RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-206ENST00000588815 GRIA2P42262 883 aa31.29■■■□□ 2.6
CAPNS1-206ENST00000588815 CRYMQ14894 314 aa31.29■■■□□ 2.6
CAPNS1-206ENST00000588815 PTPRNQ16849 979 aa31.29■■■□□ 2.6
CAPNS1-206ENST00000588815 MYLK3Q32MK0 819 aa31.29■■■□□ 2.6
CAPNS1-206ENST00000588815 PKN3Q6P5Z2 889 aa31.29■■■□□ 2.6
CAPNS1-206ENST00000588815 NLRP9Q7RTR0 991 aa31.29■■■□□ 2.6
CAPNS1-206ENST00000588815 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP31.29■■■□□ 2.6
CAPNS1-206ENST00000588815 DEFB123Q8N688 67 aa31.29■■■□□ 2.6
CAPNS1-206ENST00000588815 MYO19Q96H55 970 aa31.29■■■□□ 2.6
CAPNS1-206ENST00000588815 TNKS2Q9H2K2 1166 aa31.29■■■□□ 2.6
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM53CQ9NYF3 392 aa31.29■■■□□ 2.6
CAPNS1-206ENST00000588815 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP31.29■■■□□ 2.6
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM50BQ9Y247 325 aa31.29■■■□□ 2.6
CAPNS1-206ENST00000588815 CHKBQ9Y259 395 aa31.29■■■□□ 2.6
CAPNS1-206ENST00000588815 TCAF1Q9Y4C2 921 aa31.29■■■□□ 2.6
CAPNS1-206ENST00000588815 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa31.29■■■□□ 2.6
CAPNS1-206ENST00000588815 A0A1W2PQ67 120 aa31.28■■■□□ 2.6
CAPNS1-206ENST00000588815 WASH3PC4AMC7 463 aa31.28■■■□□ 2.6
CAPNS1-206ENST00000588815 PRRT4C9JH25 899 aa31.28■■■□□ 2.6
CAPNS1-206ENST00000588815 FZD6O60353 706 aa31.28■■■□□ 2.6
CAPNS1-206ENST00000588815 SP100P23497 879 aaPredicted RBP31.28■■■□□ 2.6
CAPNS1-206ENST00000588815 PRKCHP24723 683 aa31.28■■■□□ 2.6
CAPNS1-206ENST00000588815 SERPINA4P29622 427 aa31.28■■■□□ 2.6
CAPNS1-206ENST00000588815 KDSRQ06136 332 aa31.28■■■□□ 2.6
CAPNS1-206ENST00000588815 TRAF2Q12933 501 aa31.28■■■□□ 2.6
CAPNS1-206ENST00000588815 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP31.28■■■□□ 2.6
CAPNS1-206ENST00000588815 RASA2Q15283 850 aa31.28■■■□□ 2.6
CAPNS1-206ENST00000588815 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP31.28■■■□□ 2.6
CAPNS1-206ENST00000588815 CNPY4Q8N129 248 aa31.28■■■□□ 2.6
CAPNS1-206ENST00000588815 FRS2Q8WU20 508 aa31.28■■■□□ 2.6
CAPNS1-206ENST00000588815 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa31.28■■■□□ 2.6
CAPNS1-206ENST00000588815 SPOCK2Q92563 424 aa31.28■■■□□ 2.6
CAPNS1-206ENST00000588815 PEX13Q92968 403 aa31.28■■■□□ 2.6
CAPNS1-206ENST00000588815 PLAC1Q9HBJ0 212 aa31.28■■■□□ 2.6
CAPNS1-206ENST00000588815 MOCS1Q9NZB8 636 aa31.28■■■□□ 2.6
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC24A2Q9UI40 661 aa31.28■■■□□ 2.6
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM169AQ9Y6X4 670 aa31.28■■■□□ 2.6
CAPNS1-206ENST00000588815 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP31.27■■■□□ 2.6
CAPNS1-206ENST00000588815 PRLP01236 227 aa31.27■■■□□ 2.6
CAPNS1-206ENST00000588815 APODP05090 189 aa31.27■■■□□ 2.6
CAPNS1-206ENST00000588815 POU6F1Q14863 301 aa31.27■■■□□ 2.6
CAPNS1-206ENST00000588815 AAK1Q2M2I8 961 aa31.27■■■□□ 2.6
CAPNS1-206ENST00000588815 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa31.27■■■□□ 2.6
CAPNS1-206ENST00000588815 ARMC12Q5T9G4 340 aa31.27■■■□□ 2.6
CAPNS1-206ENST00000588815 TDRPQ86YL5 185 aa31.27■■■□□ 2.6
CAPNS1-206ENST00000588815 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP31.27■■■□□ 2.6
CAPNS1-206ENST00000588815 TBC1D3BA6NDS4 549 aa31.27■■■□□ 2.6
CAPNS1-206ENST00000588815 GOLGA8KD6RF30 607 aa31.27■■■□□ 2.6
CAPNS1-206ENST00000588815 CDH16O75309 829 aa31.27■■■□□ 2.6
CAPNS1-206ENST00000588815 KAT7O95251 611 aa31.27■■■□□ 2.6
CAPNS1-206ENST00000588815 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP31.27■■■□□ 2.6
