RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620722.4

CACNA2D3-212, Transcript of calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CACNA2D3, Length 3,296 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D3-212ENST00000620722 TRPV3Q8NET8 790 aa7.06□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 OR7G1Q8NGA0 311 aa7.06□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 CXorf38Q8TB03 319 aa7.06□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 SPPL2BQ8TCT7 592 aa7.06□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 CEP170P1Q96L14 293 aa7.06□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 CAMKK2Q96RR4 588 aa7.06□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 ADPGKQ9BRR6 497 aa7.06□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 TMEM134Q9H6X4 195 aa7.06□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 SYBUQ9NX95 663 aa7.06□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa7.06□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 SERPINA10Q9UK55 444 aa7.06□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa7.06□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 ST14Q9Y5Y6 855 aa7.06□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa7.06□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 MAGEB16A2A368 324 aa7.05□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 MRASO14807 208 aa7.05□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 NRP2O60462 931 aa7.05□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 DDHD2O94830 711 aa7.05□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 ERVK-10P10266 1014 aa7.05□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 BMP1P13497 986 aa7.05□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 NAMPTP43490 491 aa7.05□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 RPS9P46781 194 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 TPTEP56180 551 aa7.05□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 PHC1P78364 1004 aa7.05□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 DLG2Q15700 870 aa7.05□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 DPYSL2Q16555 572 aa7.05□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 CTF1Q16619 201 aa7.05□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 BTBD8Q5XKL5 378 aa7.05□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 AGR3Q8TD06 166 aa7.05□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 CYGBQ8WWM9 190 aa7.05□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 RXFP2Q8WXD0 754 aa7.05□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 MASTLQ96GX5 879 aa7.05□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 MARK4Q96L34 752 aa7.05□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 GPR22Q99680 433 aa7.05□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 MTRRQ9UBK8 725 aa7.05□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 OAZ3Q9UMX2 235 aa7.05□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 CARD8Q9Y2G2 431 aa7.05□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa7.05□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 FAM172BPA6NC97 362 aa7.05□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 EI24O14681 340 aa7.05□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 ITIH1P19827 911 aa7.05□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 GPD2P43304 727 aa7.05□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 CCR10P46092 362 aa7.05□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 CHRNEQ04844 493 aa7.05□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 SELPLGQ14242 412 aa7.05□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 SURF1Q15526 300 aa7.05□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 RAB6CQ53S08 254 aa7.05□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 NXNQ6DKJ4 435 aa7.05□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 PRR5LQ6MZQ0 368 aa7.05□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa7.05□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 UGT3A1Q6NUS8 523 aa7.05□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 STRA8Q7Z7C7 330 aa7.05□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 ARMC8Q8IUR7 673 aa7.05□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 OFCC1Q8IZS5 231 aa7.05□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 MINDY1Q8N5J2 469 aa7.05□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 ANKK1Q8NFD2 765 aa7.05□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 CALML6Q8TD86 181 aa7.05□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 AFG1LQ8WV93 481 aa7.05□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 BEGAINQ9BUH8 593 aa7.05□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 FUNDC2Q9BWH2 189 aa7.05□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 BTBD2Q9BX70 525 aa7.05□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 RAB6CQ9H0N0 254 aa7.05□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 FEM1BQ9UK73 627 aa7.05□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 TESMINQ9Y4I5 508 aa7.05□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa7.05□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa7.05□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 TCRBV5S2A0A599 114 aa7.05□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 CCDC78A2IDD5 438 aa7.05□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 NRP1O14786 923 aa7.05□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 GMNNO75496 209 aa7.05□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 GABARAPO95166 117 aa7.05□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 KCNH1O95259 989 aa7.05□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 CHEK2O96017 543 aa7.05□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 EDN1P05305 212 aa7.05□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 UMPSP11172 480 aa7.05□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 GFAPP14136 432 aa7.05□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 CRHBPP24387 322 aa7.05□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 CYP2F1P24903 491 aa7.05□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 ACVR2AP27037 513 aa7.05□□□□□ -1.28
CACNA2D3-212ENST00000620722 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
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