RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368671.3

CLRN3-201, Transcript of clarin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLRN3, Length 1,152 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLRN3-201ENST00000368671 XPAP23025 273 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
CLRN3-201ENST00000368671 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
CLRN3-201ENST00000368671 SOX5P35711 763 aa10.47□□□□□ -0.73
CLRN3-201ENST00000368671 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
CLRN3-201ENST00000368671 NSFP46459 744 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
CLRN3-201ENST00000368671 UCNP55089 124 aa10.47□□□□□ -0.73
CLRN3-201ENST00000368671 CFHR1Q03591 330 aa10.47□□□□□ -0.73
CLRN3-201ENST00000368671 RAD51Q06609 339 aa10.47□□□□□ -0.73
CLRN3-201ENST00000368671 PTP4A2Q12974 167 aa10.47□□□□□ -0.73
CLRN3-201ENST00000368671 TCEA2Q15560 299 aa10.47□□□□□ -0.73
CLRN3-201ENST00000368671 KLHL40Q2TBA0 621 aa10.47□□□□□ -0.73
CLRN3-201ENST00000368671 SCYL2Q6P3W7 929 aa10.47□□□□□ -0.73
CLRN3-201ENST00000368671 PCSK4Q6UW60 755 aa10.47□□□□□ -0.73
CLRN3-201ENST00000368671 TRIM72Q6ZMU5 477 aa10.47□□□□□ -0.73
CLRN3-201ENST00000368671 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
CLRN3-201ENST00000368671 SLFN11Q7Z7L1 901 aa10.47□□□□□ -0.73
CLRN3-201ENST00000368671 SLC35F3Q8IY50 421 aa10.47□□□□□ -0.73
CLRN3-201ENST00000368671 PYROXD2Q8N2H3 581 aa10.47□□□□□ -0.73
CLRN3-201ENST00000368671 ZNF843Q8N446 348 aa10.47□□□□□ -0.73
CLRN3-201ENST00000368671 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
CLRN3-201ENST00000368671 VOPP1Q96AW1 172 aa10.47□□□□□ -0.73
CLRN3-201ENST00000368671 CENPTQ96BT3 561 aa10.47□□□□□ -0.73
CLRN3-201ENST00000368671 EXOC2Q96KP1 924 aa10.47□□□□□ -0.73
CLRN3-201ENST00000368671 PCDHB18PQ96TA0 734 aa10.47□□□□□ -0.73
CLRN3-201ENST00000368671 NCAPGQ9BPX3 1015 aa10.47□□□□□ -0.73
CLRN3-201ENST00000368671 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP10.47□□□□□ -0.73
CLRN3-201ENST00000368671 LRRC61Q9BV99 259 aa10.47□□□□□ -0.73
CLRN3-201ENST00000368671 BOCQ9BWV1 1114 aa10.47□□□□□ -0.73
CLRN3-201ENST00000368671 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa10.47□□□□□ -0.73
CLRN3-201ENST00000368671 SLC13A1Q9BZW2 595 aa10.47□□□□□ -0.73
CLRN3-201ENST00000368671 TTYH3Q9C0H2 523 aa10.47□□□□□ -0.73
CLRN3-201ENST00000368671 KLC2Q9H0B6 622 aa10.47□□□□□ -0.73
CLRN3-201ENST00000368671 RETREG1Q9H6L5 497 aa10.47□□□□□ -0.73
CLRN3-201ENST00000368671 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
CLRN3-201ENST00000368671 ADAM22Q9P0K1 906 aa10.47□□□□□ -0.73
CLRN3-201ENST00000368671 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
CLRN3-201ENST00000368671 DOLKQ9UPQ8 538 aa10.47□□□□□ -0.73
CLRN3-201ENST00000368671 COQ6Q9Y2Z9 468 aa10.47□□□□□ -0.73
CLRN3-201ENST00000368671 NBEAQ8NFP9 2946 aa10.47□□□□□ -0.73
CLRN3-201ENST00000368671 APC2O95996 2303 aa10.46□□□□□ -0.73
CLRN3-201ENST00000368671 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.73
CLRN3-201ENST00000368671 PMS2P1A4D2B8 440 aa10.46□□□□□ -0.73
CLRN3-201ENST00000368671 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.73
CLRN3-201ENST00000368671 ERVH48-1M5A8F1 160 aa10.46□□□□□ -0.73
CLRN3-201ENST00000368671 EPHB6O15197 1021 aa10.46□□□□□ -0.73
CLRN3-201ENST00000368671 YY2O15391 372 aa10.46□□□□□ -0.73
CLRN3-201ENST00000368671 INSIG1O15503 277 aa10.46□□□□□ -0.73
CLRN3-201ENST00000368671 CCP110O43303 1012 aa10.46□□□□□ -0.73
