RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472027.1

SYN3-211, Transcript of synapsin III, humanhuman

TSL 4

Gene SYN3, Length 595 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN3-211ENST00000472027 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa9.25□□□□□ -0.93
SYN3-211ENST00000472027 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
SYN3-211ENST00000472027 IGLON5A6NGN9 336 aa9.25□□□□□ -0.93
SYN3-211ENST00000472027 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
SYN3-211ENST00000472027 AREL1O15033 823 aa9.25□□□□□ -0.93
SYN3-211ENST00000472027 SPINT1O43278 529 aa9.25□□□□□ -0.93
SYN3-211ENST00000472027 MFSD11O43934 449 aa9.25□□□□□ -0.93
SYN3-211ENST00000472027 DFNA5O60443 496 aa9.25□□□□□ -0.93
SYN3-211ENST00000472027 MAGEC1O60732 1142 aa9.25□□□□□ -0.93
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SYN3-211ENST00000472027 CDC25BP30305 580 aa9.25□□□□□ -0.93
SYN3-211ENST00000472027 AKT2P31751 481 aa9.25□□□□□ -0.93
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SYN3-211ENST00000472027 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
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SYN3-211ENST00000472027 IQCHQ86VS3 1027 aa9.25□□□□□ -0.93
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SYN3-211ENST00000472027 BBS5Q8N3I7 341 aa9.25□□□□□ -0.93
SYN3-211ENST00000472027 PGBD5Q8N414 524 aa9.25□□□□□ -0.93
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SYN3-211ENST00000472027 TMEM145Q8NBT3 493 aa9.25□□□□□ -0.93
SYN3-211ENST00000472027 NSMCE1Q8WV22 266 aa9.25□□□□□ -0.93
SYN3-211ENST00000472027 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
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SYN3-211ENST00000472027 BMFQ96LC9 184 aa9.25□□□□□ -0.93
SYN3-211ENST00000472027 NSMCE3Q96MG7 304 aa9.25□□□□□ -0.93
SYN3-211ENST00000472027 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
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SYN3-211ENST00000472027 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
SYN3-211ENST00000472027 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa9.25□□□□□ -0.93
SYN3-211ENST00000472027 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
SYN3-211ENST00000472027 GDF3Q9NR23 364 aa9.25□□□□□ -0.93
SYN3-211ENST00000472027 IMPACTQ9P2X3 320 aa9.25□□□□□ -0.93
SYN3-211ENST00000472027 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa9.25□□□□□ -0.93
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SYN3-211ENST00000472027 ALG6Q9Y672 507 aa9.25□□□□□ -0.93
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SYN3-211ENST00000472027 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa9.24□□□□□ -0.93
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SYN3-211ENST00000472027 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
SYN3-211ENST00000472027 RAD51BO15315 384 aa9.24□□□□□ -0.93
SYN3-211ENST00000472027 SPOPO43791 374 aa9.24□□□□□ -0.93
SYN3-211ENST00000472027 MMP20O60882 483 aa9.24□□□□□ -0.93
SYN3-211ENST00000472027 TM7SF2O76062 418 aa9.24□□□□□ -0.93
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SYN3-211ENST00000472027 THEGLP0DJG4 465 aa9.24□□□□□ -0.93
SYN3-211ENST00000472027 CR2P20023 1033 aa9.24□□□□□ -0.93
SYN3-211ENST00000472027 CCNCP24863 283 aa9.24□□□□□ -0.93
SYN3-211ENST00000472027 SERPINA4P29622 427 aa9.24□□□□□ -0.93
SYN3-211ENST00000472027 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
SYN3-211ENST00000472027 MMP13P45452 471 aa9.24□□□□□ -0.93
SYN3-211ENST00000472027 SUOXP51687 545 aa9.24□□□□□ -0.93
SYN3-211ENST00000472027 MAXP61244 160 aa9.24□□□□□ -0.93
SYN3-211ENST00000472027 AP1S1P61966 158 aa9.24□□□□□ -0.93
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SYN3-211ENST00000472027 IL9RQ01113 521 aa9.24□□□□□ -0.93
SYN3-211ENST00000472027 GBE1Q04446 702 aa9.24□□□□□ -0.93
SYN3-211ENST00000472027 ELP6Q0PNE2 266 aa9.24□□□□□ -0.93
SYN3-211ENST00000472027 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
SYN3-211ENST00000472027 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
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SYN3-211ENST00000472027 TMEM52BQ4KMG9 183 aa9.24□□□□□ -0.93
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SYN3-211ENST00000472027 CFAP58Q5T655 872 aa9.24□□□□□ -0.93
SYN3-211ENST00000472027 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
SYN3-211ENST00000472027 BRAT1Q6PJG6 821 aa9.24□□□□□ -0.93
SYN3-211ENST00000472027 ZSWIM9Q86XI8 627 aa9.24□□□□□ -0.93
SYN3-211ENST00000472027 NAXDQ8IW45 347 aa9.24□□□□□ -0.93
SYN3-211ENST00000472027 TEX26Q8N6G2 289 aa9.24□□□□□ -0.93
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SYN3-211ENST00000472027 CXorf40AQ8TE69 158 aa9.24□□□□□ -0.93
SYN3-211ENST00000472027 RHBDD1Q8TEB9 315 aa9.24□□□□□ -0.93
SYN3-211ENST00000472027 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
SYN3-211ENST00000472027 LRRN4Q8WUT4 740 aa9.24□□□□□ -0.93
SYN3-211ENST00000472027 ASB12Q8WXK4 309 aa9.24□□□□□ -0.93
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