RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438490.2

RALGAPB-204, Transcript of Ral GTPase activating protein non-catalytic beta subunit, human

TSL 5

Gene RALGAPB, Length 4,075 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RALGAPB-204	ENST00000438490	KDELC1	Q6UW63	502 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	CES3	Q6UWW8	571 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	RANBP10	Q6VN20	620 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	ATG14	Q6ZNE5	492 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	ACAD11	Q709F0	780 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	CMC1	Q7Z7K0	106 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	DCP1B	Q8IZD4	617 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	TRPV1	Q8NER1	839 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	JPH3	Q8WXH2	748 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	TSPAN17	Q96FV3	270 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	SLC39A13	Q96H72	371 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	SERPINI1	Q99574	410 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	ZNF184	Q99676	751 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	MRPL57	Q9BQC6	102 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	OSBPL1A	Q9BXW6	950 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	CEP41	Q9BYV8	373 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	TRPV6	Q9H1D0	765 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	COG4	Q9H9E3	785 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	ZFYVE28	Q9HCC9	887 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	SPATS2L	Q9NUQ6	558 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	IL1RAPL1	Q9NZN1	696 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	MARCO	Q9UEW3	520 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	GTF2A1L	Q9UNN4	478 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	SCML2	Q9UQR0	700 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	ACOT9	Q9Y305	439 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	RGSL1	A5PLK6	1076 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	PALM2-AKAP2	B1ALY0	433 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	BUD23	O43709	281 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	SLC34A2	O95436	690 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	AMH	P03971	560 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	SBK3	P0C264	359 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	COL6A1	P12109	1028 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	RHOQ	P17081	205 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	CPA2	P48052	419 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	MTTP	P55157	894 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	MLLT6	P55198	1093 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	PWP1	Q13610	501 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	USP10	Q14694	798 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	FXN	Q16595	210 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	TRIM71	Q2Q1W2	868 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	ALF	Q53S48	1182 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	C1orf146	Q5VVC0	180 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	OVOS1	Q6IE37	1185 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	CAPRIN2	Q6IMN6	1127 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	LRRC8E	Q6NSJ5	796 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	PIWIL4	Q7Z3Z4	852 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	ZNF683	Q8IZ20	524 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	FBXW8	Q8N3Y1	598 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	AFAP1L2	Q8N4X5	818 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	TEX26	Q8N6G2	289 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	KLHDC9	Q8NEP7	349 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	PIP4K2C	Q8TBX8	421 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	GATA6	Q92908	595 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	PPP2R3C	Q969Q6	453 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	MAEL	Q96JY0	434 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	GPR78	Q96P69	363 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	AGAP2	Q99490	1192 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	SLC39A8	Q9C0K1	460 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	ZCWPW1	Q9H0M4	648 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	MRPL46	Q9H2W6	279 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	MRPL40	Q9NQ50	206 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	TCF7L2	Q9NQB0	619 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	PRDM5	Q9NQX1	630 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	CHRAC1	Q9NRG0	131 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	PDP2	Q9P2J9	529 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	ZNF638	Q14966	1978 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	FAM95C	A0A1B0GW59	222 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	FAM92A	A1XBS5	289 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	HEATR9	A2RTY3	570 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	TRPC5OS	A6NMA1	111 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	MEIS3P2	A8K0S8	358 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	GRID2	O43424	1007 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	PAGE1	O75459	146 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	TADA2A	O75478	443 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	EOMES	O95936	686 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	SLC35E2B	P0CK96	405 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	ATP5F1	P24539	256 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	PIK3R1	P27986	724 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	PFKP	Q01813	784 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	IRAK1BP1	Q5VVH5	260 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	SEL1L3	Q68CR1	1132 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	ZFP1	Q6P2D0	407 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	FBXL19	Q6PCT2	694 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	NAPRT	Q6XQN6	538 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	SCD5	Q86SK9	330 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	SPATA2L	Q8IUW3	424 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	ZNF781	Q8N8C0	355 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	FBXO27	Q8NI29	283 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	LENG1	Q96BZ8	264 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	ECSIT	Q9BQ95	431 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	FICD	Q9BVA6	458 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	OLA1	Q9NTK5	396 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	TMLHE	Q9NVH6	421 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	TMEM248	Q9NWD8	314 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	UTP6	Q9NYH9	597 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	SEC23IP	Q9Y6Y8	1000 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	IGLV3-10	A0A075B6K4	115 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	CASTOR2	A6NHX0	329 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	SLC7A4	O43246	635 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RALGAPB-204	ENST00000438490	ADAMTS4	O75173	837 aa		4.62	□□□□□ -1.67

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