RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495357.1

CCDC39-AS1-201, CCDC39 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CCDC39-AS1, Length 283 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 VAMP2P63027 116 aa4.68□□□□□ -1.66
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CCDC39-AS1-201ENST00000495357 EFHC1Q5JVL4 640 aa4.68□□□□□ -1.66
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP4.68□□□□□ -1.66
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TBC1D26Q86UD7 250 aa4.68□□□□□ -1.66
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CCDC39-AS1-201ENST00000495357 VPS33BQ9H267 617 aa4.66□□□□□ -1.66
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GAREM1Q9H706 876 aa4.66□□□□□ -1.66
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CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PYGLP06737 847 aa4.65□□□□□ -1.67
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CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP4.65□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MAPK9P45984 424 aa4.65□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TRPC3Q13507 836 aa4.65□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ARHGEF6Q15052 776 aa4.65□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TAF11Q15544 211 aa4.65□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 C11orf65Q8NCR3 313 aa4.65□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa4.65□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ERGIC1Q969X5 290 aa4.65□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HVCN1Q96D96 273 aa4.65□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RTP4Q96DX8 246 aa4.65□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HEMGNQ9BXL5 484 aa4.65□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MDFICQ9P1T7 246 aa4.65□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa4.65□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GJD2Q9UKL4 321 aa4.65□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CARD8Q9Y2G2 431 aa4.65□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa4.65□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
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