RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562298.1

VPS9D1-AS1-201, VPS9D1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene VPS9D1-AS1, Length 931 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 WASH4PA8MWX3 477 aa16.87■□□□□ 0.29
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 PARP15Q460N3 678 aa16.87■□□□□ 0.29
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 TMEM52BQ4KMG9 183 aa16.87■□□□□ 0.29
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 FAXCQ5TGI0 409 aa16.87■□□□□ 0.29
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 DNAJC24Q6P3W2 148 aa16.87■□□□□ 0.29
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 NYAP1Q6ZVC0 841 aa16.87■□□□□ 0.29
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa16.87■□□□□ 0.29
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 NEK11Q8NG66 645 aa16.87■□□□□ 0.29
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 KCNE4Q8WWG9 221 aa16.87■□□□□ 0.29
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 VCPIP1Q96JH7 1222 aa16.87■□□□□ 0.29
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 SLC46A1Q96NT5 459 aa16.87■□□□□ 0.29
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 SLC13A1Q9BZW2 595 aa16.87■□□□□ 0.29
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 PDFQ9HBH1 243 aa16.87■□□□□ 0.29
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 THSD1Q9NS62 852 aa16.87■□□□□ 0.29
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 LMBRD1Q9NUN5 540 aa16.87■□□□□ 0.29
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 LRP4O75096 1905 aa16.87■□□□□ 0.29
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 TENM4Q6N022 2769 aa16.87■□□□□ 0.29
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 TSPAN11A1L157 253 aa16.86■□□□□ 0.29
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 LGALS16A8MUM7 142 aa16.86■□□□□ 0.29
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 TOR1BO14657 336 aa16.86■□□□□ 0.29
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 KLK10O43240 276 aa16.86■□□□□ 0.29
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 TCEA3O75764 348 aa16.86■□□□□ 0.29
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 ANXA6P08133 673 aa16.86■□□□□ 0.29
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 AIF1P55008 147 aa16.86■□□□□ 0.29
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 TMPRSS3P57727 454 aa16.86■□□□□ 0.29
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 OGDHQ02218 1023 aa16.86■□□□□ 0.29
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 PPARDQ03181 441 aa16.86■□□□□ 0.29
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 WSCD2Q2TBF2 565 aa16.86■□□□□ 0.29
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 BROXQ5VW32 411 aa16.86■□□□□ 0.29
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 ZNF843Q8N446 348 aa16.86■□□□□ 0.29
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 TPCN2Q8NHX9 752 aa16.86■□□□□ 0.29
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 NAT6Q93015 286 aa16.86■□□□□ 0.29
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 GRAMD1AQ96CP6 724 aa16.86■□□□□ 0.29
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 AGPAT1Q99943 283 aa16.86■□□□□ 0.29
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 CCDC3Q9BQI4 270 aa16.86■□□□□ 0.29
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 LRRC19Q9H756 370 aa16.86■□□□□ 0.29
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa16.86■□□□□ 0.29
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 SSUH2Q9Y2M2 353 aa16.86■□□□□ 0.29
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa16.86■□□□□ 0.29
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 J3KR12 359 aa16.85■□□□□ 0.29
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 C6P13671 934 aa16.85■□□□□ 0.29
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 RPIAP49247 311 aa16.85■□□□□ 0.29
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 SUOXP51687 545 aa16.85■□□□□ 0.29
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 HK3P52790 923 aa16.85■□□□□ 0.29
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 UCNP55089 124 aa16.85■□□□□ 0.29
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 SKOR1P84550 965 aa16.85■□□□□ 0.29
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 ELP6Q0PNE2 266 aa16.85■□□□□ 0.29
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 LRRC14Q15048 493 aa16.85■□□□□ 0.29
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 TCEA2Q15560 299 aa16.85■□□□□ 0.29
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 UGP2Q16851 508 aa16.85■□□□□ 0.29
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 ALG11Q2TAA5 492 aa16.85■□□□□ 0.29
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 ARHGAP40Q5TG30 622 aa16.85■□□□□ 0.29
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 ZSWIM9Q86XI8 627 aa16.85■□□□□ 0.29
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 DNAAF5Q86Y56 855 aa16.85■□□□□ 0.29
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 HCAR2Q8TDS4 363 aa16.85■□□□□ 0.29
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 GLMNQ92990 594 aa16.85■□□□□ 0.29
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 NCAPGQ9BPX3 1015 aa16.85■□□□□ 0.29
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 CNPY3Q9BT09 278 aa16.85■□□□□ 0.29
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 DPH1Q9BZG8 443 aa16.85■□□□□ 0.29
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 SUV39H2Q9H5I1 410 aa16.85■□□□□ 0.29
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 PCDH12Q9NPG4 1184 aa16.85■□□□□ 0.29
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 PADI4Q9UM07 663 aa16.85■□□□□ 0.29
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 CDRT15L2A8MXV6 281 aa16.84■□□□□ 0.29
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 ERVH48-1M5A8F1 160 aa16.84■□□□□ 0.29
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 XPAP23025 273 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 PEX5P50542 639 aa16.84■□□□□ 0.29
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 TPI1P60174 286 aa16.84■□□□□ 0.29
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 UBXN1Q04323 297 aa16.84■□□□□ 0.29
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 INPP5AQ14642 412 aa16.84■□□□□ 0.29
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 KCTD16Q68DU8 428 aa16.84■□□□□ 0.29
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 CLEC17AQ6ZS10 378 aa16.84■□□□□ 0.29
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 HID1Q8IV36 788 aa16.84■□□□□ 0.29
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 MCOLN2Q8IZK6 566 aa16.84■□□□□ 0.29
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 ARL10Q8N8L6 244 aa16.84■□□□□ 0.29
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 KYQ8NBH2 561 aa16.84■□□□□ 0.29
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 PCDH19Q8TAB3 1148 aa16.84■□□□□ 0.29
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 ERGIC2Q96RQ1 377 aa16.84■□□□□ 0.29
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP16.84■□□□□ 0.29
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa16.84■□□□□ 0.29
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 TAS2R14Q9NYV8 317 aa16.84■□□□□ 0.29
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 SIRPGQ9P1W8 387 aa16.84■□□□□ 0.29
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 RABGEF1Q9UJ41 708 aa16.84■□□□□ 0.29
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 OR1A2Q9Y585 309 aa16.84■□□□□ 0.29
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 ANKRD62A6NC57 917 aa16.83■□□□□ 0.28
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.5 ms