RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261266.9

PTPRB-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 6,110 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-201ENST00000261266 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP10.79□□□□□ -0.68
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PTPRB-201ENST00000261266 CNNM1Q9NRU3 951 aa10.71□□□□□ -0.7
PTPRB-201ENST00000261266 SMTNL1A8MU46 457 aa10.71□□□□□ -0.7
PTPRB-201ENST00000261266 TRAK2O60296 914 aa10.71□□□□□ -0.7
PTPRB-201ENST00000261266 WWC2Q6AWC2 1192 aa10.71□□□□□ -0.7
PTPRB-201ENST00000261266 DNAI2Q9GZS0 605 aa10.71□□□□□ -0.7
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PTPRB-201ENST00000261266 CCDC69A6NI79 296 aa10.7□□□□□ -0.7
PTPRB-201ENST00000261266 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
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