RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577468.2

PTPRM-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-204ENST00000577468 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 DMRT3Q9NQL9 472 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 CNGB3Q9NQW8 809 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 CATSPERZQ9NTU4 200 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 RAB20Q9NX57 234 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 STK32BQ9NY57 414 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 LRFN1Q9P244 771 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 ITGA11Q9UKX5 1188 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 KLHL20Q9Y2M5 609 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 SNX9Q9Y5X1 595 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 PTPRCP08575 1304 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 YEATS2Q9ULM3 1422 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 CECR2Q9BXF3 1484 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 A0A1W2PPW3 197 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 DENND3A2RUS2 1198 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 CCDC151A5D8V7 595 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 FAM47DPA6NHR8 397 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 RHPN2P1A8MT19 583 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 PPEF2O14830 753 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 GSTA4O15217 222 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 FFAR2O15552 330 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 ECE2O60344 883 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 PFDN1O60925 122 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 CBR3O75828 277 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 RBBP9O75884 186 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 CAMTA2O94983 1202 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 GCNT3O95395 438 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 SCGB1D1O95968 90 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 GAS8O95995 478 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 PRLP01236 227 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 AMY2AP04746 511 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 IL6P05231 212 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 FHP07954 510 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 HMOX1P09601 288 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 STAG3L3P0CL85 134 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 CSH1P0DML2 217 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 CSH2P0DML3 217 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 MYBL1P10243 752 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 GHRP10912 638 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 ACADMP11310 421 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 SELLP14151 372 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 EZRP15311 586 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 RXRAP19793 462 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 AMY2BP19961 511 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 CHRM3P20309 590 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 NR4A1P22736 598 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 PSMA2P25787 234 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 APEX1P27695 318 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 CTGFP29279 349 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 CRABP2P29373 138 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 LRPAP1P30533 357 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 RRM2P31350 389 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 SLC8A1P32418 973 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 PIK3CBP42338 1070 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 MAGEA4P43358 317 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 PITPNBP48739 271 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 ACADVLP49748 655 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 CLK3P49761 638 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF81P51508 661 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 MTTPP55157 894 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 ERVK-21P61565 698 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 MC1RQ01726 317 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 TLE2Q04725 743 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 LIPEQ05469 1076 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 SULT2A1Q06520 285 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 ELP6Q0PNE2 266 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 SCRN3Q0VDG4 424 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 CDC20Q12834 499 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 IL24Q13007 206 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 SPIDRQ14159 915 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 PON2Q15165 354 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 KRT31Q15323 416 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 CHRNA6Q15825 494 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 CYP2A13Q16696 494 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 KYNUQ16719 465 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 FAM110CQ1W6H9 321 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 CTXN3Q4LDR2 81 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 GAGE13Q4V321 117 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 TIGD2Q4W5G0 525 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 ATAT1Q5SQI0 421 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 DEPDC1Q5TB30 811 aa3.11□□□□□ -1.91
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