RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477812.1

ACTB-210, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 2

Gene ACTB, Length 820 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-210ENST00000477812 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
ACTB-210ENST00000477812 ZSWIM9Q86XI8 627 aa20.15■□□□□ 0.82
ACTB-210ENST00000477812 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP20.15■□□□□ 0.82
ACTB-210ENST00000477812 SPATA22Q8NHS9 363 aa20.15■□□□□ 0.82
ACTB-210ENST00000477812 TUBB2BQ9BVA1 445 aa20.15■□□□□ 0.82
ACTB-210ENST00000477812 SUV39H2Q9H5I1 410 aa20.15■□□□□ 0.82
ACTB-210ENST00000477812 DKK3Q9UBP4 350 aa20.15■□□□□ 0.82
ACTB-210ENST00000477812 PCYOX1Q9UHG3 505 aa20.15■□□□□ 0.82
ACTB-210ENST00000477812 RSPH14Q9UHP6 348 aa20.15■□□□□ 0.82
ACTB-210ENST00000477812 SCML1Q9UN30 329 aa20.15■□□□□ 0.82
ACTB-210ENST00000477812 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa20.15■□□□□ 0.82
ACTB-210ENST00000477812 ANKRD36A6QL64 1941 aa20.14■□□□□ 0.81
ACTB-210ENST00000477812 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
ACTB-210ENST00000477812 FZD6O60353 706 aa20.14■□□□□ 0.81
ACTB-210ENST00000477812 METTL18O95568 372 aa20.14■□□□□ 0.81
ACTB-210ENST00000477812 IFNB1P01574 187 aa20.14■□□□□ 0.81
ACTB-210ENST00000477812 SERPINF2P08697 491 aa20.14■□□□□ 0.81
ACTB-210ENST00000477812 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa20.14■□□□□ 0.81
ACTB-210ENST00000477812 PSMB4P28070 264 aa20.14■□□□□ 0.81
ACTB-210ENST00000477812 SERPINA4P29622 427 aa20.14■□□□□ 0.81
ACTB-210ENST00000477812 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
ACTB-210ENST00000477812 KDELC1Q6UW63 502 aa20.14■□□□□ 0.81
ACTB-210ENST00000477812 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
ACTB-210ENST00000477812 KLHL32Q96NJ5 620 aa20.14■□□□□ 0.81
ACTB-210ENST00000477812 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP20.14■□□□□ 0.812e-13■□□□□ 10.2
ACTB-210ENST00000477812 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
ACTB-210ENST00000477812 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
ACTB-210ENST00000477812 HDAC8Q9BY41 377 aa20.14■□□□□ 0.81
ACTB-210ENST00000477812 ITM2CQ9NQX7 267 aa20.14■□□□□ 0.81
ACTB-210ENST00000477812 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP20.14■□□□□ 0.81
ACTB-210ENST00000477812 F5H423 210 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
ACTB-210ENST00000477812 PLK4O00444 970 aa20.13■□□□□ 0.81
ACTB-210ENST00000477812 AXIN1O15169 862 aa20.13■□□□□ 0.81
ACTB-210ENST00000477812 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
ACTB-210ENST00000477812 PRLP01236 227 aa20.13■□□□□ 0.81
ACTB-210ENST00000477812 DNTTP04053 509 aa20.13■□□□□ 0.81
ACTB-210ENST00000477812 RPL22P35268 128 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
ACTB-210ENST00000477812 PTGIRP43119 386 aa20.13■□□□□ 0.81
ACTB-210ENST00000477812 TPMTP51580 245 aa20.13■□□□□ 0.81
ACTB-210ENST00000477812 LMNB2Q03252 620 aa20.13■□□□□ 0.81
ACTB-210ENST00000477812 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
ACTB-210ENST00000477812 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
ACTB-210ENST00000477812 BCL2L1Q07817 233 aa20.13■□□□□ 0.81
ACTB-210ENST00000477812 CNTN1Q12860 1018 aa20.13■□□□□ 0.81
ACTB-210ENST00000477812 ANGPT1Q15389 498 aa20.13■□□□□ 0.81
ACTB-210ENST00000477812 PARP6Q2NL67 630 aa20.13■□□□□ 0.81
ACTB-210ENST00000477812 ZNF528Q3MIS6 628 aa20.13■□□□□ 0.81
