RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392539.3

HOXD13-201, Transcript of homeobox D13, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD13, Length 2,240 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13-201ENST00000392539 TRIM4Q9C037 500 aa26.61■■□□□ 1.85
HOXD13-201ENST00000392539 MPP6Q9NZW5 540 aa26.61■■□□□ 1.85
HOXD13-201ENST00000392539 ARHGEF37A1IGU5 675 aa26.6■■□□□ 1.85
HOXD13-201ENST00000392539 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
HOXD13-201ENST00000392539 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
HOXD13-201ENST00000392539 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
HOXD13-201ENST00000392539 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
HOXD13-201ENST00000392539 MS4A2Q01362 244 aa26.6■■□□□ 1.85
HOXD13-201ENST00000392539 SULT2A1Q06520 285 aa26.6■■□□□ 1.85
HOXD13-201ENST00000392539 TUSC3Q13454 348 aa26.6■■□□□ 1.85
HOXD13-201ENST00000392539 PSMD5Q16401 504 aa26.6■■□□□ 1.85
HOXD13-201ENST00000392539 UGT2A3Q6UWM9 527 aa26.6■■□□□ 1.85
HOXD13-201ENST00000392539 C14orf80Q86SX3 495 aa26.6■■□□□ 1.85
HOXD13-201ENST00000392539 NPAS2Q99743 824 aa26.6■■□□□ 1.85
HOXD13-201ENST00000392539 AURKAO14965 403 aa26.59■■□□□ 1.85
HOXD13-201ENST00000392539 RBP1P09455 135 aa26.59■■□□□ 1.85
HOXD13-201ENST00000392539 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP26.59■■□□□ 1.85
HOXD13-201ENST00000392539 GNASQ5JWF2 1037 aa26.59■■□□□ 1.85
HOXD13-201ENST00000392539 FBXL19Q6PCT2 694 aa26.59■■□□□ 1.85
HOXD13-201ENST00000392539 CHSY3Q70JA7 882 aa26.59■■□□□ 1.85
HOXD13-201ENST00000392539 SERINC5Q86VE9 423 aa26.59■■□□□ 1.85
HOXD13-201ENST00000392539 MARVELD2Q8N4S9 558 aa26.59■■□□□ 1.85
HOXD13-201ENST00000392539 UROC1Q96N76 676 aa26.59■■□□□ 1.85
HOXD13-201ENST00000392539 SERPINB11Q96P15 392 aa26.59■■□□□ 1.85
HOXD13-201ENST00000392539 SPATA16Q9BXB7 569 aa26.59■■□□□ 1.85
HOXD13-201ENST00000392539 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
HOXD13-201ENST00000392539 OSER1Q9NX31 292 aa26.59■■□□□ 1.85
HOXD13-201ENST00000392539 RIMS3Q9UJD0 308 aa26.59■■□□□ 1.85
HOXD13-201ENST00000392539 NEMP2A6NFY4 417 aa26.59■■□□□ 1.85
HOXD13-201ENST00000392539 PGFP49763 221 aa26.59■■□□□ 1.85
HOXD13-201ENST00000392539 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
HOXD13-201ENST00000392539 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP26.59■■□□□ 1.85
HOXD13-201ENST00000392539 MAPRE2Q15555 327 aa26.59■■□□□ 1.85
HOXD13-201ENST00000392539 ADCY4Q8NFM4 1077 aa26.59■■□□□ 1.85
HOXD13-201ENST00000392539 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
HOXD13-201ENST00000392539 C1orf74Q96LT6 269 aa26.59■■□□□ 1.85
HOXD13-201ENST00000392539 OLFM1Q99784 485 aa26.59■■□□□ 1.85
HOXD13-201ENST00000392539 SYT17Q9BSW7 474 aa26.59■■□□□ 1.85
HOXD13-201ENST00000392539 ATP13A1Q9HD20 1204 aa26.59■■□□□ 1.85
HOXD13-201ENST00000392539 RAB26Q9ULW5 256 aa26.59■■□□□ 1.85
HOXD13-201ENST00000392539 DOCK4Q8N1I0 1966 aa26.58■■□□□ 1.85
HOXD13-201ENST00000392539 TRIM38O00635 465 aa26.58■■□□□ 1.85
HOXD13-201ENST00000392539 IPO13O94829 963 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
HOXD13-201ENST00000392539 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
HOXD13-201ENST00000392539 RENBPP51606 427 aa26.58■■□□□ 1.85
HOXD13-201ENST00000392539 ZNF280DQ6N043 979 aa26.58■■□□□ 1.85
HOXD13-201ENST00000392539 SPPL2BQ8TCT7 592 aa26.58■■□□□ 1.85
HOXD13-201ENST00000392539 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
HOXD13-201ENST00000392539 SUSD3Q96L08 255 aa26.58■■□□□ 1.85
