RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555124.1

LRP1-208, Transcript of LDL receptor related protein 1, humanhuman

TSL 4

Gene LRP1, Length 550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Exosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1-208ENST00000555124 ZBTB17Q13105 803 aa14.95□□□□□ -0.02
LRP1-208ENST00000555124 NOMO1Q15155 1222 aa14.95□□□□□ -0.02
LRP1-208ENST00000555124 LRRC73Q5JTD7 316 aa14.95□□□□□ -0.02
LRP1-208ENST00000555124 HORMAD1Q86X24 394 aa14.95□□□□□ -0.02
LRP1-208ENST00000555124 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa14.95□□□□□ -0.02
LRP1-208ENST00000555124 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa14.94□□□□□ -0.02
LRP1-208ENST00000555124 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa14.94□□□□□ -0.02
LRP1-208ENST00000555124 A0A1B0GTW7 788 aa14.94□□□□□ -0.02
LRP1-208ENST00000555124 A0A1W2PPC4 97 aa14.94□□□□□ -0.02
LRP1-208ENST00000555124 A0A1W2PQU0 124 aa14.94□□□□□ -0.02
LRP1-208ENST00000555124 PATE3B3GLJ2 98 aa14.94□□□□□ -0.02
LRP1-208ENST00000555124 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
LRP1-208ENST00000555124 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
LRP1-208ENST00000555124 SOCS5O75159 536 aa14.94□□□□□ -0.02
LRP1-208ENST00000555124 CFIP05156 583 aa14.94□□□□□ -0.02
LRP1-208ENST00000555124 NUDT1P36639 197 aa14.94□□□□□ -0.02
LRP1-208ENST00000555124 SUOXP51687 545 aa14.94□□□□□ -0.02
LRP1-208ENST00000555124 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
LRP1-208ENST00000555124 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
LRP1-208ENST00000555124 ELP6Q0PNE2 266 aa14.94□□□□□ -0.02
LRP1-208ENST00000555124 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
LRP1-208ENST00000555124 UGP2Q16851 508 aa14.94□□□□□ -0.02
LRP1-208ENST00000555124 TEX44Q53QW1 395 aa14.94□□□□□ -0.02
LRP1-208ENST00000555124 SLC45A4Q5BKX6 768 aa14.94□□□□□ -0.02
LRP1-208ENST00000555124 TRIM61Q5EBN2 209 aa14.94□□□□□ -0.02
LRP1-208ENST00000555124 ALG1LQ6GMV1 187 aa14.94□□□□□ -0.02
LRP1-208ENST00000555124 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa14.94□□□□□ -0.02
LRP1-208ENST00000555124 KIAA2013Q8IYS2 634 aa14.94□□□□□ -0.02
LRP1-208ENST00000555124 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
LRP1-208ENST00000555124 CNTD1Q8N815 330 aa14.94□□□□□ -0.02
LRP1-208ENST00000555124 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
LRP1-208ENST00000555124 TTC13Q8NBP0 860 aa14.94□□□□□ -0.02
LRP1-208ENST00000555124 C1orf216Q8TAB5 229 aa14.94□□□□□ -0.02
LRP1-208ENST00000555124 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
LRP1-208ENST00000555124 ECHDC3Q96DC8 303 aa14.94□□□□□ -0.02
LRP1-208ENST00000555124 AGAP3Q96P47 875 aa14.94□□□□□ -0.02
LRP1-208ENST00000555124 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP14.94□□□□□ -0.02
LRP1-208ENST00000555124 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
LRP1-208ENST00000555124 CEP41Q9BYV8 373 aa14.94□□□□□ -0.02
LRP1-208ENST00000555124 ITM2BQ9Y287 266 aa14.94□□□□□ -0.02
LRP1-208ENST00000555124 TMEM131Q92545 1883 aa14.93□□□□□ -0.02
LRP1-208ENST00000555124 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
LRP1-208ENST00000555124 A0A1W2PQ67 120 aa14.93□□□□□ -0.02
LRP1-208ENST00000555124 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa14.93□□□□□ -0.02
LRP1-208ENST00000555124 KCNK3O14649 394 aa14.93□□□□□ -0.02
LRP1-208ENST00000555124 AREL1O15033 823 aa14.93□□□□□ -0.02
