RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460778.1

RPL23AP56-201, Transcript of ribosomal protein L23a pseudogene 56, humanhuman

BASIC

Gene RPL23AP56, Length 453 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23AP56-201ENST00000460778 TCP1P17987 556 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
RPL23AP56-201ENST00000460778 NFKB1P19838 968 aa4.96□□□□□ -1.62
RPL23AP56-201ENST00000460778 IVDP26440 423 aa4.96□□□□□ -1.62
RPL23AP56-201ENST00000460778 STIP1P31948 543 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
RPL23AP56-201ENST00000460778 ACSL1P33121 698 aa4.96□□□□□ -1.62
RPL23AP56-201ENST00000460778 RPL22P35268 128 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
RPL23AP56-201ENST00000460778 COILP38432 576 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
RPL23AP56-201ENST00000460778 MAGEA9P43362 315 aa4.96□□□□□ -1.62
RPL23AP56-201ENST00000460778 CCR3P51677 355 aa4.96□□□□□ -1.62
RPL23AP56-201ENST00000460778 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
RPL23AP56-201ENST00000460778 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
RPL23AP56-201ENST00000460778 SKOR1P84550 965 aa4.96□□□□□ -1.62
RPL23AP56-201ENST00000460778 SEMG2Q02383 582 aa4.96□□□□□ -1.62
RPL23AP56-201ENST00000460778 ITKQ08881 620 aa4.96□□□□□ -1.62
RPL23AP56-201ENST00000460778 CNTN1Q12860 1018 aa4.96□□□□□ -1.62
RPL23AP56-201ENST00000460778 TCF15Q12870 199 aa4.96□□□□□ -1.62
RPL23AP56-201ENST00000460778 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
RPL23AP56-201ENST00000460778 OLIG2Q13516 323 aa4.96□□□□□ -1.62
RPL23AP56-201ENST00000460778 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
RPL23AP56-201ENST00000460778 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
RPL23AP56-201ENST00000460778 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
RPL23AP56-201ENST00000460778 ANGPT1Q15389 498 aa4.96□□□□□ -1.62
RPL23AP56-201ENST00000460778 CST6Q15828 149 aa4.96□□□□□ -1.62
RPL23AP56-201ENST00000460778 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa4.96□□□□□ -1.62
RPL23AP56-201ENST00000460778 SEL1L2Q5TEA6 688 aa4.96□□□□□ -1.62
RPL23AP56-201ENST00000460778 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa4.96□□□□□ -1.62
RPL23AP56-201ENST00000460778 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa4.96□□□□□ -1.62
RPL23AP56-201ENST00000460778 DENND5AQ6IQ26 1287 aa4.96□□□□□ -1.62
RPL23AP56-201ENST00000460778 ANO7Q6IWH7 933 aa4.96□□□□□ -1.62
RPL23AP56-201ENST00000460778 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
RPL23AP56-201ENST00000460778 KDELC1Q6UW63 502 aa4.96□□□□□ -1.62
RPL23AP56-201ENST00000460778 GDPD4Q6W3E5 623 aa4.96□□□□□ -1.62
RPL23AP56-201ENST00000460778 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
RPL23AP56-201ENST00000460778 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
RPL23AP56-201ENST00000460778 PID1Q7Z2X4 250 aa4.96□□□□□ -1.62
RPL23AP56-201ENST00000460778 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
RPL23AP56-201ENST00000460778 KDELC2Q7Z4H8 507 aa4.96□□□□□ -1.62
RPL23AP56-201ENST00000460778 CACUL1Q86Y37 369 aa4.96□□□□□ -1.62
RPL23AP56-201ENST00000460778 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa4.96□□□□□ -1.62
RPL23AP56-201ENST00000460778 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
RPL23AP56-201ENST00000460778 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
RPL23AP56-201ENST00000460778 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
RPL23AP56-201ENST00000460778 ZBTB44Q8NCP5 570 aa4.96□□□□□ -1.62
RPL23AP56-201ENST00000460778 PRSS33Q8NF86 280 aa4.96□□□□□ -1.62
RPL23AP56-201ENST00000460778 CCDC26Q8TAB7 109 aa4.96□□□□□ -1.62
RPL23AP56-201ENST00000460778 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa4.96□□□□□ -1.62
RPL23AP56-201ENST00000460778 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa4.96□□□□□ -1.62
RPL23AP56-201ENST00000460778 PIH1D2Q8WWB5 315 aa4.96□□□□□ -1.62
