RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527952.1

PTPRJ-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRJ, Length 626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-205ENST00000527952 KRT31Q15323 416 aa24.34■■□□□ 1.49
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PTPRJ-205ENST00000527952 MACC1Q6ZN28 852 aa24.29■■□□□ 1.48
PTPRJ-205ENST00000527952 HID1Q8IV36 788 aa24.29■■□□□ 1.48
PTPRJ-205ENST00000527952 CCDC3Q9BQI4 270 aa24.29■■□□□ 1.48
PTPRJ-205ENST00000527952 FANCLQ9NW38 375 aa24.29■■□□□ 1.48
PTPRJ-205ENST00000527952 LHX3Q9UBR4 397 aa24.29■■□□□ 1.48
PTPRJ-205ENST00000527952 PADI4Q9UM07 663 aa24.29■■□□□ 1.48
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