RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409024.3

POLR1A-202, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1A, Length 560 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-202ENST00000409024 MUTYHQ9UIF7 546 aa9.89□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 CCL26Q9Y258 94 aa9.89□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 HS3ST2Q9Y278 367 aa9.89□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 MROH6A6NGR9 719 aa9.88□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 FAM47DPA6NHR8 397 aa9.88□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 MUSKO15146 869 aa9.88□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 SLC7A4O43246 635 aa9.88□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 SOCS5O75159 536 aa9.88□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 PRAMEF12O95522 483 aa9.88□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 NFATC1O95644 943 aa9.88□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 CRTAMO95727 393 aa9.88□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 ADH1CP00326 375 aa9.88□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 GSRP00390 522 aa9.88□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 ASLP04424 464 aa9.88□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 SCNN1BP51168 640 aa9.88□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 RHOAP61586 193 aa9.88□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 NTHL1P78549 312 aa9.88□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 ACVR1Q04771 509 aa9.88□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 MTM1Q13496 603 aa9.88□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 PDGFRLQ15198 375 aa9.88□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 E2F5Q15329 346 aa9.88□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 SKIDA1Q1XH10 827 aa9.88□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 PITRM1Q5JRX3 1037 aa9.88□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 SIRPB2Q5JXA9 342 aa9.88□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 TSTD2Q5T7W7 516 aa9.88□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa9.88□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 PACS1Q6VY07 963 aa9.88□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 EP400NLQ6ZTU2 488 aa9.88□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 TPGS1Q6ZTW0 290 aa9.88□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 SRLQ86TD4 932 aa9.88□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 LCA5Q86VQ0 697 aa9.88□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 KCNMB4Q86W47 210 aa9.88□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 RNF135Q8IUD6 432 aa9.88□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 AHI1Q8N157 1196 aa9.88□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 ITFG1Q8TB96 612 aa9.88□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 BPIFB1Q8TDL5 484 aa9.88□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 STYXQ8WUJ0 223 aa9.88□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 ZSWIM3Q96MP5 696 aa9.88□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 ASB16Q96NS5 453 aa9.88□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa9.88□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 FAM167BQ9BTA0 163 aa9.88□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 BBS2Q9BXC9 721 aa9.88□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 NOD2Q9HC29 1040 aa9.88□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 CHRAC1Q9NRG0 131 aa9.88□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 LHX3Q9UBR4 397 aa9.88□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa9.88□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 SLC25A13Q9UJS0 675 aa9.88□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa9.88□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 NOTCH4Q99466 2003 aa9.87□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 TMEM120BA0PK00 339 aa9.87□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 TMEM221A6NGB7 291 aa9.87□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 M0R296 226 aa9.87□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 TIMM44O43615 452 aa9.87□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 TYROBPO43914 113 aa9.87□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 SNAP91O60641 907 aa9.87□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 CSPG5O95196 566 aa9.87□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 IGSF6O95976 241 aa9.87□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 TYRP14679 529 aa9.87□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 CHN1P15882 459 aa9.87□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 TPH1P17752 444 aa9.87□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 GLDCP23378 1020 aa9.87□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 CCNFP41002 786 aa9.87□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 ID4P47928 161 aa9.87□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 ATP1A2P50993 1020 aa9.87□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 GYS2P54840 703 aa9.87□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 GNGT1P63211 74 aa9.87□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 CRADDP78560 199 aa9.87□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 RAD51Q06609 339 aa9.87□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 HYAL1Q12794 435 aa9.87□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 ADAM15Q13444 863 aa9.87□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 POU6F1Q14863 301 aa9.87□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP9.87□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 PCSK7Q16549 785 aa9.87□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 ATAT1Q5SQI0 421 aa9.87□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 CES5AQ6NT32 575 aa9.87□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 TMC5Q6UXY8 1006 aa9.87□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 TRIM67Q6ZTA4 783 aa9.87□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 SH2D5Q6ZV89 423 aa9.87□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 CCDC91Q7Z6B0 441 aa9.87□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 RASSF3Q86WH2 238 aa9.87□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 TMEM25Q86YD3 366 aa9.87□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 NPAS3Q8IXF0 933 aa9.87□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 APCDD1Q8J025 514 aa9.87□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 NDUFAF2Q8N183 169 aa9.87□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 FBXL6Q8N531 539 aa9.87□□□□□ -0.83
POLR1A-202ENST00000409024 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.1 ms