RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249440.4

HOXD3-201, Transcript of homeobox D3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD3, Length 2,303 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD3-201ENST00000249440 AP1G1O43747 822 aa16.54■□□□□ 0.24
HOXD3-201ENST00000249440 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
HOXD3-201ENST00000249440 IPO13O94829 963 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
HOXD3-201ENST00000249440 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
HOXD3-201ENST00000249440 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP16.54■□□□□ 0.24
HOXD3-201ENST00000249440 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
HOXD3-201ENST00000249440 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
HOXD3-201ENST00000249440 MS4A2Q01362 244 aa16.54■□□□□ 0.24
HOXD3-201ENST00000249440 TECRLQ5HYJ1 363 aa16.54■□□□□ 0.24
HOXD3-201ENST00000249440 GNASQ5JWF2 1037 aa16.54■□□□□ 0.24
HOXD3-201ENST00000249440 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
HOXD3-201ENST00000249440 PELI3Q8N2H9 469 aa16.54■□□□□ 0.24
HOXD3-201ENST00000249440 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
HOXD3-201ENST00000249440 TSPAN17Q96FV3 270 aa16.54■□□□□ 0.24
HOXD3-201ENST00000249440 SPATA16Q9BXB7 569 aa16.54■□□□□ 0.24
HOXD3-201ENST00000249440 TRIM4Q9C037 500 aa16.54■□□□□ 0.24
HOXD3-201ENST00000249440 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
HOXD3-201ENST00000249440 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
HOXD3-201ENST00000249440 MPP6Q9NZW5 540 aa16.54■□□□□ 0.24
HOXD3-201ENST00000249440 HS3ST4Q9Y661 456 aa16.54■□□□□ 0.24
HOXD3-201ENST00000249440 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
HOXD3-201ENST00000249440 TTC3P53804 2025 aa16.54■□□□□ 0.24
HOXD3-201ENST00000249440 ARHGEF37A1IGU5 675 aa16.54■□□□□ 0.24
HOXD3-201ENST00000249440 MYADML2A6NDP7 307 aa16.54■□□□□ 0.24
HOXD3-201ENST00000249440 NEMP2A6NFY4 417 aa16.54■□□□□ 0.24
HOXD3-201ENST00000249440 KCNU1A8MYU2 1149 aa16.54■□□□□ 0.24
HOXD3-201ENST00000249440 TNFRSF10BO14763 440 aa16.54■□□□□ 0.24
HOXD3-201ENST00000249440 RBP1P09455 135 aa16.54■□□□□ 0.24
HOXD3-201ENST00000249440 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
HOXD3-201ENST00000249440 DPP6P42658 865 aa16.54■□□□□ 0.24
HOXD3-201ENST00000249440 RENBPP51606 427 aa16.54■□□□□ 0.24
HOXD3-201ENST00000249440 CLCN5P51795 746 aa16.54■□□□□ 0.24
HOXD3-201ENST00000249440 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
HOXD3-201ENST00000249440 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
HOXD3-201ENST00000249440 ADGRE1Q14246 886 aa16.54■□□□□ 0.24
HOXD3-201ENST00000249440 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
HOXD3-201ENST00000249440 ARTNQ5T4W7 220 aa16.54■□□□□ 0.24
HOXD3-201ENST00000249440 FBXL19Q6PCT2 694 aa16.54■□□□□ 0.24
HOXD3-201ENST00000249440 UGT2A3Q6UWM9 527 aa16.54■□□□□ 0.24
HOXD3-201ENST00000249440 CD300LGQ6UXG3 332 aa16.54■□□□□ 0.24
HOXD3-201ENST00000249440 MARVELD2Q8N4S9 558 aa16.54■□□□□ 0.24
HOXD3-201ENST00000249440 RNF148Q8N7C7 305 aa16.54■□□□□ 0.24
HOXD3-201ENST00000249440 ADCY4Q8NFM4 1077 aa16.54■□□□□ 0.24
HOXD3-201ENST00000249440 C1orf74Q96LT6 269 aa16.54■□□□□ 0.24
HOXD3-201ENST00000249440 SERPINB11Q96P15 392 aa16.54■□□□□ 0.24
HOXD3-201ENST00000249440 NDNQ99608 321 aa16.54■□□□□ 0.24
HOXD3-201ENST00000249440 NPAS2Q99743 824 aa16.54■□□□□ 0.24
HOXD3-201ENST00000249440 EPS15L1Q9UBC2 864 aa16.54■□□□□ 0.24
