RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504263.1

PCAT4-201, prostate cancer associated transcript 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PCAT4, Length 2,091 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCAT4-201ENST00000504263 Q3ZCU0 254 aa3.55□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 MTERF2Q49AM1 385 aa3.55□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 TEX44Q53QW1 395 aa3.55□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 PIGGQ5H8A4 983 aa3.55□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 FAM47AQ5JRC9 791 aa3.55□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 RALGPS1Q5JS13 557 aa3.55□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 ZNF484Q5JVG2 852 aa3.55□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 PERM1Q5SV97 790 aa3.55□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 ATAD3CQ5T2N8 411 aa3.55□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 GRTP1Q5TC63 336 aa3.55□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 CACHD1Q5VU97 1274 aa3.55□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 C16orf46Q6P387 395 aa3.55□□□□□ -1.84
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PCAT4-201ENST00000504263 ZNF773Q6PK81 442 aa3.55□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 MACC1Q6ZN28 852 aa3.55□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 CREB3L2Q70SY1 520 aa3.55□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 USP17L1Q7RTZ2 530 aa3.55□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 RETREG3Q86VR2 466 aa3.55□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 DGKHQ86XP1 1220 aa3.55□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 LYSMD2Q8IV50 215 aa3.55□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 RASGRP3Q8IV61 690 aa3.55□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 ZNF654Q8IZM8 581 aa3.55□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 LGI2Q8N0V4 545 aa3.55□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 CCDC185Q8N715 623 aa3.55□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 C2orf69Q8N8R5 385 aa3.55□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
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PCAT4-201ENST00000504263 PSD4Q8NDX1 1056 aa3.55□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 AGBL3Q8NEM8 1001 aa3.55□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 IL17RDQ8NFM7 739 aa3.55□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa3.55□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 LRRC20Q8TCA0 184 aa3.55□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa3.55□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 FKBP10Q96AY3 582 aa3.55□□□□□ -1.84
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PCAT4-201ENST00000504263 CNDP1Q96KN2 507 aa3.55□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa3.55□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 APOL5Q9BWW9 433 aa3.55□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 GPR88Q9GZN0 384 aa3.55□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP3.55□□□□□ -1.84
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PCAT4-201ENST00000504263 ACSS3Q9H6R3 686 aa3.55□□□□□ -1.84
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PCAT4-201ENST00000504263 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa3.55□□□□□ -1.84
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PCAT4-201ENST00000504263 FANCFQ9NPI8 374 aa3.55□□□□□ -1.84
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PCAT4-201ENST00000504263 UCKL1Q9NWZ5 548 aa3.55□□□□□ -1.84
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PCAT4-201ENST00000504263 ZSWIM5Q9P217 1185 aa3.55□□□□□ -1.84
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PCAT4-201ENST00000504263 ZNF229Q9UJW7 825 aa3.55□□□□□ -1.84
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PCAT4-201ENST00000504263 TSPY2A6NKD2 308 aa3.55□□□□□ -1.84
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PCAT4-201ENST00000504263 F5H6K3 240 aa3.55□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 TRAF5O00463 557 aa3.55□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 ACOT8O14734 319 aa3.55□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 APOL1O14791 398 aa3.55□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 RAD51BO15315 384 aa3.55□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 LPXNO60711 386 aa3.55□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 NDUFS2O75306 463 aa3.55□□□□□ -1.84
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PCAT4-201ENST00000504263 TSPY8P0CW00 308 aa3.55□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 ZNF3P17036 446 aa3.55□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 BGNP21810 368 aa3.55□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 KLRC2P26717 231 aa3.55□□□□□ -1.84
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PCAT4-201ENST00000504263 ERP29P30040 261 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 SOX5P35711 763 aa3.55□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 SERPINB5P36952 375 aa3.55□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 GRM5P41594 1212 aa3.55□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 HTR2BP41595 481 aa3.55□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 TSPAN7P41732 249 aa3.55□□□□□ -1.84
PCAT4-201ENST00000504263 GRIA3P42263 894 aa3.55□□□□□ -1.84
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