RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495022.5

TRDMT1-211, Transcript of tRNA aspartic acid methyltransferase 1, humanhuman

TSL 2

Gene TRDMT1, Length 1,374 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDMT1-211ENST00000495022 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa22.86■■□□□ 1.25
TRDMT1-211ENST00000495022 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
TRDMT1-211ENST00000495022 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa22.86■■□□□ 1.25
TRDMT1-211ENST00000495022 SPASTQ9UBP0 616 aa22.86■■□□□ 1.25
TRDMT1-211ENST00000495022 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa22.86■■□□□ 1.25
TRDMT1-211ENST00000495022 ZNF462Q96JM2 2506 aa22.85■■□□□ 1.25
TRDMT1-211ENST00000495022 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
TRDMT1-211ENST00000495022 IGSF6O95976 241 aa22.85■■□□□ 1.25
TRDMT1-211ENST00000495022 IGFALSP35858 605 aa22.85■■□□□ 1.25
TRDMT1-211ENST00000495022 YPEL5P62699 121 aa22.85■■□□□ 1.25
TRDMT1-211ENST00000495022 CDKN3Q16667 212 aa22.85■■□□□ 1.25
TRDMT1-211ENST00000495022 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa22.85■■□□□ 1.25
TRDMT1-211ENST00000495022 WDR59Q6PJI9 974 aa22.85■■□□□ 1.25
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TRDMT1-211ENST00000495022 TPCN2Q8NHX9 752 aa22.85■■□□□ 1.25
TRDMT1-211ENST00000495022 DKK3Q9UBP4 350 aa22.85■■□□□ 1.25
TRDMT1-211ENST00000495022 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
TRDMT1-211ENST00000495022 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa22.84■■□□□ 1.25
TRDMT1-211ENST00000495022 SIGLEC16A6NMB1 481 aa22.84■■□□□ 1.25
TRDMT1-211ENST00000495022 TM7SF2O76062 418 aa22.84■■□□□ 1.25
TRDMT1-211ENST00000495022 EPHB2P29323 1055 aa22.84■■□□□ 1.25
TRDMT1-211ENST00000495022 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
TRDMT1-211ENST00000495022 NR0B2Q15466 257 aa22.84■■□□□ 1.25
TRDMT1-211ENST00000495022 ISXQ2M1V0 245 aa22.84■■□□□ 1.25
TRDMT1-211ENST00000495022 DEFB133Q30KQ1 61 aa22.84■■□□□ 1.25
TRDMT1-211ENST00000495022 EFHC2Q5JST6 749 aa22.84■■□□□ 1.25
TRDMT1-211ENST00000495022 GUSBP11Q6P575 273 aa22.84■■□□□ 1.25
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TRDMT1-211ENST00000495022 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
TRDMT1-211ENST00000495022 ZNF354CQ86Y25 554 aa22.84■■□□□ 1.25
TRDMT1-211ENST00000495022 CXorf40AQ8TE69 158 aa22.84■■□□□ 1.25
TRDMT1-211ENST00000495022 GLMNQ92990 594 aa22.84■■□□□ 1.25
TRDMT1-211ENST00000495022 BOCQ9BWV1 1114 aa22.84■■□□□ 1.25
TRDMT1-211ENST00000495022 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
TRDMT1-211ENST00000495022 CPED1A4D0V7 1026 aa22.83■■□□□ 1.25
TRDMT1-211ENST00000495022 TGM2P21980 687 aa22.83■■□□□ 1.25
TRDMT1-211ENST00000495022 AIF1P55008 147 aa22.83■■□□□ 1.25
TRDMT1-211ENST00000495022 RHOAP61586 193 aa22.83■■□□□ 1.25
TRDMT1-211ENST00000495022 C19orf57Q0VDD7 668 aa22.83■■□□□ 1.25
TRDMT1-211ENST00000495022 PARP15Q460N3 678 aa22.83■■□□□ 1.25
TRDMT1-211ENST00000495022 MACC1Q6ZN28 852 aa22.83■■□□□ 1.25
TRDMT1-211ENST00000495022 MON1BQ7L1V2 547 aa22.83■■□□□ 1.25
TRDMT1-211ENST00000495022 VPS36Q86VN1 386 aa22.83■■□□□ 1.25
TRDMT1-211ENST00000495022 PHACTR4Q8IZ21 702 aa22.83■■□□□ 1.25
TRDMT1-211ENST00000495022 PYROXD2Q8N2H3 581 aa22.83■■□□□ 1.25
TRDMT1-211ENST00000495022 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
TRDMT1-211ENST00000495022 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
TRDMT1-211ENST00000495022 WASH4PA8MWX3 477 aa22.82■■□□□ 1.24
TRDMT1-211ENST00000495022 LMO7DNF2Z398 122 aa22.82■■□□□ 1.24
