RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588667.5

ATG4D-208, Transcript of autophagy related 4D cysteine peptidase, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ATG4D, Length 1,619 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4D-208ENST00000588667 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa20.4■□□□□ 0.86
ATG4D-208ENST00000588667 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa20.4■□□□□ 0.86
ATG4D-208ENST00000588667 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
ATG4D-208ENST00000588667 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
ATG4D-208ENST00000588667 LIASO43766 372 aa20.4■□□□□ 0.86
ATG4D-208ENST00000588667 NDUFS2O75306 463 aa20.4■□□□□ 0.86
ATG4D-208ENST00000588667 LEFTY1O75610 366 aa20.4■□□□□ 0.86
ATG4D-208ENST00000588667 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
ATG4D-208ENST00000588667 POP4O95707 220 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
ATG4D-208ENST00000588667 GAS8O95995 478 aa20.4■□□□□ 0.86
ATG4D-208ENST00000588667 TGM2P21980 687 aa20.4■□□□□ 0.86
ATG4D-208ENST00000588667 DRD3P35462 400 aa20.4■□□□□ 0.86
ATG4D-208ENST00000588667 PTGIRP43119 386 aa20.4■□□□□ 0.86
ATG4D-208ENST00000588667 NR2C2P49116 596 aa20.4■□□□□ 0.86
ATG4D-208ENST00000588667 METAP1P53582 386 aa20.4■□□□□ 0.86
ATG4D-208ENST00000588667 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
ATG4D-208ENST00000588667 SLC10A7Q0GE19 358 aa20.4■□□□□ 0.86
ATG4D-208ENST00000588667 LPAL2Q16609 132 aa20.4■□□□□ 0.86
ATG4D-208ENST00000588667 MYLK3Q32MK0 819 aa20.4■□□□□ 0.86
ATG4D-208ENST00000588667 ARSIQ5FYB1 569 aa20.4■□□□□ 0.86
ATG4D-208ENST00000588667 LAIR1Q6GTX8 287 aa20.4■□□□□ 0.86
ATG4D-208ENST00000588667 LPCAT2Q7L5N7 544 aa20.4■□□□□ 0.86
ATG4D-208ENST00000588667 FAM124AQ86V42 546 aa20.4■□□□□ 0.86
ATG4D-208ENST00000588667 HDDC3Q8N4P3 179 aa20.4■□□□□ 0.86
ATG4D-208ENST00000588667 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
ATG4D-208ENST00000588667 OR6K2Q8NGY2 324 aa20.4■□□□□ 0.86
ATG4D-208ENST00000588667 EXOC2Q96KP1 924 aa20.4■□□□□ 0.86
ATG4D-208ENST00000588667 BTBD1Q9H0C5 482 aa20.4■□□□□ 0.86
ATG4D-208ENST00000588667 CCNCP24863 283 aa20.39■□□□□ 0.86
ATG4D-208ENST00000588667 KCNJ1P48048 391 aa20.39■□□□□ 0.86
ATG4D-208ENST00000588667 RAD51Q06609 339 aa20.39■□□□□ 0.86
ATG4D-208ENST00000588667 ZNF235Q14590 738 aa20.39■□□□□ 0.86
ATG4D-208ENST00000588667 PDK1Q15118 436 aa20.39■□□□□ 0.86
ATG4D-208ENST00000588667 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.86
ATG4D-208ENST00000588667 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.86
ATG4D-208ENST00000588667 BBS5Q8N3I7 341 aa20.39■□□□□ 0.86
ATG4D-208ENST00000588667 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.86
ATG4D-208ENST00000588667 FAM131CQ96AQ9 280 aa20.39■□□□□ 0.86
ATG4D-208ENST00000588667 PPP1R16AQ96I34 528 aa20.39■□□□□ 0.86
ATG4D-208ENST00000588667 LOXL4Q96JB6 756 aa20.39■□□□□ 0.86
ATG4D-208ENST00000588667 OLFM3Q96PB7 478 aa20.39■□□□□ 0.86
ATG4D-208ENST00000588667 HINFPQ9BQA5 517 aa20.39■□□□□ 0.86
ATG4D-208ENST00000588667 ERP44Q9BS26 406 aa20.39■□□□□ 0.86
ATG4D-208ENST00000588667 SGK2Q9HBY8 427 aa20.39■□□□□ 0.86
ATG4D-208ENST00000588667 FRYLO94915 3013 aa20.39■□□□□ 0.85
ATG4D-208ENST00000588667 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
ATG4D-208ENST00000588667 CSNK1DP48730 415 aa20.38■□□□□ 0.85
ATG4D-208ENST00000588667 RENBPP51606 427 aa20.38■□□□□ 0.85
ATG4D-208ENST00000588667 ZNF33AQ06730 810 aa20.38■□□□□ 0.85
