RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000313173.5

HOXD8-201, Transcript of homeobox D8, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-201ENST00000313173 OCRLQ01968 901 aa27.01■■□□□ 1.91
HOXD8-201ENST00000313173 ACVR1Q04771 509 aa27.01■■□□□ 1.91
HOXD8-201ENST00000313173 CDH18Q13634 790 aa27.01■■□□□ 1.91
HOXD8-201ENST00000313173 PPM1LQ5SGD2 360 aa27.01■■□□□ 1.91
HOXD8-201ENST00000313173 CES4AQ5XG92 561 aa27.01■■□□□ 1.91
HOXD8-201ENST00000313173 MBLAC2Q68D91 279 aa27.01■■□□□ 1.91
HOXD8-201ENST00000313173 EXOC2Q96KP1 924 aa27.01■■□□□ 1.91
HOXD8-201ENST00000313173 NSMCE3Q96MG7 304 aa27.01■■□□□ 1.91
HOXD8-201ENST00000313173 FEM1AQ9BSK4 669 aa27.01■■□□□ 1.91
HOXD8-201ENST00000313173 MFSD1Q9H3U5 465 aa27.01■■□□□ 1.91
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF358Q9NW07 568 aa27.01■■□□□ 1.91
HOXD8-201ENST00000313173 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP27.01■■□□□ 1.91
HOXD8-201ENST00000313173 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.91
HOXD8-201ENST00000313173 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa27■■□□□ 1.91
HOXD8-201ENST00000313173 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP27■■□□□ 1.91
HOXD8-201ENST00000313173 TMCC1O94876 653 aa27■■□□□ 1.91
HOXD8-201ENST00000313173 MAGEA9P43362 315 aa27■■□□□ 1.91
HOXD8-201ENST00000313173 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP27■■□□□ 1.91
HOXD8-201ENST00000313173 RFWD2Q8NHY2 731 aa27■■□□□ 1.91
HOXD8-201ENST00000313173 BRSK1Q8TDC3 778 aa27■■□□□ 1.91
HOXD8-201ENST00000313173 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa27■■□□□ 1.91
HOXD8-201ENST00000313173 ABHD8Q96I13 439 aa27■■□□□ 1.91
HOXD8-201ENST00000313173 COPG2Q9UBF2 871 aa27■■□□□ 1.91
HOXD8-201ENST00000313173 VPS28Q9UK41 221 aa27■■□□□ 1.91
HOXD8-201ENST00000313173 TLK1Q9UKI8 766 aa27■■□□□ 1.91
HOXD8-201ENST00000313173 DCTN3O75935 186 aa27■■□□□ 1.91
HOXD8-201ENST00000313173 CSPG5O95196 566 aa27■■□□□ 1.91
HOXD8-201ENST00000313173 GJA1P17302 382 aa27■■□□□ 1.91
HOXD8-201ENST00000313173 DNAJB1P25685 340 aa27■■□□□ 1.91
HOXD8-201ENST00000313173 CLCN4P51793 760 aa27■■□□□ 1.91
HOXD8-201ENST00000313173 RAPH1Q70E73 1250 aa27■■□□□ 1.91
HOXD8-201ENST00000313173 GALNT7Q86SF2 657 aa27■■□□□ 1.91
HOXD8-201ENST00000313173 LCA5Q86VQ0 697 aa27■■□□□ 1.91
HOXD8-201ENST00000313173 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa27■■□□□ 1.91
HOXD8-201ENST00000313173 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP27■■□□□ 1.91
HOXD8-201ENST00000313173 SPPL3Q8TCT6 385 aa27■■□□□ 1.91
HOXD8-201ENST00000313173 POF1BQ8WVV4 589 aa27■■□□□ 1.91
HOXD8-201ENST00000313173 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP27■■□□□ 1.91
HOXD8-201ENST00000313173 TLR9Q9NR96 1032 aa27■■□□□ 1.91
HOXD8-201ENST00000313173 RIMKLBQ9ULI2 386 aa27■■□□□ 1.91
HOXD8-201ENST00000313173 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP26.99■■□□□ 1.91
HOXD8-201ENST00000313173 CSKP41240 450 aa26.99■■□□□ 1.91
HOXD8-201ENST00000313173 SLC20A2Q08357 652 aa26.99■■□□□ 1.91
HOXD8-201ENST00000313173 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP26.99■■□□□ 1.91
HOXD8-201ENST00000313173 STX3Q13277 289 aa26.99■■□□□ 1.91
HOXD8-201ENST00000313173 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP26.99■■□□□ 1.91
HOXD8-201ENST00000313173 LINGO4Q6UY18 593 aa26.99■■□□□ 1.91
HOXD8-201ENST00000313173 BBS7Q8IWZ6 715 aa26.99■■□□□ 1.91
HOXD8-201ENST00000313173 LMNTD2Q8IXW0 634 aa26.99■■□□□ 1.91
