RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490163.5

UBXN4-208, Transcript of UBX domain protein 4, humanhuman

TSL 2

Gene UBXN4, Length 3,394 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4-208ENST00000490163 CYP2A13Q16696 494 aa3.05□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa3.05□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 GAGE2EQ4V326 116 aa3.05□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa3.05□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 TMEM196Q5HYL7 178 aa3.05□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa3.05□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 LCE3BQ5TA77 95 aa3.05□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa3.05□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa3.05□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 GAGE2AQ6NT46 116 aa3.05□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 RHOUQ7L0Q8 258 aa3.05□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 SPATA19Q7Z5L4 167 aa3.05□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 ZER1Q7Z7L7 766 aa3.05□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 ZNF276Q8N554 614 aa3.05□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP3.05□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 TTC9BQ8N6N2 239 aa3.05□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 TMEM237Q96Q45 408 aa3.05□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 LDAHQ9H6V9 325 aa3.05□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 PDE11AQ9HCR9 933 aa3.05□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 PAG1Q9NWQ8 432 aa3.05□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 DNAJB4Q9UDY4 337 aa3.05□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 GAGE2DQ9UEU5 116 aa3.05□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 A4GNTQ9UNA3 340 aa3.05□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 AATKQ6ZMQ8 1374 aa3.05□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 SHPRHQ149N8 1683 aa3.05□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 WNK3Q9BYP7 1800 aa3.05□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 A0A0U1RQF3 1178 aa3.05□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 ZNF785A8K8V0 405 aa3.05□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 DVL1O14640 695 aa3.05□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 PSMD10O75832 226 aa3.05□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 KLKB1P03952 638 aa3.05□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 RFPL3SP0C7P2 107 aa3.05□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 SPATA31D3P0C874 917 aa3.05□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 GAP43P17677 238 aa3.05□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 ADRA1DP25100 572 aa3.05□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 CDC25CP30307 473 aa3.05□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 CASRP41180 1078 aa3.05□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 GATMP50440 423 aa3.05□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 EPHB4P54760 987 aa3.05□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 GMFBP60983 142 aa3.05□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 RPP30P78346 268 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 E2F2Q14209 437 aa3.05□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 ARMC6Q6NXE6 501 aa3.05□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa3.05□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 OTOAQ7RTW8 1153 aa3.05□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa3.05□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 ARHGEF25Q86VW2 580 aa3.05□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa3.05□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 OR4N2Q8NGD1 307 aa3.05□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 MDM1Q8TC05 714 aa3.05□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 KIAA1524Q8TCG1 905 aa3.05□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 C3orf49Q96BT1 292 aa3.05□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 CALML4Q96GE6 196 aa3.05□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 WDFY2Q96P53 400 aa3.05□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 TM9SF3Q9HD45 589 aa3.05□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 TPSG1Q9NRR2 321 aa3.05□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 CNIH4Q9P003 139 aa3.05□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 AMACRQ9UHK6 382 aa3.05□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa3.05□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 MTMR6Q9Y217 621 aa3.05□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 KIF20BQ96Q89 1820 aa3.05□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 TECPR2O15040 1411 aa3.05□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 PIK3C2GO75747 1445 aa3.05□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa3.05□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 UQCRHLA0A096LP55 91 aa3.04□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 OR6C76A6NM76 312 aa3.04□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 O00370 1275 aa3.04□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 STBD1O95210 358 aa3.04□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 UQCRHP07919 91 aa3.04□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 RARGP13631 454 aa3.04□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 MGAT1P26572 445 aa3.04□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 THBS4P35443 961 aa3.04□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 MDH1P40925 334 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 SLC15A1P46059 708 aa3.04□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 RAB28P51157 221 aa3.04□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 SUOXP51687 545 aa3.04□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 PIGFQ07326 219 aa3.04□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa3.04□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 C6orf141Q5SZD1 244 aa3.04□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 RAB12Q6IQ22 244 aa3.04□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 SLC22A25Q6T423 547 aa3.04□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 TAOK1Q7L7X3 1001 aa3.04□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 KIF18AQ8NI77 898 aa3.04□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 KLHL29Q96CT2 875 aa3.04□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 C1orf74Q96LT6 269 aa3.04□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 CLIC6Q96NY7 704 aa3.04□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.6 ms