LRP1-208ENST00000555124 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
LRP1-208ENST00000555124 LATO43561 262 aa14.93□□□□□ -0.02
LRP1-208ENST00000555124 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
LRP1-208ENST00000555124 SERPINF2P08697 491 aa14.93□□□□□ -0.02
LRP1-208ENST00000555124 ITIH2P19823 946 aa14.93□□□□□ -0.02
LRP1-208ENST00000555124 PTPN3P26045 913 aa14.93□□□□□ -0.02
LRP1-208ENST00000555124 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
LRP1-208ENST00000555124 RPS21P63220 83 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
LRP1-208ENST00000555124 IRX4P78413 519 aa14.93□□□□□ -0.02
LRP1-208ENST00000555124 NIPAL4Q0D2K0 466 aa14.93□□□□□ -0.02
LRP1-208ENST00000555124 TRAF2Q12933 501 aa14.93□□□□□ -0.02
LRP1-208ENST00000555124 ZNF284Q2VY69 593 aa14.93□□□□□ -0.02
LRP1-208ENST00000555124 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
LRP1-208ENST00000555124 ZNF569Q5MCW4 686 aa14.93□□□□□ -0.02
LRP1-208ENST00000555124 FAM182AQ5T1J6 154 aa14.93□□□□□ -0.02
LRP1-208ENST00000555124 ARMC12Q5T9G4 340 aa14.93□□□□□ -0.02
LRP1-208ENST00000555124 SEL1L3Q68CR1 1132 aa14.93□□□□□ -0.02
LRP1-208ENST00000555124 TCEAL6Q6IPX3 200 aa14.93□□□□□ -0.02
LRP1-208ENST00000555124 ERAP2Q6P179 960 aa14.93□□□□□ -0.02
LRP1-208ENST00000555124 SLC23A3Q6PIS1 610 aa14.93□□□□□ -0.02
LRP1-208ENST00000555124 PRR23CQ6ZRP0 262 aa14.93□□□□□ -0.02
LRP1-208ENST00000555124 ZSWIM9Q86XI8 627 aa14.93□□□□□ -0.02
LRP1-208ENST00000555124 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
LRP1-208ENST00000555124 ARRDC2Q8TBH0 407 aa14.93□□□□□ -0.02
LRP1-208ENST00000555124 HTR3CQ8WXA8 447 aa14.93□□□□□ -0.02
LRP1-208ENST00000555124 KLK6Q92876 244 aa14.93□□□□□ -0.02
LRP1-208ENST00000555124 TCEAL3Q969E4 200 aa14.93□□□□□ -0.02
LRP1-208ENST00000555124 FAM118BQ9BPY3 351 aa14.93□□□□□ -0.02
LRP1-208ENST00000555124 FERMT1Q9BQL6 677 aa14.93□□□□□ -0.02
LRP1-208ENST00000555124 ORAI3Q9BRQ5 295 aa14.93□□□□□ -0.02
LRP1-208ENST00000555124 TLR10Q9BXR5 811 aa14.93□□□□□ -0.02
LRP1-208ENST00000555124 CARD9Q9H257 536 aa14.93□□□□□ -0.02
LRP1-208ENST00000555124 EBF2Q9HAK2 575 aa14.93□□□□□ -0.02
LRP1-208ENST00000555124 PCDH12Q9NPG4 1184 aa14.93□□□□□ -0.02
LRP1-208ENST00000555124 GGT7Q9UJ14 662 aa14.93□□□□□ -0.02
LRP1-208ENST00000555124 PYCARDQ9ULZ3 195 aa14.93□□□□□ -0.02
LRP1-208ENST00000555124 SLC6A14Q9UN76 642 aa14.93□□□□□ -0.02
LRP1-208ENST00000555124 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
LRP1-208ENST00000555124 DMTF1Q9Y222 760 aa14.93□□□□□ -0.02
LRP1-208ENST00000555124 RAI2Q9Y5P3 530 aa14.93□□□□□ -0.02
LRP1-208ENST00000555124 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
LRP1-208ENST00000555124 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
LRP1-208ENST00000555124 SLC31A1O15431 190 aa14.92□□□□□ -0.02
LRP1-208ENST00000555124 SPINT1O43278 529 aa14.92□□□□□ -0.02
LRP1-208ENST00000555124 PGLSO95336 258 aa14.92□□□□□ -0.02
LRP1-208ENST00000555124 PRKCGP05129 697 aa14.92□□□□□ -0.02
LRP1-208ENST00000555124 RBP3P10745 1247 aa14.92□□□□□ -0.02
LRP1-208ENST00000555124 RBL1P28749 1068 aa14.92□□□□□ -0.02
LRP1-208ENST00000555124 FAM193AP78312 1265 aa14.92□□□□□ -0.02
LRP1-208ENST00000555124 WASHC5Q12768 1159 aa14.92□□□□□ -0.02
LRP1-208ENST00000555124 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
LRP1-208ENST00000555124 TEAD4Q15561 434 aa14.92□□□□□ -0.02
LRP1-208ENST00000555124 TMEM52BQ4KMG9 183 aa14.92□□□□□ -0.02
LRP1-208ENST00000555124 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.4 ms