aa21.55■■□□□ 1.04
PKN3-201ENST00000291906 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
PKN3-201ENST00000291906 MVPQ14764 893 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
PKN3-201ENST00000291906 LMOD2Q6P5Q4 547 aa21.52■■□□□ 1.04
PKN3-201ENST00000291906 MCM10Q7L590 875 aa21.52■■□□□ 1.04
PKN3-201ENST00000291906 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa21.52■■□□□ 1.04
PKN3-201ENST00000291906 ABTB2Q8N961 1025 aa21.52■■□□□ 1.04
PKN3-201ENST00000291906 USP6P35125 1406 aa21.52■■□□□ 1.04
PKN3-201ENST00000291906 NBR1Q14596 966 aa21.51■■□□□ 1.03
PKN3-201ENST00000291906 MBIPQ9NS73 344 aa21.51■■□□□ 1.03
PKN3-201ENST00000291906 IL16Q14005 1332 aa21.51■■□□□ 1.03
PKN3-201ENST00000291906 ADGRB2O60241 1585 aa21.51■■□□□ 1.03
PKN3-201ENST00000291906 TMEM57Q8N5G2 664 aa21.51■■□□□ 1.03
PKN3-201ENST00000291906 MAP3K19Q56UN5 1328 aa21.51■■□□□ 1.03
PKN3-201ENST00000291906 AATKQ6ZMQ8 1374 aa21.5■■□□□ 1.03
PKN3-201ENST00000291906 GNAI1P63096 354 aa21.5■■□□□ 1.03
PKN3-201ENST00000291906 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
PKN3-201ENST00000291906 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
PKN3-201ENST00000291906 MIS18AQ9NYP9 233 aa21.48■■□□□ 1.03
PKN3-201ENST00000291906 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
PKN3-201ENST00000291906 KRT24Q2M2I5 525 aa21.48■■□□□ 1.03
PKN3-201ENST00000291906 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
PKN3-201ENST00000291906 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
PKN3-201ENST00000291906 ESCO1Q5FWF5 840 aa21.48■■□□□ 1.03
PKN3-201ENST00000291906 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
PKN3-201ENST00000291906 FOXO3O43524 673 aa21.47■■□□□ 1.03
PKN3-201ENST00000291906 FAM161AQ3B820 660 aa21.47■■□□□ 1.03
PKN3-201ENST00000291906 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
PKN3-201ENST00000291906 KNDC1Q76NI1 1749 aa21.47■■□□□ 1.03
PKN3-201ENST00000291906 LMOD3Q0VAK6 560 aa21.47■■□□□ 1.03
PKN3-201ENST00000291906 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
PKN3-201ENST00000291906 C8orf58Q8NAV2 365 aa21.47■■□□□ 1.03
PKN3-201ENST00000291906 ITSN1Q15811 1721 aa21.47■■□□□ 1.03
PKN3-201ENST00000291906 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa21.46■■□□□ 1.03
PKN3-201ENST00000291906 ARHGAP23Q9P227 1491 aa21.45■■□□□ 1.03
PKN3-201ENST00000291906 SLIT1O75093 1534 aa21.45■■□□□ 1.02
PKN3-201ENST00000291906 VAMP4O75379 141 aa21.44■■□□□ 1.02
PKN3-201ENST00000291906 SLC4A3P48751 1232 aa21.44■■□□□ 1.02
PKN3-201ENST00000291906 DDX19BQ9UMR2 479 aa21.44■■□□□ 1.02
PKN3-201ENST00000291906 KIF16BQ96L93 1317 aa21.44■■□□□ 1.02
PKN3-201ENST00000291906 C1orf115Q9H7X2 142 aa21.44■■□□□ 1.02
PKN3-201ENST00000291906 IFT57Q9NWB7 429 aa21.44■■□□□ 1.02
PKN3-201ENST00000291906 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
PKN3-201ENST00000291906 PHF8Q9UPP1 1060 aa21.43■■□□□ 1.02
PKN3-201ENST00000291906 PSME1Q06323 249 aa21.43■■□□□ 1.02
PKN3-201ENST00000291906 CFAP44Q96MT7 982 aa21.42■■□□□ 1.02
PKN3-201ENST00000291906 TTC21AQ8NDW8 1320 aa21.42■■□□□ 1.02
PKN3-201ENST00000291906 C8orf34Q49A92 452 aa21.42■■□□□ 1.02