CAPNS1-206ENST00000588815 SYF2O95926 243 aaKnown RBP31.27■■■□□ 2.6
CAPNS1-206ENST00000588815 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP31.27■■■□□ 2.6
CAPNS1-206ENST00000588815 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP31.27■■■□□ 2.6
CAPNS1-206ENST00000588815 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP31.27■■■□□ 2.66e-6■■■■■ 47.7
CAPNS1-206ENST00000588815 DNASE1L2Q92874 299 aa31.27■■■□□ 2.6
CAPNS1-206ENST00000588815 RMDN1Q96DB5 314 aa31.27■■■□□ 2.6
CAPNS1-206ENST00000588815 LRIG1Q96JA1 1093 aa31.27■■■□□ 2.6
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP31.27■■■□□ 2.6
CAPNS1-206ENST00000588815 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP31.27■■■□□ 2.6
CAPNS1-206ENST00000588815 KCNK12Q9HB15 430 aa31.27■■■□□ 2.6
CAPNS1-206ENST00000588815 TMBIM4Q9HC24 238 aa31.27■■■□□ 2.6
CAPNS1-206ENST00000588815 RIMKLBQ9ULI2 386 aa31.27■■■□□ 2.6
CAPNS1-206ENST00000588815 ANKRD66B4E2M5 251 aa31.26■■■□□ 2.59
CAPNS1-206ENST00000588815 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP31.26■■■□□ 2.59
CAPNS1-206ENST00000588815 PGLSO95336 258 aa31.26■■■□□ 2.59
CAPNS1-206ENST00000588815 GRIA4P48058 902 aa31.26■■■□□ 2.59
CAPNS1-206ENST00000588815 TTC8Q8TAM2 541 aa31.26■■■□□ 2.59
CAPNS1-206ENST00000588815 BRSK1Q8TDC3 778 aa31.26■■■□□ 2.59
CAPNS1-206ENST00000588815 SORCS1Q8WY21 1168 aa31.26■■■□□ 2.59
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP31.26■■■□□ 2.59
CAPNS1-206ENST00000588815 CHFRQ96EP1 664 aa31.26■■■□□ 2.59
CAPNS1-206ENST00000588815 PGM2Q96G03 612 aa31.26■■■□□ 2.59
CAPNS1-206ENST00000588815 CHRAC1Q9NRG0 131 aa31.26■■■□□ 2.59
CAPNS1-206ENST00000588815 HACD3Q9P035 362 aa31.26■■■□□ 2.59
CAPNS1-206ENST00000588815 VPS18Q9P253 973 aa31.26■■■□□ 2.59
CAPNS1-206ENST00000588815 PAMP19021 973 aa31.25■■■□□ 2.59
CAPNS1-206ENST00000588815 NAB1Q13506 487 aa31.25■■■□□ 2.59
CAPNS1-206ENST00000588815 GALNT3Q14435 633 aa31.25■■■□□ 2.59
CAPNS1-206ENST00000588815 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa31.25■■■□□ 2.59
CAPNS1-206ENST00000588815 Q6ZVU0 165 aa31.25■■■□□ 2.59
CAPNS1-206ENST00000588815 OR2A12Q8NGT7 310 aa31.25■■■□□ 2.59
CAPNS1-206ENST00000588815 CDKL2Q92772 493 aa31.25■■■□□ 2.59
CAPNS1-206ENST00000588815 NPC1O15118 1278 aa31.24■■■□□ 2.59
CAPNS1-206ENST00000588815 MESP2Q0VG99 397 aa31.24■■■□□ 2.59
CAPNS1-206ENST00000588815 LONRF1Q17RB8 773 aa31.24■■■□□ 2.59
CAPNS1-206ENST00000588815 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP31.24■■■□□ 2.59
CAPNS1-206ENST00000588815 PPM1EQ8WY54 764 aa31.24■■■□□ 2.59
CAPNS1-206ENST00000588815 HEPHQ9BQS7 1158 aa31.24■■■□□ 2.59
CAPNS1-206ENST00000588815 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP31.24■■■□□ 2.59
CAPNS1-206ENST00000588815 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP31.24■■■□□ 2.59
CAPNS1-206ENST00000588815 STARD13Q9Y3M8 1113 aa31.24■■■□□ 2.59
CAPNS1-206ENST00000588815 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa31.24■■■□□ 2.59
CAPNS1-206ENST00000588815 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa31.23■■■□□ 2.59
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM159BA6NKW6 160 aa31.23■■■□□ 2.59
CAPNS1-206ENST00000588815 TTC34A8MYJ7 566 aa31.23■■■□□ 2.59
CAPNS1-206ENST00000588815 PDHA1P08559 390 aa31.23■■■□□ 2.59
CAPNS1-206ENST00000588815 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa31.23■■■□□ 2.59
CAPNS1-206ENST00000588815 AGBL2Q5U5Z8 902 aa31.23■■■□□ 2.59
CAPNS1-206ENST00000588815 CAMK1DQ8IU85 385 aa31.23■■■□□ 2.59
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