TRDMT1-211ENST00000495022 RPIAP49247 311 aa22.82■■□□□ 1.24
TRDMT1-211ENST00000495022 SUOXP51687 545 aa22.82■■□□□ 1.24
TRDMT1-211ENST00000495022 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
TRDMT1-211ENST00000495022 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
TRDMT1-211ENST00000495022 SERINC3Q13530 473 aa22.82■■□□□ 1.24
TRDMT1-211ENST00000495022 SYCP1Q15431 976 aa22.82■■□□□ 1.24
TRDMT1-211ENST00000495022 PRRT3Q5FWE3 981 aa22.82■■□□□ 1.24
TRDMT1-211ENST00000495022 LRRC73Q5JTD7 316 aa22.82■■□□□ 1.24
TRDMT1-211ENST00000495022 RBFAQ8N0V3 343 aa22.82■■□□□ 1.24
TRDMT1-211ENST00000495022 HMCESQ96FZ2 354 aa22.82■■□□□ 1.24
TRDMT1-211ENST00000495022 EPAS1Q99814 870 aa22.82■■□□□ 1.24
TRDMT1-211ENST00000495022 KLC2Q9H0B6 622 aa22.82■■□□□ 1.24
TRDMT1-211ENST00000495022 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa22.82■■□□□ 1.24
TRDMT1-211ENST00000495022 ASCL3Q9NQ33 180 aa22.82■■□□□ 1.24
TRDMT1-211ENST00000495022 THSD1Q9NS62 852 aa22.82■■□□□ 1.24
TRDMT1-211ENST00000495022 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
TRDMT1-211ENST00000495022 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa22.81■■□□□ 1.24
TRDMT1-211ENST00000495022 ANKRD62A6NC57 917 aa22.81■■□□□ 1.24
TRDMT1-211ENST00000495022 CCP110O43303 1012 aa22.81■■□□□ 1.24
TRDMT1-211ENST00000495022 MMP20O60882 483 aa22.81■■□□□ 1.24
TRDMT1-211ENST00000495022 GCATO75600 419 aa22.81■■□□□ 1.24
TRDMT1-211ENST00000495022 TCEA3O75764 348 aa22.81■■□□□ 1.24
TRDMT1-211ENST00000495022 TIMP2P16035 220 aa22.81■■□□□ 1.24
TRDMT1-211ENST00000495022 COPB1P53618 953 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
TRDMT1-211ENST00000495022 UCNP55089 124 aa22.81■■□□□ 1.24
TRDMT1-211ENST00000495022 CXADRP78310 365 aa22.81■■□□□ 1.24
TRDMT1-211ENST00000495022 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa22.81■■□□□ 1.24
TRDMT1-211ENST00000495022 BROXQ5VW32 411 aa22.81■■□□□ 1.24
TRDMT1-211ENST00000495022 DNAJC24Q6P3W2 148 aa22.81■■□□□ 1.24
TRDMT1-211ENST00000495022 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa22.81■■□□□ 1.24
TRDMT1-211ENST00000495022 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
TRDMT1-211ENST00000495022 NEK11Q8NG66 645 aa22.81■■□□□ 1.24
TRDMT1-211ENST00000495022 HCAR2Q8TDS4 363 aa22.81■■□□□ 1.24
TRDMT1-211ENST00000495022 NAT6Q93015 286 aa22.81■■□□□ 1.24
TRDMT1-211ENST00000495022 LRRC61Q9BV99 259 aa22.81■■□□□ 1.24
TRDMT1-211ENST00000495022 SLC13A1Q9BZW2 595 aa22.81■■□□□ 1.24
TRDMT1-211ENST00000495022 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
TRDMT1-211ENST00000495022 FANCLQ9NW38 375 aa22.81■■□□□ 1.24
TRDMT1-211ENST00000495022 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
TRDMT1-211ENST00000495022 FZD10Q9ULW2 581 aa22.81■■□□□ 1.24
TRDMT1-211ENST00000495022 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa22.8■■□□□ 1.24
TRDMT1-211ENST00000495022 LGALS16A8MUM7 142 aa22.8■■□□□ 1.24
TRDMT1-211ENST00000495022 RASA4BC9J798 803 aa22.8■■□□□ 1.24
TRDMT1-211ENST00000495022 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
TRDMT1-211ENST00000495022 RASA4O43374 803 aa22.8■■□□□ 1.24
TRDMT1-211ENST00000495022 PRB1P04280 392 aa22.8■■□□□ 1.24
TRDMT1-211ENST00000495022 ELP6Q0PNE2 266 aa22.8■■□□□ 1.24
TRDMT1-211ENST00000495022 GRM3Q14832 879 aa22.8■■□□□ 1.24
TRDMT1-211ENST00000495022 KLHL40Q2TBA0 621 aa22.8■■□□□ 1.24
TRDMT1-211ENST00000495022 SCYL2Q6P3W7 929 aa22.8■■□□□ 1.24
TRDMT1-211ENST00000495022 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
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