PKN3-201ENST00000291906 USHBP1Q8N6Y0 703 aa21.42■■□□□ 1.02
PKN3-201ENST00000291906 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
PKN3-201ENST00000291906 MON2Q7Z3U7 1717 aa21.41■■□□□ 1.02
PKN3-201ENST00000291906 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
PKN3-201ENST00000291906 EYA1Q99502 592 aa21.4■■□□□ 1.02
PKN3-201ENST00000291906 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
PKN3-201ENST00000291906 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa21.4■■□□□ 1.02
PKN3-201ENST00000291906 OVOS2Q6IE36 1432 aa21.4■■□□□ 1.02
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PKN3-201ENST00000291906 ALDH1L2Q3SY69 923 aa21.38■■□□□ 1.01
PKN3-201ENST00000291906 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
PKN3-201ENST00000291906 PTCH1Q13635 1447 aa21.38■■□□□ 1.01
PKN3-201ENST00000291906 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
PKN3-201ENST00000291906 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
PKN3-201ENST00000291906 NECTIN2Q92692 538 aa21.36■■□□□ 1.01
PKN3-201ENST00000291906 ORAI2Q96SN7 254 aa21.36■■□□□ 1.01
PKN3-201ENST00000291906 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
PKN3-201ENST00000291906 ZNF853P0CG23 659 aa21.35■■□□□ 1.01
PKN3-201ENST00000291906 FLT4P35916 1363 aa21.35■■□□□ 1.01
PKN3-201ENST00000291906 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
PKN3-201ENST00000291906 TSPYL4Q9UJ04 414 aa21.34■■□□□ 1.01
PKN3-201ENST00000291906 AAMPQ13685 434 aa21.33■■□□□ 1.01
PKN3-201ENST00000291906 SEC24BO95487 1268 aa21.33■■□□□ 1
PKN3-201ENST00000291906 HOXC9P31274 260 aa21.33■■□□□ 1
PKN3-201ENST00000291906 SBNO1A3KN83 1393 aa21.32■■□□□ 1
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PKN3-201ENST00000291906 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa21.32■■□□□ 1
PKN3-201ENST00000291906 USP31Q70CQ4 1352 aa21.32■■□□□ 1
PKN3-201ENST00000291906 SSH2Q76I76 1423 aa21.31■■□□□ 1
PKN3-201ENST00000291906 ZNF428Q96B54 188 aa21.29■■□□□ 1
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PKN3-201ENST00000291906 CHL1O00533 1208 aa21.27■■□□□ 1
PKN3-201ENST00000291906 SLC4A2P04920 1241 aa21.27■■□□□ 1
PKN3-201ENST00000291906 PEAK1Q9H792 1746 aa21.27■□□□□ 0.99
PKN3-201ENST00000291906 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa21.27■□□□□ 0.99
PKN3-201ENST00000291906 MYT1Q01538 1121 aa21.27■□□□□ 0.99
PKN3-201ENST00000291906 ANKRD45Q5TZF3 282 aa21.27■□□□□ 0.99
PKN3-201ENST00000291906 PIK3R4Q99570 1358 aa21.26■□□□□ 0.99
PKN3-201ENST00000291906 APBB1O00213 710 aa21.26■□□□□ 0.99
PKN3-201ENST00000291906 GAS2L2Q8NHY3 880 aa21.26■□□□□ 0.99
PKN3-201ENST00000291906 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP21.26■□□□□ 0.99
PKN3-201ENST00000291906 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP21.26■□□□□ 0.99
PKN3-201ENST00000291906 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP21.25■□□□□ 0.99
PKN3-201ENST00000291906 NRKQ7Z2Y5 1582 aa21.24■□□□□ 0.99
PKN3-201ENST00000291906 HSPA2P54652 639 aa21.24■□□□□ 0.99
PKN3-201ENST00000291906 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP21.24■□□□□ 0.99
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