CLRN3-201ENST00000368671 CREB3O43889 395 aa10.46□□□□□ -0.73
CLRN3-201ENST00000368671 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.73
CLRN3-201ENST00000368671 PIGNO95427 931 aa10.46□□□□□ -0.73
CLRN3-201ENST00000368671 TPM2P07951 284 aa10.46□□□□□ -0.73
CLRN3-201ENST00000368671 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.73
CLRN3-201ENST00000368671 CCNYL3P0C7X3 344 aa10.46□□□□□ -0.73
CLRN3-201ENST00000368671 UNGP13051 313 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.73
CLRN3-201ENST00000368671 TSHRP16473 764 aa10.46□□□□□ -0.73
CLRN3-201ENST00000368671 EPHB2P29323 1055 aa10.46□□□□□ -0.73
CLRN3-201ENST00000368671 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.73
CLRN3-201ENST00000368671 STAT1P42224 750 aa10.46□□□□□ -0.73
CLRN3-201ENST00000368671 JAM2P57087 298 aa10.46□□□□□ -0.73
CLRN3-201ENST00000368671 YPEL5P62699 121 aa10.46□□□□□ -0.73
CLRN3-201ENST00000368671 PPARDQ03181 441 aa10.46□□□□□ -0.73
CLRN3-201ENST00000368671 IRF4Q15306 451 aa10.46□□□□□ -0.73
CLRN3-201ENST00000368671 SYCP1Q15431 976 aa10.46□□□□□ -0.73
CLRN3-201ENST00000368671 EFHC2Q5JST6 749 aa10.46□□□□□ -0.73
CLRN3-201ENST00000368671 FKBP15Q5T1M5 1219 aa10.46□□□□□ -0.73
CLRN3-201ENST00000368671 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
CLRN3-201ENST00000368671 MACC1Q6ZN28 852 aa10.46□□□□□ -0.73
CLRN3-201ENST00000368671 ZNF605Q86T29 641 aa10.46□□□□□ -0.73
CLRN3-201ENST00000368671 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
CLRN3-201ENST00000368671 TPCN2Q8NHX9 752 aa10.46□□□□□ -0.73
CLRN3-201ENST00000368671 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.73
CLRN3-201ENST00000368671 NTAN1Q96AB6 310 aa10.46□□□□□ -0.73
CLRN3-201ENST00000368671 HMCESQ96FZ2 354 aa10.46□□□□□ -0.73
CLRN3-201ENST00000368671 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.73
CLRN3-201ENST00000368671 CCDC3Q9BQI4 270 aa10.46□□□□□ -0.73
CLRN3-201ENST00000368671 CLPBQ9H078 707 aa10.46□□□□□ -0.73
CLRN3-201ENST00000368671 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
CLRN3-201ENST00000368671 CHMP5Q9NZZ3 219 aa10.46□□□□□ -0.73
CLRN3-201ENST00000368671 SIRPGQ9P1W8 387 aa10.46□□□□□ -0.73
CLRN3-201ENST00000368671 GULP1Q9UBP9 304 aa10.46□□□□□ -0.73
CLRN3-201ENST00000368671 ANKRD36A6QL64 1941 aa10.46□□□□□ -0.74
CLRN3-201ENST00000368671 LRRK1Q38SD2 2015 aa10.46□□□□□ -0.74
CLRN3-201ENST00000368671 LAMA5O15230 3695 aa10.46□□□□□ -0.74
CLRN3-201ENST00000368671 ITPR1Q14643 2758 aa10.45□□□□□ -0.74
CLRN3-201ENST00000368671 ACACAQ13085 2346 aa10.45□□□□□ -0.74
CLRN3-201ENST00000368671 LRP4O75096 1905 aa10.45□□□□□ -0.74
CLRN3-201ENST00000368671 RASA4BC9J798 803 aa10.45□□□□□ -0.74
CLRN3-201ENST00000368671 RASA4O43374 803 aa10.45□□□□□ -0.74
CLRN3-201ENST00000368671 TCEA3O75764 348 aa10.45□□□□□ -0.74
CLRN3-201ENST00000368671 CTSEP14091 401 aa10.45□□□□□ -0.74
CLRN3-201ENST00000368671 PLA2G2AP14555 144 aa10.45□□□□□ -0.74
CLRN3-201ENST00000368671 TIMP2P16035 220 aa10.45□□□□□ -0.74
CLRN3-201ENST00000368671 PRR20EP86478 221 aa10.45□□□□□ -0.74
CLRN3-201ENST00000368671 PRR20CP86479 221 aa10.45□□□□□ -0.74
CLRN3-201ENST00000368671 PRR20DP86480 221 aa10.45□□□□□ -0.74
CLRN3-201ENST00000368671 PRR20BP86481 221 aa10.45□□□□□ -0.74
CLRN3-201ENST00000368671 PRR20AP86496 221 aa10.45□□□□□ -0.74
CLRN3-201ENST00000368671 RHDQ02161 417 aa10.45□□□□□ -0.74
CLRN3-201ENST00000368671 SPIDRQ14159 915 aa10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.5 ms