RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498517.5

ARHGEF3-215, Transcript of Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

TSL 5

Gene ARHGEF3, Length 787 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3-215ENST00000498517 ASRGL1Q7L266 308 aa5.69□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 BEND5Q7L4P6 421 aa5.69□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 STRADAQ7RTN6 431 aa5.69□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 VSIG1Q86XK7 387 aa5.69□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 UNC45BQ8IWX7 931 aa5.69□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 PDIK1LQ8N165 341 aa5.69□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa5.69□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 FBXO36Q8NEA4 188 aa5.69□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 RIN3Q8TB24 985 aa5.69□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 SLC7A14Q8TBB6 771 aa5.69□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 ZNF398Q8TD17 642 aa5.69□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 CLEC4CQ8WTT0 213 aa5.69□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 FAM172AQ8WUF8 416 aa5.69□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 OVCA2Q8WZ82 227 aa5.69□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 HSPH1Q92598 858 aa5.69□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 CYTH2Q99418 400 aa5.69□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 PAFAH2Q99487 392 aa5.69□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 DHRS4Q9BTZ2 278 aa5.69□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 CALN1Q9BXU9 219 aa5.69□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 WDCPQ9H6R7 721 aa5.69□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 KIF9Q9HAQ2 790 aa5.69□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 ARHGEF3Q9NR81 526 aa5.69□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 MCM8Q9UJA3 840 aa5.69□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 USP18Q9UMW8 372 aa5.69□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 CLUHO75153 1309 aa5.69□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 TSC2P49815 1807 aa5.69□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 GBF1Q92538 1859 aa5.68□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 PTPRDP23468 1912 aa5.68□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 A0A1W2PQH9 124 aa5.68□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 CFAP69A5D8W1 941 aa5.68□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 CHADO15335 359 aa5.68□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 TMEM63AO94886 807 aa5.68□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 UNC5CO95185 931 aa5.68□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 MT-ND3P03897 115 aa5.68□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 KRT16P08779 473 aa5.68□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 CD48P09326 243 aa5.68□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 RBP3P10745 1247 aa5.68□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 TGM2P21980 687 aa5.68□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 CCND1P24385 295 aa5.68□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 DNAJB1P25685 340 aa5.68□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 SSTR1P30872 391 aa5.68□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 STIP1P31948 543 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 CCR1P32246 355 aa5.68□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 GPR15P49685 360 aa5.68□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 CLCN7P51798 805 aa5.68□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 AIF1P55008 147 aa5.68□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 CDH6P55285 790 aa5.68□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 BASP1P80723 227 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 COG7P83436 770 aa5.68□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 MTA1Q13330 715 aa5.68□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 DPYSL3Q14195 570 aa5.68□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP5.68□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 PDK2Q15119 407 aa5.68□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 E2F5Q15329 346 aa5.68□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 PARP6Q2NL67 630 aa5.68□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa5.68□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 C10orf120Q5SQS8 335 aa5.68□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 HECTD3Q5T447 861 aa5.68□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 SYPL2Q5VXT5 272 aa5.68□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 LILRA6Q6PI73 481 aa5.68□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 LVRNQ6Q4G3 990 aa5.68□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa5.68□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 Q7L0L9 218 aa5.68□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa5.68□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 KIF2BQ8N4N8 673 aa5.68□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa5.68□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 FAM71DQ8N9W8 422 aa5.68□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 MZB1Q8WU39 189 aa5.68□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 DCAKDQ8WVC6 231 aa5.68□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 TEKT4Q8WW24 435 aa5.68□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 INPP5DQ92835 1189 aa5.68□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 PSMG2Q969U7 264 aa5.68□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 GAL3ST3Q96A11 431 aa5.68□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 APOPT1Q96IL0 206 aa5.68□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 SERPINB11Q96P15 392 aa5.68□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 TMEM237Q96Q45 408 aa5.68□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 SLC2A13Q96QE2 648 aa5.68□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 TBCBQ99426 244 aa5.68□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 SLC38A3Q99624 504 aa5.68□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 MYLK2Q9H1R3 596 aa5.68□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 LRMDAQ9H2I8 198 aa5.68□□□□□ -1.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 C10orf88Q9H8K7 445 aa5.68□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.9 ms