HOXD13-201ENST00000392539 NDNQ99608 321 aa26.58■■□□□ 1.85
HOXD13-201ENST00000392539 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
HOXD13-201ENST00000392539 MEAF6Q9HAF1 191 aa26.58■■□□□ 1.85
HOXD13-201ENST00000392539 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
HOXD13-201ENST00000392539 A8MT66 165 aa26.58■■□□□ 1.85
HOXD13-201ENST00000392539 IGHA2P01877 340 aa26.58■■□□□ 1.85
HOXD13-201ENST00000392539 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
HOXD13-201ENST00000392539 SLC14A2Q15849 920 aa26.58■■□□□ 1.85
HOXD13-201ENST00000392539 CNPY1Q3B7I2 92 aa26.58■■□□□ 1.85
HOXD13-201ENST00000392539 GALNT7Q86SF2 657 aa26.58■■□□□ 1.85
HOXD13-201ENST00000392539 RNF135Q8IUD6 432 aa26.58■■□□□ 1.85
HOXD13-201ENST00000392539 FATE1Q969F0 183 aa26.58■■□□□ 1.85
HOXD13-201ENST00000392539 NMUR1Q9HB89 426 aa26.58■■□□□ 1.85
HOXD13-201ENST00000392539 PADI3Q9ULW8 664 aa26.58■■□□□ 1.85
HOXD13-201ENST00000392539 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
HOXD13-201ENST00000392539 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa26.57■■□□□ 1.84
HOXD13-201ENST00000392539 MGEA5O60502 916 aa26.57■■□□□ 1.84
HOXD13-201ENST00000392539 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
HOXD13-201ENST00000392539 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
HOXD13-201ENST00000392539 TYMPP19971 482 aa26.57■■□□□ 1.84
HOXD13-201ENST00000392539 CD52P31358 61 aa26.57■■□□□ 1.84
HOXD13-201ENST00000392539 STX5Q13190 355 aa26.57■■□□□ 1.84
HOXD13-201ENST00000392539 SQLEQ14534 574 aa26.57■■□□□ 1.84
HOXD13-201ENST00000392539 ACAP2Q15057 778 aa26.57■■□□□ 1.84
HOXD13-201ENST00000392539 ZNF789Q5FWF6 425 aa26.57■■□□□ 1.84
HOXD13-201ENST00000392539 NOMO2Q5JPE7 1267 aa26.57■■□□□ 1.84
HOXD13-201ENST00000392539 CXCL17Q6UXB2 119 aa26.57■■□□□ 1.84
HOXD13-201ENST00000392539 GK5Q6ZS86 529 aa26.57■■□□□ 1.84
HOXD13-201ENST00000392539 SLC22A9Q8IVM8 553 aa26.57■■□□□ 1.84
HOXD13-201ENST00000392539 RNF148Q8N7C7 305 aa26.57■■□□□ 1.84
HOXD13-201ENST00000392539 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
HOXD13-201ENST00000392539 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
HOXD13-201ENST00000392539 CYP4F12Q9HCS2 524 aa26.57■■□□□ 1.84
HOXD13-201ENST00000392539 VPS45Q9NRW7 570 aa26.57■■□□□ 1.84
HOXD13-201ENST00000392539 NUDT5Q9UKK9 219 aa26.57■■□□□ 1.84
HOXD13-201ENST00000392539 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa26.57■■□□□ 1.84
HOXD13-201ENST00000392539 A0A1W2PQH9 124 aa26.57■■□□□ 1.84
HOXD13-201ENST00000392539 ACOT8O14734 319 aa26.57■■□□□ 1.84
HOXD13-201ENST00000392539 PEX11BO96011 259 aa26.57■■□□□ 1.84
HOXD13-201ENST00000392539 CCDC166P0CW27 439 aa26.57■■□□□ 1.84
HOXD13-201ENST00000392539 NDST2P52849 883 aa26.57■■□□□ 1.84
HOXD13-201ENST00000392539 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
HOXD13-201ENST00000392539 PTK2BQ14289 1009 aa26.57■■□□□ 1.84
HOXD13-201ENST00000392539 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa26.57■■□□□ 1.84
HOXD13-201ENST00000392539 NT5MQ9NPB1 228 aa26.57■■□□□ 1.84
HOXD13-201ENST00000392539 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa26.56■■□□□ 1.84
HOXD13-201ENST00000392539 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
HOXD13-201ENST00000392539 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
HOXD13-201ENST00000392539 TLR1Q15399 786 aa26.56■■□□□ 1.84
HOXD13-201ENST00000392539 ARPINQ7Z6K5 226 aa26.56■■□□□ 1.84
HOXD13-201ENST00000392539 CUZD1Q86UP6 607 aa26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.3 ms