ATG4D-208ENST00000588667 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
ATG4D-208ENST00000588667 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP20.38■□□□□ 0.85
ATG4D-208ENST00000588667 CUL1Q13616 776 aa20.38■□□□□ 0.85
ATG4D-208ENST00000588667 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
ATG4D-208ENST00000588667 PPP1R7Q15435 360 aa20.38■□□□□ 0.85
ATG4D-208ENST00000588667 POM121L1PQ3SYA9 428 aa20.38■□□□□ 0.85
ATG4D-208ENST00000588667 MARC1Q5VT66 337 aa20.38■□□□□ 0.85
ATG4D-208ENST00000588667 NPNTQ6UXI9 565 aa20.38■□□□□ 0.85
ATG4D-208ENST00000588667 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
ATG4D-208ENST00000588667 ACTL9Q8TC94 416 aa20.38■□□□□ 0.85
ATG4D-208ENST00000588667 P3H4Q92791 437 aa20.38■□□□□ 0.85
ATG4D-208ENST00000588667 HAUS1Q96CS2 278 aa20.38■□□□□ 0.85
ATG4D-208ENST00000588667 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa20.38■□□□□ 0.85
ATG4D-208ENST00000588667 NEUROG2Q9H2A3 272 aa20.38■□□□□ 0.85
ATG4D-208ENST00000588667 ARFGAP3Q9NP61 516 aa20.38■□□□□ 0.85
ATG4D-208ENST00000588667 DYRK4Q9NR20 520 aa20.38■□□□□ 0.85
ATG4D-208ENST00000588667 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
ATG4D-208ENST00000588667 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
ATG4D-208ENST00000588667 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa20.38■□□□□ 0.85
ATG4D-208ENST00000588667 PRR23AA6NEV1 266 aa20.38■□□□□ 0.85
ATG4D-208ENST00000588667 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
ATG4D-208ENST00000588667 MATN3O15232 486 aa20.38■□□□□ 0.85
ATG4D-208ENST00000588667 SLC7A4O43246 635 aa20.38■□□□□ 0.85
ATG4D-208ENST00000588667 ITGB7P26010 798 aa20.38■□□□□ 0.85
ATG4D-208ENST00000588667 GKP32189 559 aa20.38■□□□□ 0.85
ATG4D-208ENST00000588667 ACSL1P33121 698 aa20.38■□□□□ 0.85
ATG4D-208ENST00000588667 MMP13P45452 471 aa20.38■□□□□ 0.85
ATG4D-208ENST00000588667 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
ATG4D-208ENST00000588667 TMEFF1Q8IYR6 380 aa20.38■□□□□ 0.85
ATG4D-208ENST00000588667 CCNYQ8ND76 341 aa20.38■□□□□ 0.85
ATG4D-208ENST00000588667 SLC35B2Q8TB61 432 aa20.38■□□□□ 0.85
ATG4D-208ENST00000588667 SEC14L1Q92503 715 aa20.38■□□□□ 0.85
ATG4D-208ENST00000588667 MAML1Q92585 1016 aa20.38■□□□□ 0.85
ATG4D-208ENST00000588667 VOPP1Q96AW1 172 aa20.38■□□□□ 0.85
ATG4D-208ENST00000588667 FAM122AQ96E09 287 aa20.38■□□□□ 0.85
ATG4D-208ENST00000588667 FAM118BQ9BPY3 351 aa20.38■□□□□ 0.85
ATG4D-208ENST00000588667 TRIM51Q9BSJ1 452 aa20.38■□□□□ 0.85
ATG4D-208ENST00000588667 GPR174Q9BXC1 333 aa20.38■□□□□ 0.85
ATG4D-208ENST00000588667 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
ATG4D-208ENST00000588667 BRD8Q9H0E9 1235 aa20.38■□□□□ 0.85
ATG4D-208ENST00000588667 PCED1AQ9H1Q7 454 aa20.38■□□□□ 0.85
ATG4D-208ENST00000588667 FAM114A2Q9NRY5 505 aa20.38■□□□□ 0.85
ATG4D-208ENST00000588667 DNPEPQ9ULA0 475 aa20.38■□□□□ 0.85
ATG4D-208ENST00000588667 ZNF148Q9UQR1 794 aa20.38■□□□□ 0.85
ATG4D-208ENST00000588667 PI4KAP42356 2102 aa20.37■□□□□ 0.85
ATG4D-208ENST00000588667 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa20.37■□□□□ 0.85
ATG4D-208ENST00000588667 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
ATG4D-208ENST00000588667 ESYT3A0FGR9 886 aa20.37■□□□□ 0.85
ATG4D-208ENST00000588667 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
ATG4D-208ENST00000588667 RNF103O00237 685 aa20.37■□□□□ 0.85
ATG4D-208ENST00000588667 MUSKO15146 869 aa20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.1 ms