HOXD8-201ENST00000313173 DCAF4L2Q8NA75 395 aa26.99■■□□□ 1.91
HOXD8-201ENST00000313173 TTC16Q8NEE8 873 aa26.99■■□□□ 1.91
HOXD8-201ENST00000313173 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa26.99■■□□□ 1.91
HOXD8-201ENST00000313173 WFDC5Q8TCV5 224 aa26.99■■□□□ 1.91
HOXD8-201ENST00000313173 ALG14Q96F25 216 aa26.99■■□□□ 1.91
HOXD8-201ENST00000313173 DCTN4Q9UJW0 460 aa26.99■■□□□ 1.91
HOXD8-201ENST00000313173 RWDD3Q9Y3V2 267 aa26.99■■□□□ 1.91
HOXD8-201ENST00000313173 KCTD3Q9Y597 815 aa26.99■■□□□ 1.91
HOXD8-201ENST00000313173 HELZP42694 1942 aaKnown RBP26.98■■□□□ 1.91
HOXD8-201ENST00000313173 ARSDP51689 593 aa26.98■■□□□ 1.91
HOXD8-201ENST00000313173 PRAMEP78395 509 aa26.98■■□□□ 1.91
HOXD8-201ENST00000313173 SETDB1Q15047 1291 aa26.98■■□□□ 1.91
HOXD8-201ENST00000313173 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP26.98■■□□□ 1.91
HOXD8-201ENST00000313173 MFN1Q8IWA4 741 aa26.98■■□□□ 1.91
HOXD8-201ENST00000313173 MFSD6LQ8IWD5 586 aa26.98■■□□□ 1.91
HOXD8-201ENST00000313173 HDAC10Q969S8 669 aa26.98■■□□□ 1.91
HOXD8-201ENST00000313173 SLC46A2Q9BY10 475 aa26.98■■□□□ 1.91
HOXD8-201ENST00000313173 CHKBQ9Y259 395 aa26.98■■□□□ 1.91
HOXD8-201ENST00000313173 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP26.98■■□□□ 1.91
HOXD8-201ENST00000313173 HAUS5O94927 633 aa26.98■■□□□ 1.91
HOXD8-201ENST00000313173 SLC35E2BP0CK96 405 aa26.98■■□□□ 1.91
HOXD8-201ENST00000313173 SAT1P21673 171 aa26.98■■□□□ 1.91
HOXD8-201ENST00000313173 KCNA4P22459 653 aa26.98■■□□□ 1.91
HOXD8-201ENST00000313173 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP26.98■■□□□ 1.91
HOXD8-201ENST00000313173 RAB10P61026 200 aa26.98■■□□□ 1.91
HOXD8-201ENST00000313173 SLC12A1Q13621 1099 aa26.98■■□□□ 1.91
HOXD8-201ENST00000313173 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa26.98■■□□□ 1.91
HOXD8-201ENST00000313173 RTL10Q7L3V2 364 aa26.98■■□□□ 1.91
HOXD8-201ENST00000313173 RNF135Q8IUD6 432 aa26.98■■□□□ 1.91
HOXD8-201ENST00000313173 C10orf67Q8IYJ2 551 aa26.98■■□□□ 1.91
HOXD8-201ENST00000313173 DDI1Q8WTU0 396 aa26.98■■□□□ 1.91
HOXD8-201ENST00000313173 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa26.98■■□□□ 1.91
HOXD8-201ENST00000313173 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP26.98■■□□□ 1.91
HOXD8-201ENST00000313173 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP26.98■■□□□ 1.91
HOXD8-201ENST00000313173 LHX3Q9UBR4 397 aa26.98■■□□□ 1.91
HOXD8-201ENST00000313173 VPS51Q9UID3 782 aa26.98■■□□□ 1.91
HOXD8-201ENST00000313173 ARL5AQ9Y689 179 aa26.98■■□□□ 1.91
HOXD8-201ENST00000313173 LEFTY2O00292 366 aa26.97■■□□□ 1.91
HOXD8-201ENST00000313173 COL6A2P12110 1019 aa26.97■■□□□ 1.91
HOXD8-201ENST00000313173 CPA3P15088 417 aa26.97■■□□□ 1.91
HOXD8-201ENST00000313173 UBE3AQ05086 875 aa26.97■■□□□ 1.91
HOXD8-201ENST00000313173 MPPE1Q53F39 396 aa26.97■■□□□ 1.91
HOXD8-201ENST00000313173 MPP7Q5T2T1 576 aa26.97■■□□□ 1.91
HOXD8-201ENST00000313173 CILP2Q8IUL8 1156 aa26.97■■□□□ 1.91
HOXD8-201ENST00000313173 C10orf107Q8IVU9 208 aa26.97■■□□□ 1.91
HOXD8-201ENST00000313173 OR6P1Q8NGX9 317 aa26.97■■□□□ 1.91
HOXD8-201ENST00000313173 ELMO2Q96JJ3 720 aa26.97■■□□□ 1.91
HOXD8-201ENST00000313173 TSNARE1Q96NA8 513 aa26.97■■□□□ 1.91
HOXD8-201ENST00000313173 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP26.97■■□□□ 1.91
HOXD8-201ENST00000313173 THAP1Q9NVV9 213 aa26.97■■□□□ 1.91
HOXD8-201ENST00000313173 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.5 ms