RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000630659.2

BBS1-225, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 5 BASIC

Gene BBS1, Length 1,934 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-225	ENST00000630659	CDHR3	Q6ZTQ4	885 aa		15.46	■□□□□ 0.07
BBS1-225	ENST00000630659	ARMCX6	Q7L4S7	300 aa		15.46	■□□□□ 0.07
BBS1-225	ENST00000630659	DEFB128	Q7Z7B8	93 aa		15.46	■□□□□ 0.07
BBS1-225	ENST00000630659	SCN4B	Q8IWT1	228 aa		15.46	■□□□□ 0.07
BBS1-225	ENST00000630659	CENPS	Q8N2Z9	138 aa		15.46	■□□□□ 0.07
BBS1-225	ENST00000630659	ACMSD	Q8TDX5	336 aa		15.46	■□□□□ 0.07
BBS1-225	ENST00000630659	ISOC1	Q96CN7	298 aa		15.46	■□□□□ 0.07
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF597	Q96LX8	424 aa		15.46	■□□□□ 0.07
BBS1-225	ENST00000630659	MECR	Q9BV79	373 aa		15.46	■□□□□ 0.07
BBS1-225	ENST00000630659	TDRD1	Q9BXT4	1180 aa	Known RBP	15.46	■□□□□ 0.07
BBS1-225	ENST00000630659	CLK4	Q9HAZ1	481 aa	Known RBP	15.46	■□□□□ 0.07
BBS1-225	ENST00000630659	WBP1L	Q9NX94	342 aa		15.46	■□□□□ 0.07
BBS1-225	ENST00000630659	HACD3	Q9P035	362 aa		15.46	■□□□□ 0.07
BBS1-225	ENST00000630659	PAK5	Q9P286	719 aa		15.46	■□□□□ 0.07
BBS1-225	ENST00000630659	PCDHB5	Q9Y5E4	795 aa		15.46	■□□□□ 0.07
BBS1-225	ENST00000630659	TEX264	Q9Y6I9	313 aa		15.46	■□□□□ 0.07
BBS1-225	ENST00000630659	COL4A4	P53420	1690 aa	Predicted RBP	15.45	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	ADAM23	O75077	832 aa		15.45	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	MAP3K6	O95382	1288 aa		15.45	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	PRKCH	P24723	683 aa		15.45	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	CXCR3	P49682	368 aa		15.45	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	NRL	P54845	237 aa		15.45	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	YWHAG	P61981	247 aa	Known RBP eCLIP	15.45	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	ELAVL2	Q12926	359 aa	Known RBP	15.45	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	MOG	Q16653	247 aa		15.45	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	C1orf53	Q5VUE5	145 aa		15.45	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	ANKRD22	Q5VYY1	191 aa		15.45	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	KRT80	Q6KB66	452 aa		15.45	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	TIFAB	Q6ZNK6	161 aa		15.45	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	CARM1	Q86X55	608 aa		15.45	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF354C	Q86Y25	554 aa		15.45	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	MINDY2	Q8NBR6	621 aa		15.45	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	TNIP2	Q8NFZ5	429 aa		15.45	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	C8orf48	Q96LL4	319 aa		15.45	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	DTL	Q9NZJ0	730 aa		15.45	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	HCST	Q9UBK5	93 aa		15.45	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	DNAJC16	Q9Y2G8	782 aa		15.45	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	EEF2K	O00418	725 aa	Known RBP	15.45	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	GALT	P07902	379 aa		15.45	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	ELK3	P41970	407 aa		15.45	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	MAGEA11	P43364	429 aa		15.45	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	RGS21	Q2M5E4	152 aa		15.45	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	FUT10	Q6P4F1	479 aa		15.45	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	C16orf87	Q6PH81	154 aa		15.45	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	KCNT2	Q6UVM3	1135 aa		15.45	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	NANOGNB	Q7Z5D8	188 aa		15.45	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	TAC4	Q86UU9	113 aa		15.45	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	TAB3	Q8N5C8	712 aa	Predicted RBP	15.45	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	TFB1M	Q8WVM0	346 aa	Known RBP	15.45	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	STARD8	Q92502	1023 aa		15.45	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	LRRC39	Q96DD0	335 aa		15.45	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	QKI	Q96PU8	341 aa	Known RBP eCLIP	15.45	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	DOK1	Q99704	481 aa		15.45	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	PAIP1	Q9H074	479 aa	Known RBP	15.45	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	WDCP	Q9H6R7	721 aa		15.45	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	MRPL40	Q9NQ50	206 aa	Known RBP	15.45	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	ANLN	Q9NQW6	1124 aa		15.45	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	ABCC13	Q9NSE7	274 aa		15.45	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	TMEM9	Q9P0T7	183 aa		15.45	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	SEPT3	Q9UH03	358 aa		15.45	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	SLC30A1	Q9Y6M5	507 aa		15.45	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	VWA8	A3KMH1	1905 aa		15.44	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	CCDC195	A0A1B0GUA6	201 aa		15.44	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	HACD1	B0YJ81	288 aa		15.44	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	CHAD	O15335	359 aa		15.44	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	RFPL1	O75677	317 aa		15.44	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	DGKI	O75912	1065 aa		15.44	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	SERPINE1	P05121	402 aa		15.44	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	ADSL	P30566	484 aa	Predicted RBP	15.44	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	BASP1	P80723	227 aa	Known RBP	15.44	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	IFRD2	Q12894	506 aa	Predicted RBP	15.44	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	SEMA3B	Q13214	749 aa		15.44	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	BTBD8	Q5XKL5	378 aa		15.44	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	SLC2A7	Q6PXP3	512 aa		15.44	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	C4orf22	Q6V702	233 aa		15.44	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	BNC2	Q6ZN30	1099 aa	Predicted RBP	15.44	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	FRMD7	Q6ZUT3	714 aa		15.44	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	TRUB1	Q8WWH5	349 aa	Known RBP	15.44	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	STON2	Q8WXE9	905 aa		15.44	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	CCDC138	Q96M89	665 aa		15.44	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	PHF12	Q96QT6	1004 aa		15.44	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	PARVB	Q9HBI1	364 aa		15.44	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	MFHAS1	Q9Y4C4	1052 aa		15.44	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	NT5C1B-RDH14	C9J2C7	533 aa		15.43	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659		I6L893	689 aa	Predicted RBP	15.43	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	TMEM63A	O94886	807 aa		15.43	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	PTPN2	P17706	415 aa		15.43	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	SLC1A6	P48664	564 aa		15.43	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	HCAR3	P49019	387 aa		15.43	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	IDH3A	P50213	366 aa		15.43	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF135	P52742	658 aa	Predicted RBP	15.43	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	PAFAH1B3	Q15102	231 aa	Known RBP	15.43	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	CYTH1	Q15438	398 aa		15.43	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	FAXC	Q5TGI0	409 aa		15.43	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	SCD5	Q86SK9	330 aa		15.43	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	PDPR	Q8NCN5	879 aa		15.43	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	TOP1MT	Q969P6	601 aa		15.43	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	CNDP2	Q96KP4	475 aa	Known RBP	15.43	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	B3GALT6	Q96L58	329 aa		15.43	■□□□□ 0.06
BBS1-225	ENST00000630659	HGH1	Q9BTY7	390 aa		15.43	■□□□□ 0.06

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