RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437111.1

SHQ1P1-201, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor pseudogene 1, humanhuman

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Gene SHQ1P1, Length 1,544 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1P1-201ENST00000437111 FOXO6A8MYZ6 492 aa6.4□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 E7ENQ6 273 aa6.4□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa6.4□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 IRAK2O43187 625 aa6.4□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 ITGA2BP08514 1039 aa6.4□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 CSH1P0DML2 217 aa6.4□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 CSH2P0DML3 217 aa6.4□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 MYL4P12829 197 aa6.4□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 BGNP21810 368 aa6.4□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 PTPN3P26045 913 aa6.4□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 MGAT1P26572 445 aa6.4□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 TARSP26639 723 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 PTPN4P29074 926 aa6.4□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 TYK2P29597 1187 aa6.4□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 RPS9P46781 194 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 POLD2P49005 469 aa6.4□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 GEMP55040 296 aa6.4□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP6.4□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 MTAPQ13126 283 aa6.4□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 FZD5Q13467 585 aa6.4□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 MTM1Q13496 603 aa6.4□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 PPP2R5DQ14738 602 aa6.4□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 CHI3L2Q15782 390 aa6.4□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 DNAL1Q4LDG9 190 aa6.4□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 WASHC2DQ5SRD0 308 aa6.4□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 FAM91A1Q658Y4 838 aa6.4□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 PDPK2PQ6A1A2 396 aa6.4□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 IL31Q6EBC2 164 aa6.4□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 PM20D1Q6GTS8 502 aa6.4□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 FAM171BQ6P995 826 aa6.4□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 PRR23BQ6ZRT6 265 aa6.4□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 PAQR9Q6ZVX9 377 aa6.4□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 ASRGL1Q7L266 308 aa6.4□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 CEP57Q86XR8 500 aa6.4□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 IGDCC3Q8IVU1 814 aa6.4□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 KIRREL3Q8IZU9 778 aa6.4□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 PYROXD2Q8N2H3 581 aa6.4□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 ARMC2Q8NEN0 867 aa6.4□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 GIMAP7Q8NHV1 300 aa6.4□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 RDH11Q8TC12 318 aa6.4□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 STMN2Q93045 179 aa6.4□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.39
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SHQ1P1-201ENST00000437111 SERAC1Q96JX3 654 aa6.4□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 SUSD3Q96L08 255 aa6.4□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 HAPLN3Q96S86 360 aa6.4□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 RBBP8Q99708 897 aa6.4□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 FSD1LQ9BXM9 530 aa6.4□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.39
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SHQ1P1-201ENST00000437111 SLC13A1Q9BZW2 595 aa6.4□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 CXCL16Q9H2A7 254 aa6.4□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 TBC1D13Q9NVG8 400 aa6.4□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 MOCS1Q9NZB8 636 aa6.4□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 OR12D3Q9UGF7 316 aa6.4□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 CHKBQ9Y259 395 aa6.4□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa6.4□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 STK38LQ9Y2H1 464 aa6.4□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa6.4□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 IGF2RP11717 2491 aa6.39□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 VWA8A3KMH1 1905 aa6.39□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa6.39□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 MYBPHLA2RUH7 354 aa6.39□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 CARNS1A5YM72 827 aa6.39□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 GOLGA8OA6NCC3 632 aa6.39□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 SHISA7A6NL88 538 aa6.39□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 TMEM114B3SHH9 223 aa6.39□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 GOLGA8NF8WBI6 632 aa6.39□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 TPP1O14773 563 aa6.39□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 SYN3O14994 580 aa6.39□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 TEX28O15482 410 aa6.39□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 RFPL1O75677 317 aa6.39□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 CIB2O75838 187 aa6.39□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 LRIG2O94898 1065 aa6.39□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 SERPINE1P05121 402 aa6.39□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 BPGMP07738 259 aa6.39□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 SPATA31D3P0C874 917 aa6.39□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 MYL2P10916 166 aa6.39□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 BDNFP23560 247 aa6.39□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 CCNCP24863 283 aa6.39□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 GRIK1P39086 918 aa6.39□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 LIMK1P53667 647 aa6.39□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 LIMK2P53671 638 aa6.39□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 NRLP54845 237 aa6.39□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 RING1Q06587 406 aa6.39□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 WASHC5Q12768 1159 aa6.39□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 SMARCB1Q12824 385 aa6.39□□□□□ -1.39
SHQ1P1-201ENST00000437111 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
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