ACTB-210ENST00000477812 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa20.13■□□□□ 0.81
ACTB-210ENST00000477812 AGBL4Q5VU57 503 aa20.13■□□□□ 0.81
ACTB-210ENST00000477812 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa20.13■□□□□ 0.81
ACTB-210ENST00000477812 USP30Q70CQ3 517 aa20.13■□□□□ 0.81
ACTB-210ENST00000477812 CCDC89Q8N998 374 aa20.13■□□□□ 0.81
ACTB-210ENST00000477812 HCAR2Q8TDS4 363 aa20.13■□□□□ 0.81
ACTB-210ENST00000477812 TRIB3Q96RU7 358 aa20.13■□□□□ 0.81
ACTB-210ENST00000477812 TPSD1Q9BZJ3 242 aa20.13■□□□□ 0.81
ACTB-210ENST00000477812 PCDH9Q9HC56 1237 aa20.13■□□□□ 0.81
ACTB-210ENST00000477812 RAI2Q9Y5P3 530 aa20.13■□□□□ 0.81
ACTB-210ENST00000477812 EML5Q05BV3 1969 aa20.12■□□□□ 0.81
ACTB-210ENST00000477812 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa20.12■□□□□ 0.81
ACTB-210ENST00000477812 A0A1W2PP55 124 aa20.12■□□□□ 0.81
ACTB-210ENST00000477812 C16orf96A6NNT2 1141 aa20.12■□□□□ 0.81
ACTB-210ENST00000477812 SPINT1O43278 529 aa20.12■□□□□ 0.81
ACTB-210ENST00000477812 PGLSO95336 258 aa20.12■□□□□ 0.81
ACTB-210ENST00000477812 P2RY2P41231 377 aa20.12■□□□□ 0.81
ACTB-210ENST00000477812 FNTBP49356 437 aa20.12■□□□□ 0.81
ACTB-210ENST00000477812 MAP7D1Q3KQU3 841 aa20.12■□□□□ 0.81
ACTB-210ENST00000477812 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
ACTB-210ENST00000477812 WDR5BQ86VZ2 330 aa20.12■□□□□ 0.81
ACTB-210ENST00000477812 KLHL7Q8IXQ5 586 aa20.12■□□□□ 0.81
ACTB-210ENST00000477812 PGBD3Q8N328 593 aa20.12■□□□□ 0.81
ACTB-210ENST00000477812 PPP1R16AQ96I34 528 aa20.12■□□□□ 0.81
ACTB-210ENST00000477812 VPS45Q9NRW7 570 aa20.12■□□□□ 0.81
ACTB-210ENST00000477812 FBXL12Q9NXK8 326 aa20.12■□□□□ 0.81
ACTB-210ENST00000477812 PAK5Q9P286 719 aa20.12■□□□□ 0.81
ACTB-210ENST00000477812 FAM153AQ9UHL3 310 aa20.12■□□□□ 0.81
ACTB-210ENST00000477812 FZD4Q9ULV1 537 aa20.12■□□□□ 0.81
ACTB-210ENST00000477812 CACNA1HO95180 2353 aa20.12■□□□□ 0.81
ACTB-210ENST00000477812 WDFY4Q6ZS81 3184 aa20.11■□□□□ 0.81
ACTB-210ENST00000477812 C10orf142B7Z368 130 aa20.11■□□□□ 0.81
ACTB-210ENST00000477812 PDHA1P08559 390 aa20.11■□□□□ 0.81
ACTB-210ENST00000477812 SP9P0CG40 484 aa20.11■□□□□ 0.81
ACTB-210ENST00000477812 TIMP2P16035 220 aa20.11■□□□□ 0.81
ACTB-210ENST00000477812 TAS2R38P59533 333 aa20.11■□□□□ 0.81
ACTB-210ENST00000477812 C2orf54Q08AI8 447 aa20.11■□□□□ 0.81
ACTB-210ENST00000477812 KCTD11Q693B1 232 aa20.11■□□□□ 0.81
ACTB-210ENST00000477812 BRAT1Q6PJG6 821 aa20.11■□□□□ 0.81
ACTB-210ENST00000477812 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
ACTB-210ENST00000477812 GSTA5Q7RTV2 222 aa20.11■□□□□ 0.81
ACTB-210ENST00000477812 HDDC3Q8N4P3 179 aa20.11■□□□□ 0.81
ACTB-210ENST00000477812 MRGPRX2Q96LB1 330 aa20.11■□□□□ 0.81
ACTB-210ENST00000477812 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
ACTB-210ENST00000477812 UBP1Q9NZI7 540 aa20.11■□□□□ 0.81
ACTB-210ENST00000477812 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa20.1■□□□□ 0.81
ACTB-210ENST00000477812 SLC7A4O43246 635 aa20.1■□□□□ 0.81
ACTB-210ENST00000477812 ZNF217O75362 1048 aa20.1■□□□□ 0.81
ACTB-210ENST00000477812 PMPCBO75439 489 aa20.1■□□□□ 0.81
ACTB-210ENST00000477812 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
ACTB-210ENST00000477812 ANXA9O76027 345 aa20.1■□□□□ 0.81
ACTB-210ENST00000477812 ECEL1O95672 775 aa20.1■□□□□ 0.81
ACTB-210ENST00000477812 ACADMP11310 421 aa20.1■□□□□ 0.81
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