RPL23AP56-201ENST00000460778 OR8D1Q8WZ84 308 aa4.96□□□□□ -1.62
RPL23AP56-201ENST00000460778 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
RPL23AP56-201ENST00000460778 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
RPL23AP56-201ENST00000460778 FAM131CQ96AQ9 280 aa4.96□□□□□ -1.62
RPL23AP56-201ENST00000460778 ECHDC3Q96DC8 303 aa4.96□□□□□ -1.62
RPL23AP56-201ENST00000460778 RTP4Q96DX8 246 aa4.96□□□□□ -1.62
RPL23AP56-201ENST00000460778 SIPA1Q96FS4 1042 aa4.96□□□□□ -1.62
RPL23AP56-201ENST00000460778 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
RPL23AP56-201ENST00000460778 KLHL32Q96NJ5 620 aa4.96□□□□□ -1.62
RPL23AP56-201ENST00000460778 NUDCD1Q96RS6 583 aa4.96□□□□□ -1.62
RPL23AP56-201ENST00000460778 TRIB3Q96RU7 358 aa4.96□□□□□ -1.62
RPL23AP56-201ENST00000460778 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP4.96□□□□□ -1.62
RPL23AP56-201ENST00000460778 HINFPQ9BQA5 517 aa4.96□□□□□ -1.62
RPL23AP56-201ENST00000460778 MGME1Q9BQP7 344 aa4.96□□□□□ -1.62
RPL23AP56-201ENST00000460778 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
RPL23AP56-201ENST00000460778 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa4.96□□□□□ -1.62
RPL23AP56-201ENST00000460778 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa4.96□□□□□ -1.62
RPL23AP56-201ENST00000460778 TPSD1Q9BZJ3 242 aa4.96□□□□□ -1.62
RPL23AP56-201ENST00000460778 SLC25A51Q9H1U9 297 aa4.96□□□□□ -1.62
RPL23AP56-201ENST00000460778 SUV39H2Q9H5I1 410 aa4.96□□□□□ -1.62
RPL23AP56-201ENST00000460778 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa4.96□□□□□ -1.62
RPL23AP56-201ENST00000460778 UBP1Q9NZI7 540 aa4.96□□□□□ -1.62
RPL23AP56-201ENST00000460778 IL36AQ9UHA7 158 aa4.96□□□□□ -1.62
RPL23AP56-201ENST00000460778 AMACRQ9UHK6 382 aa4.96□□□□□ -1.62
RPL23AP56-201ENST00000460778 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa4.96□□□□□ -1.62
RPL23AP56-201ENST00000460778 CDC23Q9UJX2 597 aa4.96□□□□□ -1.62
RPL23AP56-201ENST00000460778 FBXO4Q9UKT5 387 aa4.96□□□□□ -1.62
RPL23AP56-201ENST00000460778 SLC8A2Q9UPR5 921 aa4.96□□□□□ -1.62
RPL23AP56-201ENST00000460778 ZNF148Q9UQR1 794 aa4.96□□□□□ -1.62
RPL23AP56-201ENST00000460778 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa4.96□□□□□ -1.62
RPL23AP56-201ENST00000460778 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa4.96□□□□□ -1.62
RPL23AP56-201ENST00000460778 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
RPL23AP56-201ENST00000460778 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
RPL23AP56-201ENST00000460778 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa4.95□□□□□ -1.62
RPL23AP56-201ENST00000460778 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa4.95□□□□□ -1.62
RPL23AP56-201ENST00000460778 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa4.95□□□□□ -1.62
RPL23AP56-201ENST00000460778 A0A1W2PP55 124 aa4.95□□□□□ -1.62
RPL23AP56-201ENST00000460778 A8MX80 341 aa4.95□□□□□ -1.62
RPL23AP56-201ENST00000460778 ESPNB1AK53 854 aa4.95□□□□□ -1.62
RPL23AP56-201ENST00000460778 H0Y858 1186 aa4.95□□□□□ -1.62
RPL23AP56-201ENST00000460778 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
RPL23AP56-201ENST00000460778 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
RPL23AP56-201ENST00000460778 AREL1O15033 823 aa4.95□□□□□ -1.62
RPL23AP56-201ENST00000460778 AXIN1O15169 862 aa4.95□□□□□ -1.62
RPL23AP56-201ENST00000460778 ALOX15BO15296 676 aa4.95□□□□□ -1.62
RPL23AP56-201ENST00000460778 TP73O15350 636 aa4.95□□□□□ -1.62
RPL23AP56-201ENST00000460778 MTSS1O43312 755 aa4.95□□□□□ -1.62
RPL23AP56-201ENST00000460778 FZD6O60353 706 aa4.95□□□□□ -1.62
RPL23AP56-201ENST00000460778 PMPCBO75439 489 aa4.95□□□□□ -1.62
RPL23AP56-201ENST00000460778 URI1O94763 535 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
RPL23AP56-201ENST00000460778 IGSF6O95976 241 aa4.95□□□□□ -1.62
RPL23AP56-201ENST00000460778 IGLV3-19P01714 112 aa4.95□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.3 ms