RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616600.4

HDGFL2-208, Transcript of HDGF like 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene HDGFL2, Length 2,281 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL2-208ENST00000616600 TGFBIQ15582 683 aa20.63■□□□□ 0.89
HDGFL2-208ENST00000616600 BCL2A1Q16548 175 aa20.63■□□□□ 0.89
HDGFL2-208ENST00000616600 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
HDGFL2-208ENST00000616600 DEFB107AQ8IZN7 70 aa20.63■□□□□ 0.89
HDGFL2-208ENST00000616600 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
HDGFL2-208ENST00000616600 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa20.63■□□□□ 0.89
HDGFL2-208ENST00000616600 E2F8A0AVK6 867 aa20.62■□□□□ 0.89
HDGFL2-208ENST00000616600 AP3B1O00203 1094 aa20.62■□□□□ 0.89
HDGFL2-208ENST00000616600 PSMD3O43242 534 aa20.62■□□□□ 0.89
HDGFL2-208ENST00000616600 CAPNS1P04632 268 aa20.62■□□□□ 0.89
HDGFL2-208ENST00000616600 GRK2P25098 689 aa20.62■□□□□ 0.89
HDGFL2-208ENST00000616600 CCR1P32246 355 aa20.62■□□□□ 0.89
HDGFL2-208ENST00000616600 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
HDGFL2-208ENST00000616600 CCDC153Q494R4 210 aa20.62■□□□□ 0.89
HDGFL2-208ENST00000616600 LINC00523Q86TU6 105 aa20.62■□□□□ 0.89
HDGFL2-208ENST00000616600 SPATA22Q8NHS9 363 aa20.62■□□□□ 0.89
HDGFL2-208ENST00000616600 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
HDGFL2-208ENST00000616600 SORT1Q99523 831 aa20.62■□□□□ 0.89
HDGFL2-208ENST00000616600 KIFC1Q9BW19 673 aa20.62■□□□□ 0.89
HDGFL2-208ENST00000616600 CYP4F11Q9HBI6 524 aa20.62■□□□□ 0.89
HDGFL2-208ENST00000616600 RIMS3Q9UJD0 308 aa20.62■□□□□ 0.89
HDGFL2-208ENST00000616600 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
HDGFL2-208ENST00000616600 SQORQ9Y6N5 450 aa20.62■□□□□ 0.89
HDGFL2-208ENST00000616600 ARHGEF37A1IGU5 675 aa20.62■□□□□ 0.89
HDGFL2-208ENST00000616600 MSI1O43347 362 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
HDGFL2-208ENST00000616600 B4GALT3O60512 393 aa20.62■□□□□ 0.89
HDGFL2-208ENST00000616600 MAFKO60675 156 aa20.62■□□□□ 0.89
HDGFL2-208ENST00000616600 SIN3BO75182 1162 aa20.62■□□□□ 0.89
HDGFL2-208ENST00000616600 DNAJB2P25686 324 aa20.62■□□□□ 0.89
HDGFL2-208ENST00000616600 ARRB2P32121 409 aa20.62■□□□□ 0.89
HDGFL2-208ENST00000616600 CCR3P51677 355 aa20.62■□□□□ 0.89
HDGFL2-208ENST00000616600 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
HDGFL2-208ENST00000616600 C16orf72Q14CZ0 275 aa20.62■□□□□ 0.89
HDGFL2-208ENST00000616600 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
HDGFL2-208ENST00000616600 IL12RB2Q99665 862 aa20.62■□□□□ 0.89
HDGFL2-208ENST00000616600 SLC39A8Q9C0K1 460 aa20.62■□□□□ 0.89
HDGFL2-208ENST00000616600 NMUR1Q9HB89 426 aa20.62■□□□□ 0.89
HDGFL2-208ENST00000616600 SUN2Q9UH99 717 aa20.62■□□□□ 0.89
HDGFL2-208ENST00000616600 PCDHB8Q9UN66 801 aa20.62■□□□□ 0.89
HDGFL2-208ENST00000616600 OR4Q2P0C623 313 aa20.61■□□□□ 0.89
HDGFL2-208ENST00000616600 CST5P28325 142 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
HDGFL2-208ENST00000616600 HTR7P34969 479 aa20.61■□□□□ 0.89
HDGFL2-208ENST00000616600 LPCAT2Q7L5N7 544 aa20.61■□□□□ 0.89
HDGFL2-208ENST00000616600 CLEC14AQ86T13 490 aa20.61■□□□□ 0.89
HDGFL2-208ENST00000616600 ATPAF2Q8N5M1 289 aa20.61■□□□□ 0.89
HDGFL2-208ENST00000616600 CMTM5Q96DZ9 223 aa20.61■□□□□ 0.89
HDGFL2-208ENST00000616600 FCRL5Q96RD9 977 aa20.61■□□□□ 0.89
HDGFL2-208ENST00000616600 RANBP9Q96S59 729 aa20.61■□□□□ 0.89