HOXD3-201ENST00000249440 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa16.54■□□□□ 0.24
HOXD3-201ENST00000249440 WASH4PA8MWX3 477 aa16.53■□□□□ 0.24
HOXD3-201ENST00000249440 AURKAO14965 403 aa16.53■□□□□ 0.24
HOXD3-201ENST00000249440 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
HOXD3-201ENST00000249440 GSTT1P30711 240 aa16.53■□□□□ 0.24
HOXD3-201ENST00000249440 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
HOXD3-201ENST00000249440 PFKPQ01813 784 aa16.53■□□□□ 0.24
HOXD3-201ENST00000249440 SULT2A1Q06520 285 aa16.53■□□□□ 0.24
HOXD3-201ENST00000249440 STX5Q13190 355 aa16.53■□□□□ 0.24
HOXD3-201ENST00000249440 TUSC3Q13454 348 aa16.53■□□□□ 0.24
HOXD3-201ENST00000249440 PTK2BQ14289 1009 aa16.53■□□□□ 0.24
HOXD3-201ENST00000249440 MAPRE2Q15555 327 aa16.53■□□□□ 0.24
HOXD3-201ENST00000249440 PSMD5Q16401 504 aa16.53■□□□□ 0.24
HOXD3-201ENST00000249440 KDELC1Q6UW63 502 aa16.53■□□□□ 0.24
HOXD3-201ENST00000249440 CHSY3Q70JA7 882 aa16.53■□□□□ 0.24
HOXD3-201ENST00000249440 SCD5Q86SK9 330 aa16.53■□□□□ 0.24
HOXD3-201ENST00000249440 SERINC5Q86VE9 423 aa16.53■□□□□ 0.24
HOXD3-201ENST00000249440 RNF135Q8IUD6 432 aa16.53■□□□□ 0.24
HOXD3-201ENST00000249440 SPPL2BQ8TCT7 592 aa16.53■□□□□ 0.24
HOXD3-201ENST00000249440 RANBP9Q96S59 729 aa16.53■□□□□ 0.24
HOXD3-201ENST00000249440 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
HOXD3-201ENST00000249440 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
HOXD3-201ENST00000249440 NUDT5Q9UKK9 219 aa16.53■□□□□ 0.24
HOXD3-201ENST00000249440 RAB26Q9ULW5 256 aa16.53■□□□□ 0.24
HOXD3-201ENST00000249440 PADI3Q9ULW8 664 aa16.53■□□□□ 0.24
HOXD3-201ENST00000249440 MYO16Q9Y6X6 1858 aa16.53■□□□□ 0.24
HOXD3-201ENST00000249440 PGFP49763 221 aa16.53■□□□□ 0.24
HOXD3-201ENST00000249440 ACAP2Q15057 778 aa16.53■□□□□ 0.24
HOXD3-201ENST00000249440 CXCL17Q6UXB2 119 aa16.53■□□□□ 0.24
HOXD3-201ENST00000249440 IFNL1Q8IU54 200 aa16.53■□□□□ 0.24
HOXD3-201ENST00000249440 UROC1Q96N76 676 aa16.53■□□□□ 0.24
HOXD3-201ENST00000249440 OLFM1Q99784 485 aa16.53■□□□□ 0.24
HOXD3-201ENST00000249440 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
HOXD3-201ENST00000249440 VPS45Q9NRW7 570 aa16.53■□□□□ 0.24
HOXD3-201ENST00000249440 RIMS3Q9UJD0 308 aa16.53■□□□□ 0.24
HOXD3-201ENST00000249440 FIS1Q9Y3D6 152 aa16.53■□□□□ 0.24
HOXD3-201ENST00000249440 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
HOXD3-201ENST00000249440 A0A0U1RQF3 1178 aa16.52■□□□□ 0.24
HOXD3-201ENST00000249440 A8MT66 165 aa16.52■□□□□ 0.24
HOXD3-201ENST00000249440 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa16.52■□□□□ 0.24
HOXD3-201ENST00000249440 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.24
HOXD3-201ENST00000249440 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.24
HOXD3-201ENST00000249440 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.24
HOXD3-201ENST00000249440 CCDC166P0CW27 439 aa16.52■□□□□ 0.24
HOXD3-201ENST00000249440 CTGFP29279 349 aa16.52■□□□□ 0.24
HOXD3-201ENST00000249440 ITKQ08881 620 aa16.52■□□□□ 0.24
HOXD3-201ENST00000249440 MGAT3Q09327 533 aa16.52■□□□□ 0.24
HOXD3-201ENST00000249440 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.24
HOXD3-201ENST00000249440 TLR1Q15399 786 aa16.52■□□□□ 0.24
HOXD3-201ENST00000249440 CNPY1Q3B7I2 92 aa16.52■□□□□ 0.24
HOXD3-201ENST00000249440 ZNF789Q5FWF6 425 aa16.52■□□□□ 0.24
HOXD3-201ENST00000249440 C14orf80Q86SX3 495 aa16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 227.9 ms