RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC25A52Q3SY17 297 aa24.51■■□□□ 1.51
CAPNS1-216ENST00000628306 POM121L1PQ3SYA9 428 aa24.51■■□□□ 1.51
CAPNS1-216ENST00000628306 C8orf74Q6P047 294 aa24.51■■□□□ 1.51
CAPNS1-216ENST00000628306 BNIPLQ7Z465 357 aa24.51■■□□□ 1.51
CAPNS1-216ENST00000628306 SPACA3Q8IXA5 215 aa24.51■■□□□ 1.51
CAPNS1-216ENST00000628306 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
CAPNS1-216ENST00000628306 OSBPL8Q9BZF1 889 aa24.51■■□□□ 1.51
CAPNS1-216ENST00000628306 LRRC19Q9H756 370 aa24.51■■□□□ 1.51
CAPNS1-216ENST00000628306 POPDC2Q9HBU9 364 aa24.51■■□□□ 1.51
CAPNS1-216ENST00000628306 UCKL1Q9NWZ5 548 aa24.51■■□□□ 1.51
CAPNS1-216ENST00000628306 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa24.51■■□□□ 1.51
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CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF487B1APH4 448 aa24.5■■□□□ 1.51
CAPNS1-216ENST00000628306 F5H5T6 163 aa24.5■■□□□ 1.51
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CAPNS1-216ENST00000628306 RHOXF2BP0C7M4 288 aa24.5■■□□□ 1.51
CAPNS1-216ENST00000628306 PLA2G2AP14555 144 aa24.5■■□□□ 1.51
CAPNS1-216ENST00000628306 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
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CAPNS1-216ENST00000628306 RHOXF2Q9BQY4 288 aa24.5■■□□□ 1.51
CAPNS1-216ENST00000628306 FEM1AQ9BSK4 669 aa24.5■■□□□ 1.51
CAPNS1-216ENST00000628306 AP1M1Q9BXS5 423 aa24.5■■□□□ 1.51
CAPNS1-216ENST00000628306 MCF2LO15068 1137 aa24.49■■□□□ 1.51
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CAPNS1-216ENST00000628306 CTSLP07711 333 aa24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1-216ENST00000628306 FNTAP49354 379 aa24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1-216ENST00000628306 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
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CAPNS1-216ENST00000628306 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1-216ENST00000628306 CDCP2Q5VXM1 449 aa24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1-216ENST00000628306 Q6ZVU0 165 aa24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1-216ENST00000628306 GPR155Q7Z3F1 870 aa24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1-216ENST00000628306 KRT12Q99456 494 aa24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1-216ENST00000628306 PCYOX1Q9UHG3 505 aa24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1-216ENST00000628306 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1-216ENST00000628306 STAP1Q9ULZ2 295 aa24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1-216ENST00000628306 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa24.48■■□□□ 1.51
CAPNS1-216ENST00000628306 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
CAPNS1-216ENST00000628306 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa24.48■■□□□ 1.51
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CAPNS1-216ENST00000628306 PHF2O75151 1096 aa24.48■■□□□ 1.51
CAPNS1-216ENST00000628306 TJP3O95049 919 aa24.48■■□□□ 1.51
CAPNS1-216ENST00000628306 RARAP10276 462 aa24.48■■□□□ 1.51
CAPNS1-216ENST00000628306 TCF4P15884 667 aa24.48■■□□□ 1.51
CAPNS1-216ENST00000628306 DGKAP23743 735 aa24.48■■□□□ 1.51
CAPNS1-216ENST00000628306 IL1R2P27930 398 aa24.48■■□□□ 1.51
CAPNS1-216ENST00000628306 TNFRSF8P28908 595 aa24.48■■□□□ 1.51
CAPNS1-216ENST00000628306 NNMTP40261 264 aa24.48■■□□□ 1.51
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CAPNS1-216ENST00000628306 PDK2Q15119 407 aa24.48■■□□□ 1.51
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CAPNS1-216ENST00000628306 ODF2Q5BJF6 829 aa24.48■■□□□ 1.51
CAPNS1-216ENST00000628306 TFDP3Q5H9I0 405 aa24.48■■□□□ 1.51
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CAPNS1-216ENST00000628306 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa24.48■■□□□ 1.51
CAPNS1-216ENST00000628306 OR4C6Q8NH72 309 aa24.48■■□□□ 1.51
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM71BQ8TC56 605 aa24.48■■□□□ 1.51
CAPNS1-216ENST00000628306 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP24.48■■□□□ 1.51
CAPNS1-216ENST00000628306 SLCO2A1Q92959 643 aa24.48■■□□□ 1.51
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CAPNS1-216ENST00000628306 HIC2Q96JB3 615 aa24.48■■□□□ 1.51
CAPNS1-216ENST00000628306 CFAP57Q96MR6 1250 aa24.48■■□□□ 1.51
CAPNS1-216ENST00000628306 NPY6RQ99463 290 aa24.48■■□□□ 1.51
CAPNS1-216ENST00000628306 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
CAPNS1-216ENST00000628306 U3KQA8 63 aa24.48■■□□□ 1.51
CAPNS1-216ENST00000628306 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
CAPNS1-216ENST00000628306 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa24.47■■□□□ 1.51
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM187AA6NFU0 413 aa24.47■■□□□ 1.51
CAPNS1-216ENST00000628306 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
CAPNS1-216ENST00000628306 ALOX15BO15296 676 aa24.47■■□□□ 1.51
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CAPNS1-216ENST00000628306 GRAP2O75791 330 aa24.47■■□□□ 1.51
CAPNS1-216ENST00000628306 KRT1P04264 644 aa24.47■■□□□ 1.51
CAPNS1-216ENST00000628306 KDELR1P24390 212 aa24.47■■□□□ 1.51
CAPNS1-216ENST00000628306 CDKN2BP42772 138 aa24.47■■□□□ 1.51
CAPNS1-216ENST00000628306 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa24.47■■□□□ 1.51
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM46CQ5VWP2 391 aa24.47■■□□□ 1.51
CAPNS1-216ENST00000628306 KDM7AQ6ZMT4 941 aa24.47■■□□□ 1.51
CAPNS1-216ENST00000628306 MAP7D3Q8IWC1 876 aa24.47■■□□□ 1.51
CAPNS1-216ENST00000628306 DEFB106AQ8N104 65 aa24.47■■□□□ 1.51
CAPNS1-216ENST00000628306 SH2D3CQ8N5H7 860 aa24.47■■□□□ 1.51
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM172AQ8WUF8 416 aa24.47■■□□□ 1.51
CAPNS1-216ENST00000628306 PREBQ9HCU5 417 aa24.47■■□□□ 1.51
CAPNS1-216ENST00000628306 ACTN2P35609 894 aa24.46■■□□□ 1.51
CAPNS1-216ENST00000628306 ARSEP51690 589 aa24.46■■□□□ 1.51
CAPNS1-216ENST00000628306 AIF1P55008 147 aa24.46■■□□□ 1.51
CAPNS1-216ENST00000628306 HDAC4P56524 1084 aa24.46■■□□□ 1.51
CAPNS1-216ENST00000628306 E2F1Q01094 437 aa24.46■■□□□ 1.51
CAPNS1-216ENST00000628306 CCNG2Q16589 344 aa24.46■■□□□ 1.51
CAPNS1-216ENST00000628306 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
CAPNS1-216ENST00000628306 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa24.46■■□□□ 1.51
CAPNS1-216ENST00000628306 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
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