HDGFL2-208ENST00000616600 CAB39LQ9H9S4 337 aa20.61■□□□□ 0.89
HDGFL2-208ENST00000616600 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
HDGFL2-208ENST00000616600 NDFIP2Q9NV92 336 aa20.61■□□□□ 0.89
HDGFL2-208ENST00000616600 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
HDGFL2-208ENST00000616600 A0A096LPK6 155 aa20.61■□□□□ 0.89
HDGFL2-208ENST00000616600 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
HDGFL2-208ENST00000616600 MPOP05164 745 aa20.61■□□□□ 0.89
HDGFL2-208ENST00000616600 RALBP11234 206 aa20.61■□□□□ 0.89
HDGFL2-208ENST00000616600 PRDX6P30041 224 aa20.61■□□□□ 0.89
HDGFL2-208ENST00000616600 ABCG1P45844 678 aa20.61■□□□□ 0.89
HDGFL2-208ENST00000616600 ITGA7Q13683 1181 aa20.61■□□□□ 0.89
HDGFL2-208ENST00000616600 DLG2Q15700 870 aa20.61■□□□□ 0.89
HDGFL2-208ENST00000616600 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
HDGFL2-208ENST00000616600 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP20.61■□□□□ 0.89
HDGFL2-208ENST00000616600 URGCPQ8TCY9 931 aa20.61■□□□□ 0.89
HDGFL2-208ENST00000616600 LRGUKQ96M69 825 aa20.61■□□□□ 0.89
HDGFL2-208ENST00000616600 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa20.61■□□□□ 0.89
HDGFL2-208ENST00000616600 NUDT5Q9UKK9 219 aa20.61■□□□□ 0.89
HDGFL2-208ENST00000616600 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
HDGFL2-208ENST00000616600 PATJQ8NI35 1801 aa20.6■□□□□ 0.89
HDGFL2-208ENST00000616600 FUOMA2VDF0 154 aa20.6■□□□□ 0.89
HDGFL2-208ENST00000616600 TIMM44O43615 452 aa20.6■□□□□ 0.89
HDGFL2-208ENST00000616600 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
HDGFL2-208ENST00000616600 MYL4P12829 197 aa20.6■□□□□ 0.89
HDGFL2-208ENST00000616600 CAP1Q01518 475 aa20.6■□□□□ 0.89
HDGFL2-208ENST00000616600 PPP2R5DQ14738 602 aa20.6■□□□□ 0.89
HDGFL2-208ENST00000616600 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
HDGFL2-208ENST00000616600 ZNF280BQ86YH2 543 aa20.6■□□□□ 0.89
HDGFL2-208ENST00000616600 ACVR1CQ8NER5 493 aa20.6■□□□□ 0.89
HDGFL2-208ENST00000616600 TSPAN14Q8NG11 270 aa20.6■□□□□ 0.89
HDGFL2-208ENST00000616600 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
HDGFL2-208ENST00000616600 NOD1Q9Y239 953 aa20.6■□□□□ 0.89
HDGFL2-208ENST00000616600 MATN3O15232 486 aa20.6■□□□□ 0.89
HDGFL2-208ENST00000616600 DDHD2O94830 711 aa20.6■□□□□ 0.89
HDGFL2-208ENST00000616600 C2P06681 752 aa20.6■□□□□ 0.89
HDGFL2-208ENST00000616600 HARS2P49590 506 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
HDGFL2-208ENST00000616600 CDKL1Q00532 357 aa20.6■□□□□ 0.89
HDGFL2-208ENST00000616600 C6orf52Q5T4I8 152 aa20.6■□□□□ 0.89
HDGFL2-208ENST00000616600 TNS4Q8IZW8 715 aa20.6■□□□□ 0.89
HDGFL2-208ENST00000616600 PPP4R1Q8TF05 950 aa20.6■□□□□ 0.89
HDGFL2-208ENST00000616600 VPS39Q96JC1 886 aa20.6■□□□□ 0.89
HDGFL2-208ENST00000616600 GLOD4Q9HC38 313 aa20.6■□□□□ 0.89
HDGFL2-208ENST00000616600 KCNU1A8MYU2 1149 aa20.59■□□□□ 0.89
HDGFL2-208ENST00000616600 GOLGA8TH3BQL2 631 aa20.59■□□□□ 0.89
HDGFL2-208ENST00000616600 CSRP3P50461 194 aa20.59■□□□□ 0.89
HDGFL2-208ENST00000616600 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
HDGFL2-208ENST00000616600 IRF9Q00978 393 aa20.59■□□□□ 0.89
HDGFL2-208ENST00000616600 SLC39A12Q504Y0 691 aa20.59■□□□□ 0.89
HDGFL2-208ENST00000616600 ZFP1Q6P2D0 407 aa20.59■□□□□ 0.89
HDGFL2-208ENST00000616600 MAVSQ7Z434 540 aa20.59■□□□□ 0.89
HDGFL2-208ENST00000616600 TBL1YQ9BQ87 522 aa20.59■□□□□ 0.89
HDGFL2-208ENST00000616600 RGS18Q9NS28 235 aa20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.1 ms